Job Description P08331 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:20:13 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 482 % Identity 23% Template c3ivdA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:nucleotidase; PDBTitle: putative 5'-nucleotidase (c4898) from escherichia coli in2 complex with uridine Resolution 1.90 Å

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		21	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.			.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.
Query SS confidence																							.	.
Query Sequence		T	V	D	L	R	I	M	E	T	T	D	L	H	S	N	M	M	D	F	D	Y	.	.	Y	K	D	T	A	T	E	K	F	G	L	V	R	T	A	S	L	I	N	D	A	R	N	E	V	K	N	S	V	L	V	D	N	G	D	L	I	Q	G	S	P	L	A	D	Y	M	S	A	K	G	L	K	A	G	D	I	H
Query Conservation																							.	.
Alig confidence																							.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	K	D	V	T	I	I	Y	T	N	D	L	H	A	H	V	E	P	Y	K	V	P	W	I	A	D	G	K	R	D	I	G	G	W	A	N	I	T	T	L	V	K	Q	E	K	A	K	N	K	A	T	W	F	F	D	A	G	D	Y	F	T	G	P	Y	I	S	S	L	T	K	G	K	A	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure														T	T			S		B			T	T	S	G	G	G	T	S		B																		S	S							S			S	S	S	S					T	T	T	T			.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.
		99	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.		.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																								.
Query SS confidence																																																								.
Query Sequence		P	V	Y	K	A	L	N	T	L	D	Y	T	V	G	T	L	G	N	H	E	F	N	Y	G	L	D	Y	L	K	N	A	L	A	G	A	K	F	P	Y	V	N	A	N	V	I	D	A	R	T	K	Q	P	M	F	.	T	P	Y	L	I	K	D	T	E	V	V	D	K	D	G	K	K	Q	T	L	K	I	G	Y	I
Query Conservation																																																								.
Alig confidence		.																																																						.									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	I	I	D	I	X	N	T	X	P	F	D	A	V	T	I	G	N	H	E	F	D	H	G	W	D	N	T	L	L	Q	L	S	Q	A	K	F	P	I	V	Q	G	N	I	F	Y	Q	N	S	S	K	S	F	W	D	K	P	Y	T	I	I	E	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	V	K	I	G	V	I
Template Known Secondary structure		.						T	T	S			S						G	G	G	G	T	T										T	T		S	S		B				S				T	T	S	S		B	S	S	S		S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure		.																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			95	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.										.	.	.	160	.	.	.	.
		178	.	180	.	.	.	.		.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.								.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.																																																			.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.																																																			.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	V	V	P	P	Q	I	.	M	G	W	D	K	A	N	L	S	G	K	V	T	V	N	D	I	T	E	T	V	R	K	Y	V	P	E	M	R	E	K	G	A	D	V	V	V	V	L	A	H	S	G	L	S	A	D	P	Y	K	.	.	.	.	.	.	.	V	M	A	E	N	S	V	Y	Y	L	S	E	I	P	G
Query Conservation									.																																																			.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.																																.																			.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.
Template Sequence		G	L	H	G	V	F	A	F	N	D	T	V	S	A	A	T	R	V	G	I	E	A	R	D	E	I	K	W	L	Q	R	Y	I	D	E	L	K	G	K	.	V	D	L	T	V	A	L	I	H	E	G	V	P	A	R	Q	S	S	X	G	G	T	D	V	R	R	A	L	D	K	D	I	Q	T	A	S	Q	V	K	G
Template Known Secondary structure													S		G	G	G	S	T	T																		T	T	T	.		S									S	S						S	S	G	G	G	S	S															S	S
Template Predicted Secondary structure																																									.
Template SS confidence
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.		.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
		250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	N	A	I	M	F	G	H	A	H	A	V	F	P	G	K	D	F	A	D	I	E	G	A	D	I	A	K	G	T	L	N	G	V	P	A	V	M	P	G	M	W	G	D	H	L	G	V	V	D	L	Q	L	S	N	D	S	G	K	W	Q	V	T	Q	A	K	A	E	A	R	P	I	Y	D	I	A	N	K	K	S
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	D	I	L	I	T	G	H	A	H	V	G	T	P	E	P	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	V	G	N	T	L	I	L	S	T	D	S	G	G	I	D	V	G	K	L	V	L	D	Y	K	E	K	P	H	N	F	T	V	K	N	F	E	L	K	T	I	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	D
Template Known Secondary structure									S	S					S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T								S	T	T	S											T	T	T	T													B	G	.	.	.	.	.	.	.	G
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260													.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.								.
		330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.			.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																													.	.
Query SS confidence																																																													.	.
Query Sequence		L	A	A	E	D	S	K	L	V	E	T	L	K	A	D	H	D	A	T	R	Q	F	V	S	K	P	I	G	K	S	A	D	N	M	Y	S	Y	L	A	L	V	Q	D	D	P	T	V	Q	V	V	N	N	A	Q	K	A	Y	V	E	.	.	H	Y	I	Q	G	D	P	D	L	A	K	L	P	V	L	S	A	A	A
Query Conservation																																																													.	.
Alig confidence																																						.	.																						.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	W	K	P	D	Q	Q	T	K	Q	V	I	D	G	W	N	K	K	L	D	E	V	V	Q	Q	T	V	A	Q	S	P	V	E	L	K	R	.	.	A	Y	G	E	S	A	S	L	G	N	L	A	A	D	A	L	L	A	A	A	G	K	N	T	Q	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G																							T							S	S		B			.	.		S	S	S																		T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																						.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		305	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340			.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.
		408	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	F	K	V	G	G	R	K	N	D	P	A	S	Y	V	E	V	E	K	G	Q	L	T	F	R	N	A	A	D	L	Y	L	Y	P	N	T	L	I	V	V	K	A	S	G	K	E	V	K	E	W	L	E	C	S	A	G	Q	F	N	Q	I	D	P	N	S	T	K	P	Q	S	L	I	N	W	D	G	F	R	T	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	A	L	T	N	S	G	G	I	R	N	E	I	P	A	G	A	I	T	X	G	G	V	I	S	T	F	P	F	P	N	E	L	V	T	X	E	L	T	G	K	Q	L	R	S	L	X	E	H	G	A	S	L	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.					G	G	G			S		B		S												S																									T		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
							367	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					420	.
		488	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.		550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560		.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																.												.
Query SS confidence																																																																.												.
Query Sequence		N	F	D	V	I	D	G	V	N	Y	Q	I	D	V	T	Q	P	A	R	Y	D	G	E	C	Q	M	I	N	A	N	A	E	R	I	K	N	L	T	F	N	G	K	P	I	D	P	N	A	M	F	L	V	A	T	N	N	Y	R	A	Y	G	G	.	K	F	A	G	T	G	D	S	H	I	A	.	F	A	S	P	D
Query Conservation																																																																.												.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.												.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	L	Q	V	S	K	G	L	E	X	K	Y	D	S	S	K	P	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Q	R	V	I	T	L	T	L	N	G	K	P	I	E	D	A	T	V	Y	H	I	A	T	Q	S	F	L	A	D	G	G	D	G	F	T	A	F	T	E	G	K	A	R	N	I	T	G	G	Y
Template Known Secondary structure							T	T							T	T	S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S								T	T					T	T													T	T	G	G	G		G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		422	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.													440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		566	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	N	R	S	V	L	A	A	W	I	A	D	E	S	K	R	A	G	E	I	H	P	A	A	D	N	N	W	R	L	A	P	I
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.
Template Sequence		Y	V	Y	H	A	V	V	D	Y	F	K	A	G	.	.	.	.	N	T	I	T	D	E	Q	L	N	G	X	R	V	K	D	I
Template Known Secondary structure													T	T	.	.	.	.												S
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.
Template SS confidence
		490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.					.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.