Job Description P0ADP0 Confidence 97.02% Date Thu Jan 5 11:21:27 GMT 2012 Rank 120 Aligned Residues 194 % Identity 15% Template d2bdea1 SCOP info HAD-like HAD-like 5' nucleotidase-like Resolution 2.90

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.			.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	L	G	R	I	S	A	L	T	F	D	L	D	D	T	L	Y	D	N	.	.	R	P	V	I	L	R	T	E	R	E	A	L	T	F	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																					.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	X	R	K	I	K	L	I	G	L	D	X	D	H	T	L	I	R	Y	N	S	K	N	F	E	S	L	V	Y	D	L	V	K	E	R	L	A	E	S	F	H	Y	P	E	E	I	K	K	F	K	F	N	F	D	D	A	I	R	G	L	V	I	D	S	K	N	G	N	I	L	K	L	S	R	Y	G	A	I	R	L
Template Known Secondary structure			T	T	T								T	B	T	T	T	B																							T				G	G	G	G	G					G	G	G			T	T					T	T	T	T						B	T	T	S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		13	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
																														40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	N	Y	H	P	A	L	R	S	F	Q	N	E	D	L	Q	R	L	R	Q	A	V	R	E	A	E	P	E	I	Y	H	D	V	T	R	W	R	F	R	S	I	E	Q	A	M	L	D	A	G	L	S	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.
Template Conservation																																																																														.	.	.	.
Template Sequence		S	Y	H	G	T	K	Q	I	S	F	S	D	Q	K	K	I	Y	R	S	I	Y	V	D	L	G	D	P	N	Y	X	A	I	D	T	S	F	S	I	A	F	C	I	L	Y	G	Q	L	V	D	L	K	D	T	N	P	D	K	X	P	S	Y	Q	A	I	A	Q	D	V	Q	Y	C	V	D	K	V	H	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					T	T													T	S	S	B			T	T	S	T	T							T	T																		S	T	T	T	S																			.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
		92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130		.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150									.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
Predicted Secondary structure																																									.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																									.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	E	A	S	A	G	A	H	A	A	M	I	N	F	A	K	W	R	S	R	I	D	V	P	Q	Q	T	H	D	T	L	K	Q	L	A	K	K	W	P	.	L	V	A	I	T	N	G	N	A	Q	P	E	L	F	G	L	G	D	Y	F	.	.	.	.	.	.	.	.	E	F	V	L	R	A	G	P	H	G	R	S
Query Conservation																																									.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																																				.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	S	D	G	T	L	K	N	I	I	I	K	N	L	K	K	Y	V	I	R	E	K	E	V	V	E	G	L	K	H	F	I	R	Y	G	K	K	I	F	I	L	T	N	S	E	Y	S	Y	S	K	L	L	L	D	Y	A	L	S	P	F	L	D	K	G	E	H	W	Q	G	L	F	E	F	V	I	T	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.			S								T		T	T	T	S																T	T	T								S	S														G	G	G	S		T	T			G	G	G	T							S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Template SS confidence
						169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
		163	.	.	.	.	.	.	170	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.		200	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Query Sequence		K	P	F	S	D	M	Y	F	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	E	K	L	N	V	P	I	G	E	I	L	H	V	G	D	D	L	T	T	D	V	G	G	A	I	R	.	S	G	M	Q	A	C	W	I
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Template Conservation
Template Sequence		A	N	K	P	R	F	F	Y	D	N	L	R	F	L	S	V	N	P	E	N	G	T	X	T	N	V	H	G	P	I	V	P	G	V	Y	Q	G	G	N	A	K	K	F	T	E	D	L	G	V	G	G	D	E	I	L	Y	I	G	D	H	I	Y	G	D	I	L	R	L	K	K	D	C	N	W	R	T	A	L	V
Template Known Secondary structure										S									T	T	T								S				S															T	T			G	G	G						S	S			S											S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions