Job Description P32701 Confidence 43.94% Date Thu Jan 5 11:50:21 GMT 2012
Rank 270 Aligned Residues 137
% Identity 9% Template c3ks6A_
PDB info
PDB header: hydrolaseChain: A: PDB Molecule: glycerophosphoryl diester phosphodiesterase;
PDBTitle: crystal structure of putative glycerophosphoryl diester2 phosphodiesterase (17743486) from agrobacterium tumefaciens3 str. c58 (dupont) at 1.80 a resolution
Resolution 1.80 Å
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344 . . . . . 350 . . . . . . . . . 360 . . . . . . . . . 370 . . . . . . . . . 380 . . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400 . . . . . . . . . 410 . . . . . . . . . 420 . . .
Predicted Secondary structure  
Query SS confidence  
Query Sequence  
R D L G D Y L A T H A D R Y V S I N L S A S D F H T S R L I A R I N Q K T E Q Y A V R P Q Q I K F E V T E H A F L D V D K M T P I I L A F R Q A G Y E V A I D D
Query Conservation  
                                                                                                                           
Alig confidence  
. . . . . . .
Template Conservation  
                                                                                                . . . . . . .                                            
Template Sequence  
E L C A L Y V D S H V N F R C E I K P G V D G L P Y E G F V A L V I A G L E R H S X L E R T T F S S F .
.
.
.
.
.
.
L L A S X D E L W K A T T R P R L W L V S P
Template Known Secondary structure  
T T S T T S T T T T G G G S . . . . . . . S
Template Predicted Secondary structure  
. . . . . . .
Template SS confidence  
   
89 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120 . . . . . . . . . 130 . . . . . . . . .
140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 .
 
   
424 . . . .
. 430 . . . . . . . . . 440 . . . . . . . . . 450 . . . . . . . . . 460 . . . . . . . . . 470 . . . . . . . . . 480 . . . . . . . . . 490 . . . . . . . . .
Predicted Secondary structure  
. . . .
Query SS confidence  
.
.
.
.
Query Sequence  
F G I G Y .
.
.
.
S N L H N L K S L N V D I L K I D K S F V E T L T T H K T S H L I A E H I I E L A H S L G L K T I A E G V E T E E Q V N W L R K R G V R Y C Q
Query Conservation  
    . . . .                                                                                          
Alig confidence  
. . . . . . . . . . . . . . . .
Template Conservation  
                                                              . . . . . . . . . . . .                                                        
Template Sequence  
S V L Q Q L G P G A V I E T A I A H S I H E I G V H I D T A D .
.
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.
.
.
.
.
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.
A G L X A Q V Q A A G L D F G C W A A H T P S Q I T K A L D L G V K V F T
Template Known Secondary structure  
T T G G G . . . . . . . . . . . . T T S T S
Template Predicted Secondary structure  
. . . . . . . . . . . .
Template SS confidence  
   
162 . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180 . . . . . . . . . 190 . .
. . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . .
 
No model constructed - rank, confidence too low
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Please cite: Protein structure prediction on
the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols
4, 363 - 371 (2009) [pdf ] [Import into BibTeX ]