Job Description P37339 Confidence 99.58% Date Thu Jan 5 11:55:20 GMT 2012 Rank 71 Aligned Residues 353 % Identity 12% Template c3lovA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:protoporphyrinogen oxidase; PDBTitle: crystal structure of putative protoporphyrinogen oxidase2 (yp_001813199.1) from exiguobacterium sp. 255-15 at 2.06 a resolution Resolution 2.06 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	F	V	I	I	G	G	G	I	I	G	M	S	T	A	M	Q	L	I	D	V	Y	P	D	A	R	I	A	L	L	E	K	E	S	A	P	A	C	H	Q	T	G	H	N	S	G	V	I	H	A	G	V	Y	Y	T	P	G	S	L	K	A	Q	F	C	L	A	G	N	R	A	T	K	A	F	C	D	Q	N	G	I
Query Conservation
Alig confidence																																																			.	.	.
Template Conservation																																																			.	.	.
Template Sequence		R	L	V	I	V	G	G	G	I	T	G	L	A	A	A	Y	Y	A	E	R	A	F	P	D	L	N	I	T	L	L	E	A	G	E	R	L	G	G	K	V	A	T	Y	R	E	D	G	F	T	.	.	.	I	E	R	G	P	D	S	Y	V	A	R	K	H	I	L	T	D	L	I	E	A	I	G	L	G	E	K	L
Template Known Secondary structure									B															T	T	S							S	S	S	S	S	B	T	T						S	T	T			.	.	.			S	S						T	T	S	T									T	T		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.	.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.				.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.
Query Sequence		R	Y	D	N	C	G	K	M	L	V	A	T	S	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	M	E	R	M	R	A	L	W	E	R	T	A	A	N	G	I	E	R	E	W	L	N	A	D	E	L	R	E	R	E	P	N	I	T	.
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.
Template Conservation
Template Sequence		V	R	N	N	T	S	Q	A	F	I	L	D	T	G	G	L	H	P	I	P	K	G	A	V	X	G	I	P	T	D	L	D	L	F	R	Q	T	T	L	L	T	E	E	E	K	Q	E	V	A	D	L	L	L	H	P	S	D	S	L	R	I	P	E	Q	D	I	P	L	G	E	Y	L	R	P	R	L	G	D	A	L
Template Known Secondary structure														T	T							S	S			T	T			S						T	T		S	S	S														S			T	T					S	S			B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
																																																	133	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	G	G	I	F	V	P	S	S	G	I	V	S	Y	R	D	V	T	A	A	M	A	K	I	F	Q	S	R	G	G	E	I
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.															.	.
Template Conservation																																																												.	.	.															.	.
Template Sequence		V	E	K	L	I	E	P	L	L	S	G	I	Y	A	G	N	I	D	Q	X	S	T	F	A	T	Y	P	Q	F	V	A	N	E	Q	K	A	G	S	L	F	E	G	X	R	L	X	R	P	T	G	Q	F	L	S	L	E	T	G	.	.	.	L	E	S	L	I	E	R	L	E	E	V	L	E	R	.	.	S	E	I
Template Known Secondary structure					T							G	G	G				T	T	T	S	B	S	T	T	T												S	S								T					S					T	T		.	.	.													S	S	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																												.	.	.															.	.
Template SS confidence
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.				220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.			.	.	.
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.						.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.	.	.
Query Sequence		I	Y	N	A	E	V	S	G	L	N	E	H	K	N	G	V	V	I	R	T	R	Q	G	G	E	Y	E	A	S	T	L	I	S	C	S	G	L	M	A	D	R	L	V	K	M	L	G	L	E	P	G	.	.	.	.	.	F	I	I	C	P	F	R	G	E	Y	F	R	L	A	P	E	H	N	Q	I	V	N	H	L
Query Conservation																																																					.	.	.	.	.
Alig confidence																		.																			.	.															.	.	.	.	.
Template Conservation																		.																			.	.
Template Sequence		R	L	E	T	P	L	L	A	I	S	R	E	D	G	R	Y	.	R	L	K	T	D	H	G	P	E	Y	A	D	Y	V	L	L	T	I	.	.	P	H	P	Q	V	V	Q	L	L	P	D	A	H	L	P	E	L	E	Q	L	T	T	H	S	T	A	T	V	T	X	I	F	D	Q	Q	Q	S	L	P	I	E	G	T
Template Known Secondary structure			S	S										T	T			.					T	T						S						S	.	.										T	T	S							T																	S	S		S	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																		.																			.	.
Template SS confidence
		251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.		.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.			.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	Y	P	I	P	D	P	A	M	P	F	L	G	V	H	L	T	R	M	I	D	G	S	V	T	V	G	P	N	A	V	L	A	F	K	R	E	G	Y	R	K	R	D	F	S	F	S	D	T	L	E	I	L	G	S	S	G	I	R	R	V	L	Q	N	H	L	R	S	G	L	G	E	M	K	N	S	L	C	K	S
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	F	V	V	N	R	R	A	P	Y	S	I	T	A	C	T	A	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Q	K	W	N	H	S	A	P	D	H	T	V	L	R	A	F	V	G	R	P	G	N	D	H	L	V	H	E	S	D	E	V	L	Q	Q
Template Known Secondary structure							T	T	S	S		S								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	T		T	T										B	T	T	B		G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		328	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.			.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.					.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.		.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.																.	.	.	.																			.
Query SS confidence																				.	.																.	.	.	.																			.
Query Sequence		G	Y	L	R	L	V	Q	K	Y	C	P	R	L	S	L	S	D	L	.	.	Q	P	W	P	A	G	V	R	A	Q	A	V	S	P	D	.	.	.	.	G	K	L	I	D	D	F	L	F	V	T	T	P	R	T	I	H	T	.	C	N	A	P	S	P	A	A	T	S	A	I	P	I	G	A	H	I	V	S	K	V
Query Conservation																				.	.																.	.	.	.																			.
Alig confidence																				.	.										.						.	.	.	.																			.
Template Conservation																															.
Template Sequence		A	V	L	Q	D	L	E	K	I	C	G	R	T	L	E	P	K	Q	V	I	I	S	R	L	X	D	G	L	P	.	A	Y	T	V	G	H	A	D	R	I	Q	R	V	R	E	E	V	L	A	Q	Y	P	G	I	Y	L	A	G	L	A	Y	D	G	V	G	L	P	D	C	V	A	S	A	K	T	X	I	E	S	I
Template Known Secondary structure												S	S					S													.				T	T																S	T	T					S	T	T	T	S		S	S
Template Predicted Secondary structure																															.
Template SS confidence
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410		.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460