Job Description P31456 Confidence 99.54% Date Thu Jan 5 11:47:48 GMT 2012 Rank 64 Aligned Residues 297 % Identity 16% Template c2vvlD_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: D: PDB Molecule:monoamine oxidase n; PDBTitle: the structure of mao-n-d3, a variant of monoamine oxidase2 from aspergillus niger. Resolution 2.45 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.		.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50												.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	E	H	F	D	V	A	I	I	G	L	G	P	A	G	S	A	L	A	R	K	L	A	G	.	K	M	Q	V	I	A	L	D	K	K	H	Q	C	G	T	E	G	F	S	K	P	C	G	G	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	P	D	A	Q	R	S	F	I	R	D	G	L	T	L	P	V	D
Query Conservation																										.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	E	P	W	D	V	I	V	I	G	G	G	Y	C	G	L	T	A	T	R	D	L	T	V	A	G	F	K	T	L	L	L	E	A	R	D	R	I	G	G	R	S	W	S	S	N	I	D	G	Y	P	Y	E	M	G	G	T	W	V	H	W	H	Q	S	H	V	W	R	E	I	T	R	Y	K	M	H	N	A	L	S
Template Known Secondary structure													S													T	T								S	S	S	B	S		T	T							T	T						S				B		T	T	S										T	T		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		31	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110
		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	I	A	N	P	Q	I	F	S	V	K	T	V	D	V	A	A	S	L	T	R	N	Y	Q	R	S	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	S	F	N	F	S	R	G	V	N	H	F	Q	L	R	T	N	P	T	T	S	T	Y	M	T	H	E	A	E	D	E	L	L	R	S	A	L	H	K	F	T	N	V	D	G	T	N	G	R	T	V	L	P	F	P	H	D	M	F	Y	V	P	E	F	R	K	Y	D	E	M	S	Y	S	E	R	I	D	Q	I	R
Template Known Secondary structure			S				S	S	S										T	T																								S	S	S	S	T	T	T	T	T		S		T	T		T	T	S	S	G	G	G					T	S	B									G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		117	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.
																																																							96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.			.	.	.	.	.	.	120
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	N	I	N	R	H	A	F	D	L	W	M	K	S	L	I	P	A	.	.	S	V	E	V	Y	H	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	E	L	S	L	N	E	R	S	S	L	E	A	F	I	L	L	C	S	G	G	T	L	E	N	S	S	F	G	E	F	L	H	W	W	A	M	S	G	Y	T	Y	Q	G	C	M	D	C	L	M	S	Y	K	F	K	D	G	Q	S	A	F	A	R	R	F	W	E	E	A	A	G	T	G	R	L	G	Y	V	F	G
Template Known Secondary structure		G	G																		S	S		T	T	T	S	B											T	T	S	S										S				T	T																T	T						S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		197	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.
		121	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.													.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	L	C	R	K	I	W	R	E	D	D	K	W	H	V	I	F	R	A	D	G	W	E	Q	H	I	T	A	R	Y	L	V	G	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	N	S	M	V	R	R	H	L	Y	P	D	H	Q	I	R	K	Y	V	A	I	Q	Q	W	F	A	E	K	H	P	V	P
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.
Template Sequence		C	P	V	R	S	V	V	N	E	R	D	A	A	R	V	T	A	.	.	.	R	D	G	R	E	F	V	A	K	R	V	V	C	T	I	P	L	N	V	L	S	T	I	Q	F	S	P	A	L	S	T	E	R	I	S	A	M	Q	A	G	H	V	S	M	C	T	K	V	H	A	E	V	D	N	K	D	M	R	S	W
Template Known Secondary structure											S	S	S						.	.	.	T	T																			T	T	S				S																										S		G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.
Template SS confidence
		277	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.				.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
		189	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	Y	S	C	I	F	D	N	S	I	T	N	C	Y	S	W	S	I	S	K	D	G	Y	F	I	F	G	G	A	Y	P	M	K	D	G	Q	T	R	F	T	T	L	K	E	K	M	S	A	F	Q	F	Q	F	G	K	T	V	K	S	E	K	C	T	V	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	G	I	A	Y	P	F	N	K	L	C	Y	A	I	G	D	G	T	T	P	A	G	N	T	H	L	V	C	F	G	T	D	A	N	H	I	Q	P	D	E	D	V	R	E	T	L	K	A	V	G	Q	L	A	P	G	T	F	G	V	K	R	L	V	F	H	N	W	V	K	D	E	F	A	K	G	A	W	F	F	S
Template Known Secondary structure							S	S	S	S											T	T	S										G	G	G				T	T	T												T	S	T	T	S											S	S	S		T	T	T	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.
							255	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	P	S	R	W	Q	D	F	V	C	G	K	D	N	A	F	L	I	G	E	A	A	G	F	I	S	A	S	S	L	E	G	I	S	Y	A	L	D	S	T	D	I	L	R	S	V	L	L	K	Q
Query Conservation		.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																																.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.
Template Sequence		R	P	G	M	V	S	E	C	L	Q	G	L	R	E	K	H	G	G	V	V	F	A	N	S	D	W	A	L	G	W	R	S	F	I	D	G	.	.	.	A	I	E	E	G	T	R	A	A	R	V	V	L	E	E
Template Known Secondary structure			T	T											S			S	S						G	G	G		S	S	S	T	T	S				.	.	.												T
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.
Template SS confidence
		434	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.				470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.