Job Description P08331 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:20:13 GMT 2012 Rank 4 Aligned Residues 502 % Identity 21% Template c3zu0A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:nad nucleotidase; PDBTitle: structure of haemophilus influenzae nad nucleotidase (nadn) Resolution 2.00 Å

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		21	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.						50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.
Query Sequence		T	V	D	L	R	I	M	E	T	T	D	L	H	S	N	M	M	D	F	D	Y	Y	K	D	T	A	T	E	K	.	.	.	.	.	F	G	L	V	R	T	A	S	L	I	N	D	A	R	N	E	V	K	N	S	V	L	V	D	N	G	D	L	I	Q	G	S	P	L	A	D	Y	M	S	A	K	G	L	K	A	G
Query Conservation																															.	.	.	.	.
Alig confidence																															.	.	.	.	.																																											.	.	.	.
Template Conservation																																																																														.	.	.	.
Template Sequence		A	V	E	L	S	I	L	H	I	N	D	H	H	S	Y	L	E	P	H	E	T	R	I	N	L	N	G	Q	Q	T	K	V	D	I	G	G	F	S	A	V	N	A	K	L	N	K	L	R	K	K	Y	K	N	P	L	V	L	H	A	G	D	A	I	T	G	T	L	Y	F	T	L	F	G	G	S	A	.	.	.	.
Template Known Secondary structure														T	T			S									T	T																								S	S	S							S			S		S	S					T	T	T	T			.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		34	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.			.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.	.
Query SS confidence																																																							.	.
Query Sequence		D	I	H	P	V	Y	K	A	L	N	T	L	D	Y	T	V	G	T	L	G	N	H	E	F	N	Y	G	L	D	Y	L	K	N	A	L	A	G	A	K	F	P	Y	V	N	A	N	V	I	D	A	R	T	K	.	.	Q	P	M	F	T	P	Y	L	I	K	D	T	E	V	V	D	K	D	G	K	K	Q	T	L	K
Query Conservation																																																							.	.
Alig confidence		.	.	.	.																																																		.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	D	A	A	V	M	N	A	G	N	F	H	Y	F	T	L	G	N	H	E	F	D	A	G	N	E	G	L	L	K	L	L	E	P	L	K	I	P	V	L	S	A	N	V	I	P	D	K	S	S	I	L	Y	N	K	W	K	P	Y	D	I	F	T	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	E	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.							T	T	T		S						S	G	G	G	T	T										T	T			S					S	S					T	T	S	T	T	T	T	S		B	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.										.	.	.	.
		174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	G	Y	I	G	V	V	P	P	Q	I	M	G	W	D	K	A	N	L	S	G	K	V	T	V	N	D	I	T	E	T	V	R	K	Y	V	P	E	M	R	E	K	G	A	D	V	V	V	V	L	A	H	S	G	L	S	A	D	P	Y	K	V	M	A	E	N	S	V	Y	Y	L	S	E	I	P	G	V	N	A	I
Query Conservation
Alig confidence																					.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	A	I	I	G	L	D	T	V	N	K	T	V	N	S	S	S	P	G	.	K	D	V	K	F	Y	D	E	I	A	T	A	Q	I	M	A	N	A	L	K	Q	Q	G	I	N	K	I	I	L	L	S	H	A	G	S	E	K	N	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	I	A	Q	K	V	N	D	I	D	V	I
Template Known Secondary structure										S							S				.	T	T																			T	T	T										T							.	.	.	.	.	.	.	.	.							S	S
Template Predicted Secondary structure																					.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		177	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.		.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.										.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
		254	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.								.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	F	G	H	A	H	A	V	F	P	G	K	D	.	.	.	.	.	.	.	F	A	D	I	E	G	A	D	I	A	K	G	T	L	N	G	V	P	A	V	M	P	G	M	W	G	D	H	L	G	V	V	D	L	Q	L	S	N	D	S	G	K	W	Q	V	T	Q	A	K	A	E	A	R	P	I	Y	D	I	A	N
Query Conservation															.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	T	G	D	S	H	Y	L	Y	G	N	D	E	L	R	S	L	K	L	P	V	I	Y	E	Y	P	L	E	F	K	N	P	N	G	E	P	V	F	V	M	E	G	W	A	Y	S	A	V	V	G	D	L	G	V	K	F	S	P	E	G	I	A	S	I	T	R	K	I	P	H	V	L	M	S	S	H	K	L	Q	V
Template Known Secondary structure					S	S												T	T							S	S						T	T	S										S	T	T												T	T																S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
		327	.	.	330																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.							.	370	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	K	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	E	D	S	K	L	V	E	T	L	K	A	D	H	D	A	T	R	Q	F	V	S	K	P	I	G	K	S	A	D	N	M	Y	S	Y	L	A	.	.	.	.	.	.	L	V	Q	D	D	P
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	N	S	E	G	K	W	A	E	L	T	G	D	E	R	K	K	A	L	D	T	L	K	S	M	K	S	I	S	L	D	D	H	D	A	K	T	D	K	L	I	A	K	Y	K	S	E	K	D	R	L	A	Q	E	I	V	G	V	I	T	G	S	A	M	P	G	G	S	A	N	R	I	P	N	K	A	G	S	N	P
Template Known Secondary structure				T	T	S																			T		T	T																									T	T								S	S		B			S	G	G	G	S	S	T	T	S	T	T	S		T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
		375	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	V	Q	V	V	N	N	A	Q	K	A	Y	V	E	H	Y	I	Q	G	D	P	D	L	A	K	L	P	V	L	S	A	A	A	P	F	K	V	G	G	R	K	N	D	P	A	S	Y	V	E	V	E	K	G	Q	L	T	F	R	N	A	A	D	L	Y	L	Y	P	N	T	L	I	V	V	K	A	S	G	K	E	V
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	G	S	I	A	T	R	F	I	A	E	T	M	Y	N	E	L	K	T	V	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	I	Q	N	A	G	G	V	R	A	D	I	L	P	G	N	V	T	F	N	D	A	Y	T	F	L	P	F	G	N	T	L	Y	T	Y	K	M	E	G	S	L	V
Template Known Secondary structure		T																T	T	T		S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					G	G	G			S		B		S														S
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		407	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
		455	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.						.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																										.	.	.	.	.
Query Sequence		K	E	W	L	E	C	S	A	G	Q	F	N	Q	I	D	P	N	S	T	K	P	Q	S	L	I	N	W	D	G	F	R	T	Y	N	F	D	V	I	D	G	V	N	Y	Q	I	D	V	T	Q	P	A	R	Y	D	G	E	C	Q	M	I	N	A	N	A	E	R	I	K	N	L	T	F	.	.	.	.	.	N	G	K
Query Conservation																																																																										.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	Q	V	L	E	D	A	M	Q	F	A	L	V	D	G	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	F	P	Y	G	A	G	I	R	Y	E	A	N	E	T	P	N	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	K	R	L	V	S	V	E	V	L	N	K	T	Q	Q	W	E
Template Known Secondary structure														T	T	S		G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G						S							S	S			S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		471	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.																.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.												.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.
		530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.		550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.						.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.													.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.													.	.	.	.	.
Query Sequence		P	I	D	P	N	A	M	F	L	V	A	T	N	N	Y	R	A	Y	G	G	.	K	F	A	G	T	G	D	S	H	I	A	F	.	.	.	.	.	A	S	P	D	E	N	R	S	V	L	A	A	W	I	A	D	E	S	K	R	A	G	E	I	H	P	A	A	D	N	N	W	R	L
Query Conservation																						.													.	.	.	.	.
Alig confidence																						.													.	.	.	.	.																		.	.	.	.
Template Conservation																																																									.	.	.	.
Template Sequence		P	I	D	D	N	K	R	Y	L	V	G	T	N	A	Y	V	A	G	G	K	D	G	Y	K	T	F	G	K	L	F	N	D	P	K	Y	E	G	V	D	T	Y	L	P	D	A	E	S	F	I	K	F	M	K	K	H	.	.	.	.	P	H	F	E	A	Y	T	S	S	N	V	K	F
Template Known Secondary structure					T	T	S												T	T	G	G	G								T	T		G	G	G																				S	.	.	.	.	S	S					S			S
Template Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.
Template SS confidence
		526	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580					.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.