Job Description P0AFI5 Confidence 99.95% Date Thu Jan 5 11:26:25 GMT 2012 Rank 44 Aligned Residues 232 % Identity 25% Template d1w79a1 SCOP info beta-lactamase/transpeptidase-like beta-lactamase/transpeptidase-like Dac-like Resolution 1.8

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		42	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.				.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	A	M	I	V	D	L	N	T	N	K	V	I	Y	S	N	H	P	D	L	V	R	P	I	A	S	I	S	K	L	M	T	A	M	V	V	L	D	A	R	L	P	.	.	.	L	D	E	K	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																												.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																												.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	V	V	V	V	D	T	A	T	G	E	E	L	Y	S	R	D	G	G	E	Q	L	L	P	A	S	N	M	K	L	F	T	A	A	A	A	L	E	V	L	G	A	D	H	S	F	G	T	E	V	A	A	E	S	A	P	G	R	R	G	E	V	Q	D	L	Y	L	V	G	R	G	D	P	T	L	S	A	E	D	L
Template Known Secondary structure								T	T	T								S	T	T			B			G	G	G													T		T	T										S	S				T	T	S			S								S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		24	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	A	M	A	A	E	V	A	A	S	G	V	R	T	V	R	G	D	L	Y	A	D	D	T	W	F	D	S	E	R	L	V	D	D	W	W	P	E	D	E	P	Y	A	Y	S	A	Q	I	S	A	L	T	V	A	H	G	E	R	F	D	T	G	V	T	E	V	S	V	T	P	A	A	E	G	E	P	A	D	V	D
Template Known Secondary structure											T	T						S							T	T	S		S			S		T	T	S		G	G	G	T	T	B	G	G	G					S	S					T	T	T	T			S										S	T	T	S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		104	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.
																																																																																	89
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	G	A	A	E	G	Y	A	E	L	D	N	R	A	V	T	G	A	A	G	S	A	N	T	L	V	I	D	R	P	V	G	T	N	T	I	A	V	T	G	S	L	P	A	D	A	A	P	V	T	A	L	R	T	V	D	E	P	A	A	L	A	G	H	L	F	E	E	A	L	E	S	N	G	V	T	V	K	G	D
Template Known Secondary structure			G	G	G	T	T	T	S											T	T											T	T								S				T	T	S										S																	T	T					S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		184	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.
		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.							.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.			.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.	.																				.	.
Query SS confidence																																																		.	.	.	.	.	.																				.	.
Query Sequence		V	D	I	S	Q	T	P	E	M	K	G	V	Y	S	R	V	R	L	N	S	E	I	S	R	K	D	M	L	L	L	A	L	M	S	S	E	N	R	A	A	A	S	L	A	H	H	Y	P	.	.	.	.	.	.	G	G	Y	K	A	F	I	K	A	M	N	A	K	A	K	S	L	G	M	.	.	N	N	T	R	F
Query Conservation																																																		.	.	.	.	.	.																				.	.
Alig confidence																																																		.	.	.	.	.	.																				.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	G	L	G	G	V	P	A	D	W	Q	D	A	E	V	L	A	D	H	T	S	A	E	L	S	E	I	L	V	P	F	M	K	F	S	N	N	G	H	A	E	M	L	V	K	S	I	G	Q	E	T	A	G	A	G	T	W	D	A	G	L	V	G	V	E	E	A	L	S	G	L	G	V	D	T	A	G	L	V	L
Template Known Secondary structure									S			T	T																							T																		S			S															T	T				T	T		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		264	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.								.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	E	P	T	G	L	S	V	H	N	V	S	T	A	R	D	L	T	K	L	L	I	A	S	K	Q	Y	P	L	I	G	Q	L	S	T	T	R	E	D	M	A	T	F	S	N	.	.	.	.	.	.	.	P	T	Y	T	L	P	F	R	N	T	N	H	L	V	Y	R	D	N	W	N	I	Q	L	T	K	T	G	F
Query Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																					.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.			.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.																.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	D	G	S	G	L	S	R	G	N	L	V	T	A	D	T	V	V	D	L	L	G	Q	A	G	S	A	P	W	A	Q	T	W	S	A	.	.	.	.	S	L	P	V	A	G	E	S	D	P	F	V	G	G	T	.	.	.	.	.	.	L	A	N	R	M	R	G	T	A	A	E	G	V	V	E	A	K	T	G	T
Template Known Secondary structure		S		S	S	S		S	T	T		B	B														T	S	T	T							.	.	.	.		S		B	T	T		S	S					G	G	.	.	.	.	.	.	G	T	T	S	S	T	T	S	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.																.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		344	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.					.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.							.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.
		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.		.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.			.	.	.	280	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.																														.	.
Query SS confidence															.																														.	.
Query Sequence		T	N	A	A	G	H	C	L	V	M	R	T	V	.	I	N	N	K	P	V	A	L	V	V	M	D	A	F	G	K	Y	T	H	F	A	D	A	S	R	L	R	T	W	.	.	I	E	T	G	K	V	M	P
Query Conservation															.																														.	.
Alig confidence						.									.																														.	.
Template Conservation						.
Template Sequence		M	S	G	V	.	S	A	L	S	G	Y	V	P	G	P	E	G	E	L	A	F	S	I	V	N	N	G	H	S	G	P	A	P	L	A	V	Q	D	A	I	A	V	R	L	A	E	Y	A	G	H	Q	A	P
Template Known Secondary structure			T	T		.										T	T													S	S	S																	T	T
Template Predicted Secondary structure						.
Template SS confidence
		414	.	.	.		.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions