Job Description P15038 Confidence 99.74% Date Thu Jan 5 11:34:22 GMT 2012 Rank 19 Aligned Residues 130 % Identity 27% Template d1pjra2 SCOP info P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases Tandem AAA-ATPase domain Resolution 2.50

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		542	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.		.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.
Predicted Secondary structure																		.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	E	S	Q	L	D	A	L	L	D	K	L	S	G	Y	A	.	K	P	E	E	R	I	L	I	L	A	R	Y	H	H	M	R	P	A	S	L	E	K	A	A	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																		.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	A	Q	F	V	A	G	R	I	R	E	A	V	E	R	G	E	R	R	Y	R	D	F	A	V	L	Y	R	T	N	A	Q	S	R	V	M	E	E	M	L	L	K	A	N	I	P	Y	Q	I	V	G	G	L	K	F	Y	D	R	K	E	I	K	D	I	L	A	Y	L	R	V	I	A	N	P	D	D	D	L	S	L
Template Known Secondary structure															T	T	T	S			G	G	G						S	S	G	G	G											T	T							T	S			G	G	G	S																T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		332	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	R	I	I	N	V	P	K	R	G	I	G	A	S	T	I	D	L	F	E	A	L	G	E	L	E	M	I	G	L	G	A	K	A	A	G	A	L	A	A	F	R	S	Q	L	E	Q	W	T	Q	L	Q	E	Y	V	S	V	T	E	L	V	E	E	V	L	D	K	S	G	Y	R	E	M	L	K	A	E	R	T	I
Template Known Secondary structure					T	T	S	S			T	T	T	S						T	T	T	T	T	S							T	T	T	T	T	T	T	T														T	T	T	S													T	S										S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
																																						583	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	W	P	K	L	Q	I	D	F	M	T	I	H	A	S	K	G	Q	Q	A	D	Y	V	I	I	V	G	L	Q	E	G	S	D	G	F	P	A	A	A	R	E	S	I	M
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.
Template Conservation																																																																																	.
Template Sequence		E	A	Q	S	R	L	E	N	L	D	E	F	L	S	V	T	K	H	F	E	N	V	S	D	D	K	S	L	I	A	F	L	T	D	L	A	L	I	S	G	D	A	V	M	L	M	T	L	H	A	A	K	G	L	E	F	P	V	V	F	L	I	G	M	E	E	G	I	F	P	H	N	R	S	L	E	D	D	D	.
Template Known Secondary structure																									S											T	T	T											G	G	G	G	T	T												B	T	B	T	T	T	B	G	G	G	G	T				.
Template Predicted Secondary structure																																																																																	.
Template SS confidence
		504	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.
		627	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.											.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	E	A	L	L	P	P	V	E	D	F	P	D	A	E	E	R	R	L	M	Y	V	A	L	T	R	A	R	H	R	V	W	A	L	F	N	K	E	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	S	P	F	V	E	I	L	K	N	L	D	V	P	V	A	R	K
Query Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	M	E	E	E	R	R	L	A	Y	V	G	I	T	R	A	E	E	E	L	V	L	T	S	A	Q	M	R	T	L	F	G	N	I	Q	M	D	P	P	S	R	F	L	N	E	I	P	A	H	L	L	E	T	A	S	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														T	T																T	T							B							S		G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
													596	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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