Job Description P32721 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:50:44 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 470 % Identity 25% Template c2ygrD_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: D: PDB Molecule:uvrabc system protein a; PDBTitle: mycobacterium tuberculosis uvra Resolution 3.40 Å

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Show / Hide Conservation and Alignment quality

		21	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.			.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Query Sequence		L	K	S	V	N	L	T	V	Y	P	G	E	I	H	A	L	L	G	E	N	G	A	G	K	S	T	L	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	V	L	S	G	I	H	E	P	T	K	G	T	I	T	I	.	.	N	N	I	S	Y	N	K	L	D	H	K	L	A
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	R	S	V	D	L	D	L	P	R	D	A	L	I	V	F	T	G	L	S	G	S	G	K	S	S	L	A	F	D	T	I	F	A	E	G	Q	R	R	Y	V	E	S	L	S	A	Y	A	R	Q	F	L	G	Q	M	D	K	P	D	V	D	F	I	E	G	L	S	P	A	V	S	I	D	Q	K	S	T	N	R	N
Template Known Secondary structure				S							S	S	S							S	T	T	S	S						T	T	T											T	T	T		S						T	T	T	S						S				S									S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		15	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	Q	L	G	I	G	I	I	Y	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	R	S	T	V	G	T	I	T	E	V	Y	D	Y	L	R	L	L	Y	A	R	A	G	T	P	H	C	P	T	C	G	E	R	V	A	R	Q	T	P	Q	Q	I	V	D	Q	V	L	A	M	P	E	G	T	R	F	L	V	L	A	P	V	V	R	T	R	K	G	E	F	A	D	L	F	D	K	L	N	A	Q	G
Template Known Secondary structure		T	T		B					T	T												S	S	B		B		T	T	T			B		B														S	S			S	S							S	S	S	S	B		S		T									T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		95	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
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Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	S	R	V	R	V	D	G	V	V	H	P	L	T	D	P	P	R	A	R	R	Q	E	K	H	D	I	E	V	V	V	D	K	R	R	L	T	D	S	V	E	T	A	L	N	L	A	D	G	I	V	V	L	E	F	V	D	H	R	F	S	E	K	L	A	C	P	N	G	H	A	L	A	V	D	D	L	E	P	R
Template Known Secondary structure			S		B			S	S	S		B		T	T	S						T	T	S		B																						S	S	S													T	T	B	B		T	T					S		S				G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	F	S	F	N	S	P	Y	G	A	C	P	D	C	S	G	L	G	I	R	K	E	V	D	P	E	L	V	V	P	D	P	D	R	T	L	A	Q	G	A	V	A	P	W	S	N	G	H	T	A	E	Y	F	T	R	M	M	A	G	L	G	E	A	L	G	F	D	V	D	T	P	P	A	K	A	R	K	A	I	L
Template Known Secondary structure		G	G		T	T	S	T	T	T	B	B	T	T	B	S	S	S													S	S			S	S	S	S	S		S		S	T	T		S	S	T	T																S			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
																																																																													88	.	90	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	S	V	I
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	G	A	D	E	Q	V	H	V	R	Y	R	N	R	Y	G	R	T	R	S	Y	Y	A	D	F	E	G	V	L	A	F	L	Q	R	K	M	S	Q	T	E	S	E	Q	M	K	E	R	Y	E	G	F	M	R	D	V	P	C	P	V	C	A	G	T	R	L	K	P	E	I	L	A	V	T	L	K	S	I	A	E	V
Template Known Secondary structure		T				S									S	S	S																								S		T	T							T	T							T	T	T	T	T	S		B						T		B			G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		356	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.
		93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.		.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.			.	.	.
Predicted Secondary structure																													.																				.																												.	.
Query SS confidence																													.																				.																												.	.
Query Sequence		D	E	L	T	V	L	E	N	L	Y	I	G	R	H	L	T	K	K	I	C	G	V	N	I	I	D	W	.	R	E	M	R	V	R	A	A	M	M	L	L	R	V	G	L	K	V	D	.	L	D	E	K	V	A	N	L	S	I	S	H	K	Q	M	L	E	I	A	K	T	L	M	L	D	A	K	.	.	V	I	I
Query Conservation																													.																				.																												.	.
Alig confidence																													.																				.																												.	.
Template Conservation
Template Sequence		C	E	L	S	I	A	D	C	A	D	F	L	N	A	L	T	L	G	P	R	E	Q	A	I	A	G	Q	V	L	K	E	I	R	S	R	L	G	F	L	L	D	V	G	L	E	Y	L	S	L	S	R	A	A	A	T	L	S	G	G	E	A	Q	R	I	R	L	A	T	Q	I	G	S	G	L	V	G	V	L	Y	V
Template Known Secondary structure									T	T										T	T					S																	T	T		T	T	S		T	T	S	B	G	G	G																T	T				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		446	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.							.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																				.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	D	E	P	T	S	S	L	T	N	K	E	V	D	Y	L	F	L	I	M	N	Q	L	R	K	E	G	T	A	I	V	Y	I	S	H	K	L	A	E	I	R	R	I	C	D	R	Y	T	V	M	.	.	.	.	.	.	K	D	G	S	S	V	C	S	G	I	V	S	D	V	S	N	D	D	I	V	R	L	M	V
Query Conservation																																																				.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																											.									.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.
Template Sequence		L	D	E	P	S	I	G	L	H	Q	R	D	N	R	R	L	I	E	T	L	T	R	L	R	D	L	G	N	T	L	I	V	V	E	H	D	E	D	T	I	E	.	H	A	D	W	I	V	D	I	G	P	G	A	G	E	H	G	G	R	I	V	H	S	G	P	Y	D	E	L	L	R	N	K	D	S	I	T	G	A
Template Known Secondary structure					T	T	T	T																											B								.	T		S						S	S	S	S	G	G	G			S														S	S
Template Predicted Secondary structure																																											.
Template SS confidence
		526	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.		.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.			.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
Predicted Secondary structure																																																																			.	.
Query SS confidence																																																																			.	.
Query Sequence		G	R	E	L	Q	N	R	F	N	A	M	K	E	N	V	S	N	L	A	H	E	T	V	F	E	V	R	N	V	T	S	R	D	R	K	K	V	R	D	I	S	F	S	V	C	R	G	E	I	L	G	F	A	G	L	V	G	S	G	R	T	E	L	M	N	.	.	C	L	F	G	V	D	K	R	A	G	G	E	I
Query Conservation																																																																			.	.
Alig confidence																					.														.	.	.																														.	.
Template Conservation																					.														.	.	.
Template Sequence		Y	L	S	G	R	E	S	I	E	I	P	A	I	R	R	S	V	D	P	.	R	R	Q	L	T	V	V	G	A	R	E	H	N	.	.	.	L	R	G	I	D	V	S	F	P	L	G	V	L	T	S	V	T	G	V	S	G	S	G	K	S	T	L	V	N	D	I	L	A	A	V	L	A	N	R	L	N	G	A	R
Template Known Secondary structure					T	S							S	S						T	.	T	S									S	T	T	.	.	.			S							S	S	S							S	T	T	S	S								T									T	S
Template Predicted Secondary structure																					.														.	.	.
Template SS confidence
		605	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.		.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.				.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	L	N	G	K	D	I	S	P	R	S	P	L	D	A	V	K	K	G	M	A	Y	I	T	E	S	R	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.
Template Sequence		Q	V	P	G	R	H	T	R	V	T	G	L	.	.	D	Y	L	D	K	L	V	R	I	D	Q	S	P	I	G	R	T	P	R	S	N	P	A	T	Y	T	G	V	F	D	K	I	R	T	L	F	A	A	T	N	E	A	K	V	R	G	Y	K	P	G	R	F	S	F	N	V	K	G	G	R	C	E	A	C	T	G
Template Known Secondary structure						S	S						G	.	.	G	G										S		S		S	S	T	T		S						T											T	S					T	T	T			G	G	G	S		T	T	S	T	T	T	B		S	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure														.	.
Template SS confidence
		681	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.			.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.
								349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	D	N	G	F	F	P	N	F	S	I	A	Q	N	M	A	I	S	R	S	L	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	G	Y	K	G	A	M	G	L	F	H	E	V	D	E	Q	R	T	A	E	N	Q	R	E	L	L	A	L	K	C	H	S	V	N	Q
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	G	T	I	K	I	E	M	N	F	L	P	D	V	Y	V	P	C	E	V	C	Q	G	A	R	Y	N	R	E	T	L	E	V	H	Y	K	G	K	T	V	S	E	V	L	D	M	S	I	E	E	A	A	E	F	F	E	P	I	A	G	V	H	R	Y	L	R	T	L	V	D	V	G	L	G	Y	V	R	L	G	Q
Template Known Secondary structure		S	S							S	S	S								T	T	T	T	S		S	B						T			B	T	T	B							T	S	B								S	T	T														S	S		S	S	S	B	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		759	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.
		406	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.				.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.
Query Sequence		N	I	T	E	L	S	G	G	N	Q	Q	K	V	L	I	S	K	W	L	C	C	C	.	.	.	P	E	V	I	I	F	D	E	P	T	R	G	I	D	V	G	A	K	A	E	I	Y	K	V	M	R	Q	L	A	D	D	G	K	V	I	L	M	V	S	S	E	L	P	E	I	I	T	V	C	D	R	I	A	V	F
Query Conservation																								.	.	.
Alig confidence																								.	.	.																																																.
Template Conservation																																																																										.
Template Sequence		P	A	P	T	L	S	G	G	E	A	Q	R	V	K	L	A	S	E	L	Q	K	R	S	T	G	R	T	V	Y	I	L	D	E	P	T	T	G	L	H	F	D	D	I	R	K	L	L	N	V	I	N	G	L	V	D	K	G	N	T	V	I	V	I	E	H	N	L	D	V	I	K	T	.	S	D	W	I	I	D	L
Template Known Secondary structure			G	G	G	S														S	S	S				S	S							S	S	S	T	T																				T																.		S
Template Predicted Secondary structure																																																																										.
Template SS confidence
		839	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910		.	.	.	.	.	.	.
								483	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	C	E	G	R	L	T	Q	I	L	T	N	R	D	D	M	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	P	E	G	G	A	G	G	G	T	V	V	A	Q	G	T	P	E	D	V	A	A
Template Known Secondary structure			S	S	S	T	T	S		S						S						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		918	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.