Job Description P22256 Confidence 99.95% Date Thu Jan 5 11:38:48 GMT 2012 Rank 84 Aligned Residues 385 % Identity 15% Template d2v1pa1 SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases Beta-eliminating lyases Resolution 1.9

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		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.												.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90
Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	H	P	I	F	A	D	R	A	E	N	C	R	V	W	D	V	E	G	R	E	Y	L	D	F	A	G	G	I	A	V	L	N	T	G	H	L	H	P	K	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	A	A	V	E	A	Q	L	K	K	L	S	H	T	C	F	Q	V	L	A	Y	E	P	Y	L	E	L	C
Query Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.
Template Sequence		P	E	P	F	R	I	R	V	I	E	P	V	K	R	T	T	R	A	Y	R	E	E	A	I	I	K	S	G	M	N	P	F	L	L	D	S	E	D	V	F	I	D	L	L	T	D	S	G	T	G	A	V	T	Q	S	M	Q	A	A	M	M	.	.	.	R	G	D	E	A	F	S	G	S	R	S	Y	Y	A	L	A
Template Known Secondary structure				S	S																							T	T	S		G	G	G	S		G	G	G		S				S			T	T		S										T	T	.	.	.	S					S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.				.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
		91	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.							.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	I	M	N	Q	K	V	P	G	D	F	A	K	K	T	L	L	V	T	T	G	S	E	A	V	E	N	A	V	K	I	A	R	A	A	.	.	.	.	.	.	T	K	R	S	G	T	I	A	F	S	G	A	Y	H	G	R	T	H	Y	T	L	A	L	T	G	K	V	N	P	Y	S	A	G	M	G	L	M	P	G
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.																									.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.
Template Sequence		E	S	V	K	N	I	F	G	.	.	.	Y	Q	Y	T	I	P	T	H	Q	G	R	G	A	E	Q	I	Y	I	P	V	L	I	K	K	R	E	Q	E	K	G	L	D	R	S	K	M	V	A	F	S	N	Y	F	F	D	T	T	Q	G	H	S	Q	I	N	G	C	T	V	R	N	V	Y	I	K	E	A	F	D	T
Template Known Secondary structure								T		.	.	.		S							S	S	T	T	T																				T	T	T						S	S												T	T							B		T	T	T	T		T
Template Predicted Secondary structure										.	.	.
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.				.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Query SS confidence																																																																																.	.
Query Sequence		H	V	Y	R	A	L	Y	P	C	P	L	H	G	I	S	E	D	D	A	I	A	S	I	H	R	I	F	K	N	D	A	A	P	E	D	I	A	A	I	V	I	E	P	V	Q	G	E	G	G	F	Y	A	S	S	P	A	F	M	Q	R	L	R	A	L	C	D	E	H	G	I	M	L	I	A	D	E	V	Q	.	.
Query Conservation																																																																																.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.													.																																																.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template Sequence		G	V	R	Y	D	F	K	G	N	F	.	.	.	.	.	.	.	.	D	L	E	G	L	E	R	G	I	E	E	V	.	G	P	N	N	V	P	Y	I	V	A	T	I	T	S	N	S	A	G	G	Q	P	V	S	L	A	N	L	K	A	M	Y	S	I	A	K	K	Y	D	I	P	V	V	M	D	S	A	R	F	A
Template Known Secondary structure		T	S			T	T	T	T		B	.	.	.	.	.	.	.	.													.		G	G	G								S	S	B		G	G	G		B																	T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template SS confidence
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.									.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.		.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.
												243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.									.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	A	G	R	T	G	T	L	F	A	M	E	Q	M	G	V	A	P	D	L	T	T	F	A	K	S	I	A	G	G	F	P	L	A	G	V	T	G	R	A	.	.	.	.	.	.	.	.	E	V	M	D	A	V	A	P	G	G	L	G	G	T	Y	A	G	N	P	I	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	N	A	Y	F	I	K	Q	R	E	A	E	Y	K	D	W	T	I	E	Q	I	T	R	E	T	Y	K	Y	A	D	M	L	A	M	S	A	K	K	D	A	M	V	P	M	G	G	L	L	C	M	K	D	D	S	F	F	D	V	Y	T	E	C	R	T	L	V	V	Q	E	G	F	P	T	Y	G	G	L	E	G	G
Template Known Secondary structure												G	G	G	T	T	S										G	G	G		S						S	S	S	T	T			S	S								S	G	G	G													T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.
		305	.	.	.	.	310	.		.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
Predicted Secondary structure									.
Query SS confidence									.
Query Sequence		C	V	A	A	L	E	V	.	L	K	V	F	E	Q	E	N	L	L	Q	K	A	N	D	L	G	Q	K	L	K	D	G	L	L	A	I	A	E	K	H	P	E	I	G	D	V	R	G	L	G	A	M	I	A	I	E	L	F	E	D	G	D	H	N	K	P	D	A	K	L	T	A	E	I	V	A	R	A	R	D	K
Query Conservation									.
Alig confidence									.																												.	.	.	.																																	.
Template Conservation																																					.	.	.	.																																	.
Template Sequence		A	M	E	R	L	A	V	G	L	Y	D	G	M	N	L	D	W	L	A	Y	R	I	A	Q	V	Q	Y	L	V	D	G	L	E	E	I	.	.	.	.	G	V	V	Q	Q	A	G	G	H	A	A	F	V	D	A	G	K	L	L	P	H	I	P	A	D	Q	F	P	A	Q	A	L	.	A	C	E	L	Y	K	V	A
Template Known Secondary structure													T	T																						T	.	.	.	.	T							S	S										S	T	T	S		G	G	G							.
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.																																	.
Template SS confidence
		314	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.					.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380		.	.	.	.	.	.	.	.
		384	.	.	.	.	.	390																.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.		.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Query Sequence		G	L	I	L	L	S	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	P	Y	Y	N	V	L	R	I	L	V	P	L	T	I	.	E	D	A	Q	I	R	Q	G	L	E	I	I	S	Q	C	F	D	E	A	K	Q
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template Conservation
Template Sequence		G	I	R	A	V	E	I	G	S	F	L	L	G	R	D	P	K	T	G	K	Q	L	P	C	P	A	E	L	L	R	L	T	I	P	R	A	T	Y	T	Q	T	H	M	D	F	I	I	E	A	F	K	H	V	K	E	N	A	A	N
Template Known Secondary structure									S						B		T	T	T		S	B				S										T	T	T																			T	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.