Job Description P08331 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:20:13 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 495 % Identity 25% Template c3qfkA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:uncharacterized protein; PDBTitle: 2.05 angstrom crystal structure of putative 5'-nucleotidase from2 staphylococcus aureus in complex with alpha-ketoglutarate Resolution 2.05 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		23	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	L	R	I	M	E	T	T	D	L	H	S	N	M	M	D	F	D	Y	Y	K	D	T	A	T	E	K	F	G	L	V	R	T	A	S	L	I	N	D	A	R	N	E	V	K	N	S	V	L	V	D	N	G	D	L	I	Q	G	S	P	L	A	D	Y	M	S	A	K	G	L	K	A	G	D	I	H	P	V	Y	K
Query Conservation
Alig confidence																																																																							.	.	.
Template Conservation																																																																							.	.	.
Template Sequence		N	I	A	F	Y	V	V	S	D	V	H	G	Y	I	F	P	T	D	F	T	S	R	N	Q	Y	Q	P	X	G	L	L	L	A	N	H	V	I	E	Q	D	R	R	Q	Y	D	Q	S	F	K	I	D	N	G	D	F	L	Q	G	S	P	F	C	N	Y	L	I	A	H	S	.	.	.	G	S	S	Q	P	L	V	D
Template Known Secondary structure												T	T			S	S			S	S	S	T	T				S		S													T	T	S	S								S			S	S	S	S									T	T	.	.	.		S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.				.	.	.	.	.	.	.	.
		103	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	L	N	T	L	D	Y	T	V	G	T	L	G	N	H	E	F	N	Y	G	L	D	Y	L	K	N	A	L	A	G	A	K	F	P	Y	V	N	A	N	V	I	D	A	R	T	K	Q	P	M	F	T	P	Y	L	I	K	D	T	E	V	V	D	K	D	G	K	K	Q	T	L	K	I	G	Y	I	G	V	V	P	P
Query Conservation
Alig confidence																																															.													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	Y	N	R	X	A	F	D	F	G	T	L	G	N	H	E	F	N	Y	G	L	P	Y	L	K	D	T	L	R	R	L	N	Y	P	V	L	C	A	N	I	Y	E	N	D	S	.	T	L	T	D	N	G	V	K	Y	F	Q	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	Q	T	V	G	V	I	G	L	T	T	Q
Template Known Secondary structure						T									G	G	G	G	T	T													S	S		B			S	S				T	T		.		S	S	S		S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T											T
Template Predicted Secondary structure																																															.													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.		.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.										.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		183	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.									.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	I	M	G	W	D	K	A	N	L	S	G	K	V	T	V	N	D	I	T	E	T	V	R	K	Y	V	P	E	M	R	E	K	G	A	D	V	V	V	V	L	A	H	S	G	L	S	A	D	P	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	K	V	M	A	E	N	S	V	Y	Y	L	S	E	I	P	G	V	N	A	I	M
Query Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																	.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.
Template Sequence		F	I	P	H	W	E	Q	P	E	H	I	Q	S	L	T	F	H	S	A	F	E	I	L	Q	Q	Y	L	P	E	X	K	.	R	H	A	D	I	I	V	V	C	Y	H	G	G	F	E	K	D	L	E	S	G	T	P	T	E	V	L	T	G	E	N	E	G	Y	A	X	L	E	A	F	S	K	D	I	D	I	F	I
Template Known Secondary structure		T	G	G	G	T	S						T	T																			.				S											S	B		T	T	T			B	S	S			S	S	S											G	G	G		S
Template Predicted Secondary structure																																	.
Template SS confidence
		150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
		255	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	G	H	A	H	A	V	F	P	G	K	D	F	A	D	I	E	G	A	D	I	A	K	G	T	L	N	G	V	P	A	V	M	P	G	M	W	G	D	H	L	G	V	V	D	L	Q	L	S	N	D	S	G	K	W	Q	V	T	Q	A	K	A	E	A	R	P	I	Y	D	I	A	N	K	K	S	L	A	A	E	D
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	G	H	Q	H	R	Q	I	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	F	K	Q	T	A	V	I	Q	P	G	T	R	G	T	T	V	G	R	V	V	L	S	T	D	E	Y	E	N	.	.	.	L	S	V	E	S	C	E	L	L	P	V	I	D	.	.	.	.	.	.	.	.	D	S	T
Template Known Secondary structure				S	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T								S	T	T	S											S	S			.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.															.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.				.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280									.	.	.
		335	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.				.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.
Query Sequence		S	K	L	V	E	T	L	K	A	D	H	D	A	T	R	Q	F	V	S	K	P	I	G	K	S	A	D	N	M	.	.	.	Y	S	Y	L	A	L	V	Q	D	D	P	T	V	Q	V	V	N	N	A	Q	K	A	Y	V	E	H	Y	I	Q	G	D	P	D	L	A	K	L	P	V	L	S	A	A	A	P	F	K	V
Query Conservation																															.	.	.
Alig confidence																															.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	T	I	D	E	D	D	Q	H	L	R	K	Q	L	E	D	W	L	D	Y	E	I	T	T	L	P	Y	D	X	T	I	N	H	A	F	E	A	R	V	A	P	H	P	F	T	N	F	X	N	Y	A	L	L	E	K	S	D	A	D	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																				T							S	S					S		T	T					S																			S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	G	R	K	N	D	P	A	S	Y	V	E	V	E	K	G	Q	L	T	F	R	N	A	A	D	L	Y	L	Y	P	N	T	L	I	V	V	K	A	S	G	K	E	V	K	E	W	L	E	C	S	A	G	Q	F	N	Q	I	D	P	N	S	T	K	P	Q	S	L	I	N	W	D	G	F	R	T	Y	N	F	D	V
Query Conservation
Alig confidence		.													.																																											.
Template Conservation		.													.																																											.
Template Sequence		.	A	C	T	A	L	F	D	S	A	S	G	F	.	K	Q	V	V	T	X	R	D	V	I	N	N	Y	P	F	P	N	T	F	K	V	L	A	V	S	G	A	K	L	K	E	A	I	E	R	S	A	E	Y	F	D	V	.	K	N	D	E	V	S	V	S	A	D	F	L	E	P	K	P	Q	H	F	N	Y	D	I
Template Known Secondary structure		.							T	T					.		S											S		S																							T	T				.		T	T						G	G	G	T	S	S	S			G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.													.																																											.
Template SS confidence
			344	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.		.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.		.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
		492	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.		550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570
Predicted Secondary structure																																																												.
Query SS confidence																																																												.
Query Sequence		I	D	G	V	N	Y	Q	I	D	V	T	Q	P	A	R	Y	D	G	E	C	Q	M	I	N	A	N	A	E	R	I	K	N	L	T	F	N	G	K	P	I	D	P	N	A	M	F	L	V	A	T	N	N	Y	R	A	Y	G	G	.	K	F	A	G	T	G	D	S	H	I	A	F	A	S	P	D	E	N	R	S	V
Query Conservation																																																												.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	G	G	V	S	Y	T	I	H	V	G	R	P	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Q	R	V	S	N	X	X	I	Q	G	H	A	V	D	L	K	Q	T	Y	T	I	C	V	N	N	Y	R	A	V	G	G	G	Q	Y	D	X	Y	I	D	A	P	V	V	K	D	I	Q	V	E	G	A	Q	L
Template Known Secondary structure				S							T	T	S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S							S	S	S	S	B			T	T	S												T	T	T	T	T		G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		421	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.													.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.
		571	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	A	A	W	I	A	D	E	S	K	R	A	G	E	I	H	P	A	A	D	N	N	W	R	L
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.
Template Sequence		L	I	D	F	L	S	N	N	.	.	.	.	N	L	X	R	I	P	Q	V	V	D	F	K	V
Template Known Secondary structure										.	.	.	.	S	S
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.
Template SS confidence
		489	490	.	.	.	.	.	.					.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.