Job Description P32153 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:49:33 GMT 2012 Rank 31 Aligned Residues 338 % Identity 9% Template c3pfeA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:succinyl-diaminopimelate desuccinylase; PDBTitle: crystal structure of a m20a metallo peptidase (dape, lpg0809) from2 legionella pneumophila subsp. pneumophila str. philadelphia 1 at 1.503 a resolution Resolution 1.50 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.											.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.								.	.	.	.	.	.	.	.	50	.		.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.											.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.											.
Query Sequence		I	E	L	L	Q	Q	L	C	E	A	S	A	V	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	E	Q	E	V	R	D	I	L	I	N	T	L	E	P	C	V	N	E	I	T	F	D	G	.	.	.	.	.	.	.	L	G	S	F	V	A	R	K	G	N	.	K	G	P	K	V	A	V	V	G	H	M	D	E
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.											.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.											.
Template Conservation
Template Sequence		L	P	S	L	C	D	Y	I	K	I	P	N	K	S	P	H	F	D	A	K	W	E	E	H	G	Y	X	E	Q	A	V	N	H	I	A	N	W	C	K	S	H	A	P	K	G	X	T	L	E	I	V	R	L	K	N	R	T	P	L	L	F	X	E	I	P	G	Q	I	D	D	T	V	L	L	Y	G	H	L	D	K
Template Known Secondary structure										T				B		G	G	G		T	T																					T			T	T									T	T	S											S													B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		65	.	.	.										.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																																	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																																	.	.	.
Query Sequence		V	G	F	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	T	H	I	D	E	S	G	F	L	R	F	T	T	I	G	G	W	W	N	Q	S	M	L	N	H	R	V	T	I	R	T	H	K	G	V	K	I	P	G	V	I	G	S	V	A	P	H	A	L	T	E	K	Q	K	Q	Q	P	L	S	F	D	E	M	.	.	.
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																																	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.																										.																							.	.	.
Template Conservation																													.	.																										.
Template Sequence		Q	P	E	X	S	G	W	S	D	D	L	H	P	W	K	P	V	L	K	N	G	L	L	Y	G	R	G	.	.	G	A	D	D	G	Y	S	A	Y	A	S	L	T	A	I	R	A	L	E	Q	Q	G	L	P	Y	.	P	R	C	I	L	I	I	E	A	C	E	E	S	G	S	Y	D	L	P	F	Y	I	E	L	L
Template Known Secondary structure						S				T	T		B	T	T	B					T	T				S	T	T	.	.																					T	T				.									S		G	G	G	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																													.	.																										.
Template SS confidence
		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.			.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.		.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.
										133	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.			.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.		.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.													.																							.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.													.																							.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	F	I	D	I	G	A	N	S	R	E	E	V	E	K	R	G	V	E	I	G	N	F	I	S	P	E	A	N	F	A	C	W	G	.	.	E	D	K	V	V	G	K	A	L	D	N	R	.	I	G	C	A	M	M	A	E	L	L	Q	T	V	N	N	P	E	I	T	L	Y	G	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.													.																							.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.													.																							.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	E	R	I	G	K	P	S	L	V	I	C	L	D	S	G	A	G	N	Y	E	Q	L	W	X	T	T	S	L	R	G	N	L	V	G	K	L	T	V	E	L	I	N	E	G	V	H	S	G	S	A	S	G	I	V	A	D	S	F	R	V	A	R	Q	L	I	S	R	I	E	D	E	N	T	G	E	I	K	L	P
Template Known Secondary structure									S								B		S		S	S	S																			S		S	S		B						T	T	T	S															B		T	T	T			B			G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		177	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.
																																																						200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	G	S	V	E	E	E	V	G	L	R	G	A	Q	T	S	A	E	H	I	K	P	D	V	V	I	V	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	L	Y	C	D	I	P	D	E	R	I	K	Q	A	K	Q	C	A	E	I	L	G	E	Q	V	Y	S	E	F	P	W	I	D	S	A	K	P	V	I	Q	D	K	Q	Q	L	I	L	N	R	T	W	R	P	A	L	T	V	T	G	A	D	G	F	P	A	I	A	D	A	G	N	V	X	R	P	V	T	S	L	K
Template Known Secondary structure		G	G																				G	G	G	G	T	T	T	S				T	T				S		S											T	S										S				T	T	T			S		B		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		257	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.									.	.	.	250	.	.	.	.	.							.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	T	A	V	A	G	D	V	P	G	I	D	N	I	K	Y	P	L	K	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	Q	G	P	G	L	M	L	.	.	.	.	.	.	F	D	K	R	Y	F	P	N	Q	K	L	V	A	A	L	K	S	C	A	A	H	N	D	L	P	L	Q	F	S	T	M	K	T	G	A	T	D	G
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	S	X	R	L	P	P	L	V	D	P	E	A	A	S	V	A	X	E	K	A	L	T	Q	N	P	P	Y	N	A	K	V	D	F	K	I	Q	N	G	G	S	K	G	W	N	A	P	L	L	S	D	W	L	A	K	A	A	S	E	A	S	X	T	Y	Y	D	K	P	A	A	Y	X	G	E	G	G	T	I	P	F
Template Known Secondary structure								T	T																S	S		G	G	G									S			B																									S	S								S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		337	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
			294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.			.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																				.	.
Query SS confidence		.																				.	.
Query Sequence		.	G	R	Y	N	V	M	G	G	G	R	P	V	V	A	L	C	L	P	T	.	.	R	Y	L	H	A	N	S	G	M	I	S	K	A	D	Y	E	A	L	L	T	L	I	R	G	F	L	T	T	L	T	A
Query Conservation		.																				.	.
Alig confidence		.																				.	.
Template Conservation
Template Sequence		X	S	X	L	G	E	Q	F	P	K	A	Q	F	X	I	T	G	V	L	G	P	H	S	N	A	H	G	P	N	E	F	L	H	L	D	X	V	K	K	L	T	S	C	V	S	Y	V	L	Y	S	F	S	Q
Template Known Secondary structure										T	T									B		T	T			T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		417	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.