Job Description P0AEX9 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:24:34 GMT 2012 Rank 43 Aligned Residues 370 % Identity 15% Template d1y3na1 SCOP info Periplasmic binding protein-like II Periplasmic binding protein-like II Phosphate binding protein-like Resolution 1.60

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		27	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.			.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.				.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.			.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.																						.	.	.																												.	.
Query SS confidence																			.	.																						.	.	.																												.	.
Query Sequence		K	I	E	E	G	K	L	V	I	W	I	N	G	D	K	G	Y	.	.	N	G	L	A	E	V	G	K	K	F	E	K	D	T	G	I	K	V	T	V	E	.	.	.	H	P	D	K	L	E	E	K	F	P	Q	V	A	A	T	G	D	G	P	D	I	I	F	W	A	H	D	.	.	R	F	G	G	Y	A	Q	S
Query Conservation																			.	.																						.	.	.																												.	.
Alig confidence																			.	.																						.	.	.																												.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	E	K	P	L	T	L	K	I	H	M	H	F	R	D	K	W	V	W	D	E	N	W	P	V	A	R	E	V	A	R	L	T	N	V	K	L	V	G	V	A	N	R	A	A	T	N	S	Q	E	Q	F	N	L	M	M	A	S	G	Q	L	P	D	I	V	G	G	D	N	L	K	D	K	F	I	R	Y	G	M	E
Template Known Secondary structure			S	S											T	T	T					T	T	S											S							S		S	S		S											T	S	S	S			S					T	T											T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.									.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.				.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.					150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.																.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.																.	.	.	.
Query Sequence		G	L	L	A	E	I	T	P	D	K	A	F	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	D	K	L	Y	P	F	T	W	D	A	V	R	Y	N	G	K	L	I	A	Y	P	I	.	.	.	A	V	E	A	L	S	L	I	Y	N	K	D	L	L	P	.	.	.	.	N	P	P	K	T	W	E	E	I	P	A	L	D	K	E
Query Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.																.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.																.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	A	F	I	P	L	N	K	L	I	D	Q	N	A	P	N	L	K	A	F	F	K	T	H	P	E	V	Q	R	A	I	T	A	P	D	G	N	I	Y	Y	L	P	Y	V	P	D	G	L	V	S	R	G	Y	F	I	R	Q	D	W	L	D	K	L	H	L	K	T	P	Q	T	V	D	E	L	Y	T	V	L	K	A
Template Known Secondary structure		T	S	B																													B		T	T	S		B										S															T	T						B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
		165	.	.	.	.	170							.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.						.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.
Query Sequence		L	K	A	K	G	K	.	.	.	.	.	.	S	A	L	M	F	N	L	Q	E	P	Y	F	T	W	P	L	I	A	A	D	G	G	Y	A	F	K	Y	E	N	G	K	.	.	.	.	.	Y	D	I	K	D	V	G	V	D	N	A	G	A	K	A	G	L	T	F	L	V	D	L	I	K	N	K	H	M	N	A	D
Query Conservation								.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	K	E	K	D	P	N	G	N	G	K	A	D	E	I	P	F	I	N	R	D	P	E	E	V	F	R	L	V	N	F	W	G	A	R	S	T	G	S	N	T	W	M	D	F	Y	V	E	N	G	K	I	K	H	P	F	A	E	V	A	F	K	D	G	I	K	H	V	A	Q	W	Y	K	E	G	L	I	D	P	E
Template Known Secondary structure					S		T	T		S	S	S									S		T						G	G	G	G	G	T			S		S	S	S	S	T	T						T	T					G	G	G	S																T	T	S	B		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
					234	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.					.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.								.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.																																.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.																																.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	T	D	Y	S	I	A	E	A	A	F	N	K	G	E	T	A	M	T	I	N	G	P	W	A	W	S	N	I	D	T	S	.	.	.	.	K	V	N	Y	G	V	T	V	L	P	T	F	K	G	Q	P	S	.	.	.	.	.	.	.	K	P	F	V	G	V	L	S	A	G	I	N	A	A	S	P	N	K
Query Conservation		.	.	.																																.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																																.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	F	T	R	K	A	R	S	R	E	Q	T	F	G	N	N	I	G	G	M	T	H	D	W	F	A	S	T	A	L	F	N	D	A	L	S	K	N	I	P	G	F	K	L	V	P	M	A	P	P	I	N	S	K	G	Q	R	W	E	E	D	A	R	Q	I	P	R	P	D	G	W	A	I	T	A	T	N	K	N	P
Template Known Secondary structure		T	T	T	S	G	G	G						T	T	T	T																			S	T	T	T	S	T	T										B		T	T	S		B		B						S	S		S						B	T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	L	A	K	E	F	L	E	N	Y	L	L	T	D	E	G	L	E	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	N	K	D	K	P	L	G	A	V	A	L	K	S	Y	E	E	E	L	A	K	D	P	R	I	A
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	E	T	I	K	L	F	D	F	Y	F	G	P	K	G	R	E	L	S	N	F	G	V	P	G	L	T	Y	D	I	K	N	G	K	P	V	Y	K	D	T	V	L	K	A	A	Q	P	V	N	N	Q	M	Y	D	I	G	A	Q	I	P	I	G	F	W	Q	D	Y	E	Y	E	R	Q	W	T	N	D	V	A	L	Q
Template Known Secondary structure											T	T	S												B	T	T	T					T	T										T		S	S								T	T	T		S		S	S	S										T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
		345	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.															.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	T	M	E	N	A	Q	K	G	E	I	M	P	N	I	P	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	S	A	F	W	Y	A	V	R	T	A	V	I	N	A	A	S	G	R	Q	T	V	D	E	A	L	K	D	A	Q	T	R	I	T	K
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	I	D	M	Y	I	K	N	K	Y	V	L	P	Q	F	T	G	V	N	L	T	V	E	E	R	E	I	Y	D	K	Y	W	P	D	V	K	T	Y	M	F	E	M	G	Q	S	W	V	M	G	T	K	D	P	E	K	T	W	N	D	Y	Q	Q	Q	L	K	N
Template Known Secondary structure										T		B																																						T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		407	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.