Job Description P31456 Confidence 99.32% Date Thu Jan 5 11:47:48 GMT 2012 Rank 116 Aligned Residues 301 % Identity 17% Template c1f8sA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:l-amino acid oxidase; PDBTitle: crystal structure of l-amino acid oxidase from calloselasma2 rhodostoma, complexed with three molecules of o-aminobenzoate. Resolution 2.00 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.		.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.														.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	H	F	D	V	A	I	I	G	L	G	P	A	G	S	A	L	A	R	K	L	A	G	.	K	M	Q	V	I	A	L	D	K	K	H	Q	C	G	T	E	G	F	S	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	C	G	G	L	L	A	P	D	A	Q	R	S	F	I	R	D	G	L	T	L	P	V
Query Conservation																									.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	P	K	H	V	V	I	V	G	A	G	M	A	G	L	S	A	A	Y	V	L	A	G	A	G	H	Q	V	T	V	L	E	A	S	E	R	P	G	G	R	V	R	T	Y	R	N	E	E	A	G	W	Y	A	N	L	G	P	M	R	L	P	E	K	H	R	I	V	R	E	Y	I	R	K	F	D	L	R	L	N	E
Template Known Secondary structure		S										B													T	T								S	S	S	S	S	B	T	T							T	T	T	T					S	S						T	T											T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		32	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.
		68	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	V	I	A	N	P	Q	I	F	S	V	K	T	V	D	V	A	A	S	L	T	R	N	Y	Q	R	S	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	S	Q	E	N	D	N	A	W	Y	F	I	K	N	I	R	K	K	V	G	E	V	K	K	D	P	G	L	L	K	Y	P	V	K	P	S	E	A	G	K	S	A	G	Q	L	Y	E	E	S	L	G	K	V	V	E	E	L	K	R	T	N	C	S	Y	I	L	N	K	Y	D	T	Y	S	T	K	E	Y	L	I	K
Template Known Secondary structure				S			T	T	S					T	T												G	G	G	G						T	T	T	T	T											T										S									G	G	G	S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		112	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.
																																											96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.		.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	N	I	N	R	H	A	F	D	L	W	M	K	S	L	I	P	A	.	S	V	E	V	Y	H	D	S	L	C	R	K	I	W	R	E	D	D	K	W
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Template Conservation
Template Sequence		E	G	D	L	S	P	G	A	V	D	M	I	G	D	L	L	N	E	D	S	G	Y	Y	V	S	F	I	E	S	L	K	H	D	D	I	F	A	Y	E	K	R	F	D	E	I	V	D	G	M	D	K	L	P	T	A	M	Y	R	D	I	Q	D	K	V	H	F	N	A	Q	V	I	K	I	Q	Q	N	D	Q	K	V
Template Known Secondary structure		T	T														T	T		G	G	G	T	T	S	B												T	T								T	T		T	T										T	G	G	G			S	S										S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		192	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
		134	.	.	.	.	.	140	.	.	.		.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.													.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200
Predicted Secondary structure												.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	V	I	F	R	A	D	G	W	E	.	Q	H	I	T	A	R	Y	L	V	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	A	N	S	M	V	R	R	H	L	Y	P	D	H	Q	I	R	K	Y	V	A	I	Q	Q	W	F	A	E	K	H	P	V	P	F	Y	S	C	I	F	D	N	S	I	T	N
Query Conservation												.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	V	V	Y	E	T	L	S	K	E	T	P	S	V	T	A	D	Y	V	I	V	C	T	T	S	R	A	V	R	L	I	K	F	N	P	P	L	L	P	K	K	A	H	A	L	R	S	V	H	Y	R	S	G	T	K	I	F	L	T	C	T	T	K	F	W	E	D	D	G	I	H	G	G	K	S	T	T	D	L	P
Template Known Secondary structure								S	S	S								S						S						T	T	S				S																										S	S		G	G	G	G	G	T			S	S					S	S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
		201	.	.	.	.	.	.					.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.									.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.
Query Sequence		C	Y	S	W	S	I	S	.	.	.	.	K	D	G	Y	F	I	F	G	G	A	Y	P	M	K	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	Q	T	R	F	T	T	L	K	E	K	M	S	A	F	Q	F	Q	F	G	K	T	V	K	S	E	K	C	T	V	L	F	P	S	R	W	Q	D	F	V	C	G	K	.	.	.
Query Conservation									.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	R	F	I	Y	Y	P	N	H	N	F	T	N	G	V	G	V	I	I	A	Y	G	I	G	D	D	A	N	F	F	Q	A	L	D	F	K	D	C	A	D	I	V	F	N	D	L	S	L	I	H	Q	L	P	K	K	D	I	Q	S	F	C	Y	P	S	V	I	Q	K	W	S	L	D	K	Y	A	M	G	G	I	T
Template Known Secondary structure		T							S	S			T	T											T								T	S																	T	T																		G	G	G		T	T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.
																				266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	N	A	F	L	I	G	E	A	A	G	F	I	S	A	S	S	L	E	G	I	S	Y	A	L	D	S	T	D	I	L	R	S	V	L	L	K	Q	P	E	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.
Template Sequence		T	F	T	P	Y	Q	F	Q	H	F	S	D	P	L	T	A	S	Q	G	R	I	Y	F	A	G	E	Y	T	A	Q	A	H	G	.	.	.	.	W	I	D	S	T	I	K	S	G	L	R	A	A	R	D	V	N	L	A	S	E	N
Template Known Secondary structure					T	T													B	T	T					S	G	G	G	S	S	S	S	S	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.
Template SS confidence
		432	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.					.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.