Job Description P76586 Confidence 99.64% Date Thu Jan 5 12:24:53 GMT 2012 Rank 40 Aligned Residues 328 % Identity 15% Template c1v4sA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:glucokinase isoform 2; PDBTitle: crystal structure of human glucokinase Resolution 2.30 Å

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		31	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.																.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	T	L	A	R	L	A	Q	I	S	I	P	A	V	S	N	I	L	Q	E	L	E	S	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	R	V	V	N	I	D	D	E	S	Q	T	R	G	H	S	S	G	T	W	L	I	A	P	E	G	D	W	T	L	C	L	N	V	T	P	T	S	I	E	C
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	Q	I	L	A	E	F	Q	L	Q	E	E	D	L	K	K	V	M	R	R	M	Q	K	E	M	D	R	G	L	R	L	E	T	H	E	E	A	S	V	K	M	L	P	T	Y	V	R	S	T	P	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	E	V	G	D	F	L	S	L	D	L	G	G	T	N	F	R	V
Template Known Secondary structure						G	G	G																							S	T	T	T	T	T	T		S	S									S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		17	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.											.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
		96	.	.	.	100	.	.								.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.				.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.			.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.				.	.	.	.	.	.	160
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.															.	.	.																						.	.																	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.															.	.	.																						.	.																	.	.	.
Query Sequence		Q	V	A	N	A	C	L	.	.	.	.	.	.	.	S	P	K	G	E	F	E	Y	L	Q	I	D	A	P	.	.	.	T	P	Q	A	L	L	S	E	I	E	K	C	W	H	R	H	R	K	L	W	P	.	.	D	H	T	I	N	L	A	L	A	I	H	G	Q	V	D	P	.	.	.	V	T	G	V	S	Q	T
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.															.	.	.																						.	.																	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.															.	.	.																						.	.																	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	L	V	K	V	G	E	G	E	E	G	Q	W	S	V	K	T	K	H	Q	M	Y	S	I	P	E	D	A	M	T	G	T	A	E	M	L	F	D	Y	I	S	E	C	I	S	D	F	L	D	K	H	Q	M	K	H	K	K	L	P	L	G	F	T	F	S	F	P	V	R	H	E	D	I	D	K	G	I	L	L	N
Template Known Secondary structure										S	S	S															S	T	T	T	S	S	B																		T	T	T		T	T											S							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
		161	.				.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.								.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
Predicted Secondary structure				.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	P	.	.	.	Q	A	P	W	T	T	P	V	E	V	K	Y	L	L	E	E	K	L	G	I	R	.	.	.	.	.	.	.	V	M	V	D	N	D	C	V	M	L	A	L	A	E	K	W	Q	N	N	S	Q	E	R	D	F	C	V	I	N	V	D	Y	G	I	G	S	S	F	V	I	N	E	Q	I	Y	R	G
Query Conservation				.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.
Template Sequence		W	T	K	G	F	K	A	S	G	A	E	G	N	N	V	V	G	L	L	R	D	A	I	K	R	R	G	D	F	E	M	D	V	V	A	M	V	N	D	T	V	A	T	M	I	S	C	Y	Y	E	.	.	.	D	H	Q	C	E	V	G	M	I	V	G	T	G	C	N	A	C	Y	M	E	E	M	Q	N	V	E	L
Template Known Secondary structure				T	T				B	T		T	T	S	B										T	T	T		S																					T	T	.	.	.		T	T								S	S	S									G	G	G		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.
Template SS confidence
		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.				.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	L	Y	G	S	G	Q	I	G	H	T	I	V	N	P	D	G	V	V	C	D	C	G	R	Y	G	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	T	V	A	S	L	S	A	L	K	K	Q	A	R	V	W	L	K	S	Q	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	E	G	D	E	G	R	M	C	.	.	.	.	.	.	.	.	V	N	T	E	W	G	A	F	G	D	S	G	E	L	D	E	F	L	L	E	Y	D	R	L	V	D	E	S	S	A	N	P	G	Q	Q	L	Y	E	K	L	I	G	G	K	Y	M	G	E	L	V	R	L	V	L	L	R	L	V	D	E	N	L	L
Template Known Secondary structure		S	S			S	S				.	.	.	.	.	.	.	.					G	G	G	T	T	T	T	S	T	T	T	T	T											T	S	S	S	T	T	S									T	T	T															T	T		S
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		244	.	.	.	.	.	250	.	.									.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.
						279	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	P	V	S	T	Q	L	D	P	E	K	L	T	T	A	Q	L	I	A	A	W	Q	S	G	E	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	I	T	S	W	V	D	R	S	A	N	A	I	G	L	S	L	Y	N	F	L	N	I	L	N	I
Query Conservation		.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	H	G	E	A	S	E	Q	L	R	T	R	G	A	F	E	T	R	F	V	S	Q	V	E	S	D	T	G	D	R	K	Q	I	Y	N	I	L	S	T	L	G	L	R	P	S	T	T	D	C	D	I	V	R	R	A	C	E	S	V	S	T	R	A	A	H	M	C	S	A	G	L	A	G	V	I	N	R	M	R	E
Template Known Secondary structure		G	G	G				T	G	G	G	S	T	T		S									T	T			S	S	S										T	T																																							T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
		330									.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	I	W	L	Y	G	R	S	C	A	F	G	E	N	W	L	N	T	I	I	R	Q	T	G	F	N	P	F	D	R	D	E	G	P	S	V	K	A	T	Q	I	G	F	G	Q	L	S	R	A	Q	Q	V	L	G	I	G	Y	L	Y
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.							.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.							.	.	.
Template Sequence		S	R	S	E	D	V	M	R	I	T	V	G	V	D	G	S	V	Y	K	L	H	P	S	F	K	E	R	F	H	A	S	V	R	R	L	T	P	S	C	E	.	.	.	.	.	.	.	I	T	F	I	E	S	.	.	.	E	E	G	S	G	R	G	A	A	L	V	S
Template Known Secondary structure		T			S	S	S															S	T	T														T	T			.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	S	S
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.							.	.	.
Template SS confidence
		396	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.								.	.	.	.	440	.				.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.