Job Description P00490 Confidence 98.14% Date Thu Jan 5 10:56:40 GMT 2012 Rank 15 Aligned Residues 413 % Identity 19% Template d2bisa1 SCOP info UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase Glycosyl transferases group 1 Resolution 2.8

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		109	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	A	L	G	N	G	G	L	G	R	L	A	A	C	F	L	D	S	M	A	T	V	G	Q	S	A	T	G	Y	G	L	N	Y	Q	Y	G	L	F	R	Q	S	F	V	D	G	K	Q	V	E	A	P	D	D	W	H	R	S	N	Y	P	W	F	R	H	N	E	A	L	D	V	Q	V	G	I	G	G	K	V	T	K
Query Conservation
Alig confidence																																										.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.
Template Sequence		L	P	V	K	V	G	G	L	A	E	A	L	T	A	I	S	E	A	L	A	S	L	G	H	E	V	L	V	F	T	P	S	H	G	R	F	Q	G	E	E	.	.	.	.	.	.	.	I	G	K	I	R	V	F	G	E	E	V	Q	V	K	V	S	Y	E	E	R	G	N	L	R	I	Y	R	I	G	G	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T			S	S	S															T	T										T	T	S	S					.	.	.	.	.	.	.							S	S	S												T	T								S	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.
Template SS confidence
		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50								.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		189	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	G	R	W	E	P	E	F	T	I	T	G	Q	A	W	D	L	P	V	V	G	Y	R	N	G	V	A	Q	P	L	R	L	W	Q	A	T	H	A	H	P	F	D	L	T	K	F	N	D	G	D	F	L	R	A	E	Q	Q	G	I	N	A	E	K	L	T	K	V	L	Y	P	N	D	N	H	T	A	G	K	K	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	L	D	S	E	D	V	Y	G	P	G	W	D	G	L	I	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	G	G		S		T	T		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.
		269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	L	M	Q	Q	Y	F	Q	C	A	C	S	V	A	D	I	L	R	R	H	H	L	A	G	R	K	L	H	E	L	A	D	Y	E	V	I	Q	L	N	D	T	H	P	T	I	A	I	P	E	L	L	R	V	L	I	D	E	H	Q	M	S	W	D	D	A	W	A	I	T	S	K	T	F	A	Y	T	N	H	T	L
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	A	V	T	F	G	R	A	S	V	L	L	L	N	D	L	L	R	E	E	P	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	V	V	H	F	H	D	W	H	T	V	F	A	G	A	L	I	K	K	Y	F	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	A	V	F	T	I	H	R	L
Template Known Secondary structure																		T	T	S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S						T	G	G	G													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								S	S
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		99	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120											.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.																.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
		349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	P	E	A	L	E	R	W	D	V	K	L	V	K	G	L	L	P	R	H	M	Q	I	I	N	E	I	N	T	R	F	K	T	L	V	E	K	T	W	P	G	D	E	K	V	W	A	K	L	A	V	V	H	D	K	Q	V	H	M	A	N	L	C	V	V	G	G	F	A	V	N	G	V	A	A	L	H	S	D	L
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	K	S	K	L	P	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	Y	F	H	E	A	G	L	S	E	L	A	P	Y	P	D	I	D	P	E	H	T	G	G	Y	I	A	D	I	V	T	T	V	S	R	G	Y	L	I	D
Template Known Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T		G	G	G			S	S												S	S					S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		154	.	.	.	.	.	160																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200
		429	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	V	K	D	L	F	P	E	Y	H	Q	L	W	P	N	K	F	H	N	V	T	N	G	I	T	P	R	R	W	I	K	Q	C	N	P	A	L	A	A	L	L	D	K	S	L	Q	K	E	W	A	N	D	L	D	Q	L	I	N	L	E	K	F	A	D	D	A	K	F	R	Q	Q	Y	R	E	I	K	Q	A	N	K
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	W	G	F	.	.	.	.	.	F	R	N	F	E	G	K	I	T	Y	V	F	N	G	I	D	C	S	F	W	N	E	S	Y	L	T	G	S	R	D	E	R	K	K	S	L	L	S	K	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T				.	.	.	.	.		G	G	G	T	T	T										T	T	T	S		G	G	G			S													T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		201	.	.	.						.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
		509	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	R	L	A	E	F	V	K	V	R	T	G	I	E	I	N	P	Q	A	I	F	D	I	Q	I	K	R	L	H	E	Y	K	R	Q	H	L	N	L	L	H	I	L	A	L	Y	K	E	I	R	E	N	P	Q	A	D	R	V	P	R	V	F	L	F	G	A	K	A	A	P	G	Y	Y	L	A	K	N	I	I	F	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.																	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.																	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	M	D	E	G	V	T	F	M	F	I	G	R	F	D	R	G	Q	K	G	V	D	V	.	L	L	K	A	I	E	I	L	S	S	K	K	E	F	Q	E	.	.	.	.	.	.	.	M	R	F	I	I	I	G	K	G	D	P	E	L	E	G	W	A	R	S	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T			S								S		B		S	S	S	S					.									T	T	S	G	G	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.									B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.																	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.		.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.								.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.
		589	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	N	K	V	A	D	V	I	N	N	D	P	L	V	G	D	K	L	K	V	V	F	L	P	D	Y	C	V	S	A	A	E	K	L	I	P	A	A	D	I	S	E	Q	I	S	T	A	G	K	E	A	S	G	T	G	N	M	K	L	A	L	N	G	A	L	T	V	G	T	L	D	G	A	N	V	E	I	A	E	K
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Template Sequence		E	E	K	H	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	K	V	I	T	E	M	L	S	R	E	F	V	R	E	L	Y	G	S	V	D	F	V	I	I	P	S	Y	.	.	F	E	P	F	G	L	V	A	L	E	A	M	C	L	G	A	I	P	I	A	S	A	V	G	G	L	R	D	I	I	T	N
Template Known Secondary structure				T		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						S												T	T		S							S	.	.			S	S									T	T	T							S		T	T							T
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Template SS confidence
		304	.	.	.	.	.													310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.			.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		669	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	G	E	E	N	I	F	I	F	G	H	T	V	E	Q	V	K	A	I	L	A	K	G	Y	D	P	V	K	W	R	K	K	D	K	V	L	D	A	V	L	K	E	L	E	S	G	K	Y	S	D	G	D	K	H	A	F	D	Q	M	L	H	S	I	G	K	Q	G	G	D	P	Y	L	V	M	A	D	F	A	A	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	E	T	G	I	L	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	G	D	P	G	E	L	A	N	A	I	L	K	A	L	E	L	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T														T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
					370	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.
		749	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	E	A	Q	K	Q	V	D	V	L	Y	R	D	Q	E	A	W	T	R	A	A	I	L	N	T	A	R	C	G	M	F	S	S	D	R	S	I	R	D	Y	Q	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	S	D	L	S	K	F	R	E	N	C	K	K	R	A	M	S	F	S	W	E	K	S	A	E	R	Y	V	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S		T														S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															395	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.