Job Description Q46811 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:21:12 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 481 % Identity 20% Template c1ps9A_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:2,4-dienoyl-coa reductase; PDBTitle: the crystal structure and reaction mechanism of e. coli 2,4-2 dienoyl coa reductase Resolution 2.20 Å

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		216	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.			270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.							.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																								.	.													.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																								.	.													.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	T	S	M	V	H	G	V	T	L	S	T	M	H	G	C	P	P	H	E	I	E	A	I	C	R	Y	M	L	E	E	K	G	L	N	T	F	V	K	L	N	P	T	L	L	G	Y	A	R	V	R	E	I	L	.	.	D	V	C	G	F	G	Y	I	G	L	K	E	.	.	.	.	.	.	E	S	F	D	H	D
Query Conservation																																																								.	.													.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.													.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	S	A	L	Q	A	P	I	N	R	F	V	P	H	E	L	S	H	E	E	I	L	Q	L	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	N	F	A	R	C	A	Q	L	A	R	E	A	G	Y	D	G	V	E	V	M	G	S	E	G	Y	L	I	N	E	F	L	T	L
Template Known Secondary structure		S	S	S				T	T		S	S															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													T	T		S								B	T	S								T
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.
		288	.											290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.				.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.
Query Sequence		L	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	T	Q	A	L	E	M	L	E	R	L	M	A	L	A	K	E	.	.	.	K	S	L	G	F	G	V	K	L	T	N	T	L	G	T	I	N	N	K	G	A	L	P	G	E	E	M	Y	M	S	G	R	A	L	F	P	L	S	I	N	V	A	A	V	L	S	R	A
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.											.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	T	N	Q	R	S	D	Q	W	G	G	D	Y	R	N	R	M	R	F	A	V	E	V	V	R	A	V	R	E	R	V	G	N	D	F	I	I	I	Y	R	L	S	.	.	.	M	L	D	L	V	E	D	G	G	T	F	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	V	E	L	A	Q	A	I	E	A	A
Template Known Secondary structure		T	T					S	T	T	S	S	S																					S	S	S								.	.	.					S	T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.				.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.												230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
			355	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.		.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.
Predicted Secondary structure		.																																																															.
Query SS confidence		.																																																															.
Query Sequence		.	F	D	G	K	L	P	I	S	Y	S	G	G	A	S	Q	L	T	I	R	D	I	F	D	T	G	I	R	P	I	T	M	A	T	D	L	L	K	P	G	G	Y	L	R	L	S	A	C	M	R	E	L	E	G	S	D	A	W	G	L	D	H	V	.	D	V	E	R	L	N	R	L	A	A	D	A	L	T	M	E
Query Conservation		.																																																															.
Alig confidence		.			.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.
Template Conservation					.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	A	T	.	.	.	I	I	N	T	G	I	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	H	E	A	R	I	P	T	I	A	T	P	V	P	R	G	A	F	S	W	V	T	R	K	L	K	G	H	V	S	L	P	L	V	T	T	N	R	I	N	D	P	Q	V	A	D	D	I	L	S	R	G	D	A	D	M
Template Known Secondary structure		T		S	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B	T	T		S	S		S	S	S	T	T	S		T	T	T	T								T	T	S		S	S						S	S			S										T	T	S		S
Template Predicted Secondary structure					.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		241	.	.				.	.	.	.	.	.	250												.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.
		433	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510
Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Query SS confidence																																																																																.	.
Query Sequence		Y	T	Q	K	H	W	K	P	E	E	R	I	E	V	A	E	D	L	P	L	T	D	C	Y	V	A	P	C	V	T	A	C	A	I	K	Q	D	I	P	E	Y	I	R	L	L	G	E	H	R	Y	A	D	A	L	E	L	I	Y	Q	R	N	A	L	P	A	I	T	G	H	I	C	D	H	Q	C	Q	Y	N	.	.
Query Conservation																																																																																.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	S	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	R	P	F	.	L	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	E	L	L	S	K	A	Q	S	G	R	A	D	E	I	N	T	C	I	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	N	Q	A	C	L	D	Q	I	F
Template Known Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T			.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T							T	T		G	G	G							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	T
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		307	.	.												310	.	.	.		.	.	.																	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.													.	.	.	340	.	.	.	.	.	.
								511	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	C	T	R	L	D	Y	D	S	A	L	N	I	R	E	L	K	K	V	A	L	E	K	G	W	D	E	Y	K	Q	R	W	H	K	P	A	G	S	G	S	R	H	P	V	A	V	I	G	A	G	P	A	G	L	A	A	G	Y	F	L	A	R	A	G	H	P	V	T	L	F	E	R	E	A	N
Query Conservation		.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	G	K	V	T	S	C	L	V	N	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	A	C	H	E	T	K	M	P	I	L	P	A	V	Q	K	K	N	L	A	V	V	G	A	G	P	A	G	L	A	F	A	I	N	A	A	A	R	G	H	Q	V	T	L	F	D	A	H	S	E
Template Known Secondary structure		T	T						S	S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T		T	T	T	S				S		S	S										S												T	T	T								S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		347	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
		585	.	.	.	.	590	.			.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.		.	.	.	.	.	660	.
Predicted Secondary structure									.	.																																																																.
Query SS confidence									.	.																																																																.
Query Sequence		A	G	G	V	V	K	N	.	.	I	I	P	Q	F	R	I	P	A	E	L	I	Q	H	D	I	D	F	V	A	A	H	G	V	K	F	E	Y	G	C	S	P	D	L	T	I	E	Q	L	K	N	Q	G	F	H	Y	V	L	I	A	T	G	T	D	K	N	S	G	V	K	L	A	G	.	D	N	Q	N	V	W	K
Query Conservation									.	.																																																																.
Alig confidence									.	.																																		.	.	.	.																	.										.
Template Conservation																																												.	.	.	.																	.
Template Sequence		I	G	G	Q	F	N	I	A	K	Q	I	P	G	K	E	E	F	Y	E	T	L	R	Y	Y	R	R	M	I	E	V	T	G	V	T	L	K	L	N	H	T	V	T	.	.	.	.	A	D	Q	L	Q	A	F	D	E	T	I	L	A	S	G	I	.	V	P	R	T	P	P	I	D	G	I	D	H	P	K	V	L	S
Template Known Secondary structure		S		T	T					T	T	S	T	T		T	T																T						S					.	.	.	.	S	S	S	S			S	S									.								B	T	T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.																	.
Template SS confidence
		408	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.					450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.		.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.
		662	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.																																				.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	L	P	F	L	R	E	Y	N	K	G	T	A	L	K	L	G	K	H	V	V	V	V	G	A	G	N	T	A	M	D	C	A	R	A	A	L	R	V	P	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	E	K	A
Query Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	L	D	V	L	.	.	.	.	.	R	D	K	A	P	V	G	N	K	V	A	I	I	G	C	G	G	I	G	F	D	T	A	M	Y	L	S	Q	P	G	E	S	T	S	Q	N	I	A	G	F	C	N	E	W	G	I	D	S	S	L	Q	Q	A	G	G	L	S	P	Q	G	M	Q	I	P	R	S	P	R	Q	I
Template Known Secondary structure							.	.	.	.	.	T	S						S																			T			S	S		G	G	G									T	T	B		T	T			S	G	G	G	B		T	T								S	S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.
Template SS confidence
		483	.	.	.	.						.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.
		707	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720						.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.
Query Sequence		T	I	V	Y	R	R	S	L	Q	E	M	P	A	W	.	.	.	.	.	R	E	E	Y	E	E	A	L	H	D	G	V	E	F	R	F	L	N	N	P	E	R	F	D	A	D	G	T	L	T	L	R	V	M	S	L	G	E	P	D	E	K	G	R	R	R	P	V	E	T	N	E	T	V	T	L	L	V	D	S	L
Query Conservation																.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	M	L	Q	R	K	A	S	K	P	G	Q	G	L	G	K	T	T	G	W	I	H	R	T	T	L	L	S	R	G	V	K	M	I	P	G	V	S	Y	Q	K	I	D	D	D	G	L	H	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	I	N	G	E	T	Q	V	L	A	V	D	N	V
Template Known Secondary structure						S	S		S		T	T	T	T	S		T	T	T											T	T						S								T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T								S
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		558	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620
		782	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.		830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.
Query SS confidence																																																		.
Query Sequence		I	T	A	I	G	E	Q	Q	D	T	E	A	L	N	A	M	G	V	P	L	D	K	N	G	W	P	D	V	D	H	N	G	E	T	R	L	T	D	V	F	M	I	G	D	V	Q	R	G	.	P	S	S	I	V	A	A	V	G	T	A	R	R	A	T	D	A	I
Query Conservation																																																		.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	I	C	A	G	Q	E	P	N	R	A	L	A	Q	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	I	D	S	G	K	T	V	H	L	I	G	G	C	D	V	A	M	E	L	D	A	R	R	A	I	A	Q	G	T	R	L	A	L	E	I
Template Known Secondary structure												T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	T							G	G	G	T			S	S
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		621	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.