Job Description P08331 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:20:13 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 491 % Identity 23% Template c2z1aA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:5'-nucleotidase; PDBTitle: crystal structure of 5'-nucleotidase precursor from thermus2 thermophilus hb8 Resolution 1.75 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.		50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100
Predicted Secondary structure																														.
Query SS confidence																														.
Query Sequence		V	D	L	R	I	M	E	T	T	D	L	H	S	N	M	M	D	F	D	Y	Y	K	D	T	A	T	E	K	.	F	G	L	V	R	T	A	S	L	I	N	D	A	R	N	E	V	K	N	S	V	L	V	D	N	G	D	L	I	Q	G	S	P	L	A	D	Y	M	S	A	K	G	L	K	A	G	D	I	H	P	V
Query Conservation																														.
Alig confidence																														.																																											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	T	L	T	L	V	H	T	N	D	T	H	A	H	L	E	P	V	E	L	T	L	S	G	E	K	T	P	V	G	G	V	A	R	R	V	A	L	F	D	R	V	W	A	R	A	K	N	P	L	F	L	D	A	G	D	V	F	Q	G	T	L	Y	F	N	Q	Y	R	G	L	A	.	.	.	.	.	.	.	.	D
Template Known Secondary structure													T	T			S							S	S	S																					S	S	S							S			S	S	S	S							T	T			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		28	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.									.
		101	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.			150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.
Query SS confidence																																																			.	.
Query Sequence		Y	K	A	L	N	T	L	D	Y	T	V	G	T	L	G	N	H	E	F	N	Y	G	L	D	Y	L	K	N	A	L	A	G	A	K	F	P	Y	V	N	A	N	V	I	D	A	R	T	K	Q	.	.	P	M	F	T	P	Y	L	I	K	D	T	E	V	V	D	K	D	G	K	K	Q	T	L	K	I	G	Y	I	G
Query Conservation																																																			.	.
Alig confidence																																																			.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	Y	F	M	H	R	L	R	Y	R	A	M	A	L	G	N	H	E	F	D	L	G	P	G	P	L	A	D	F	L	K	G	A	R	F	K	V	V	S	A	N	V	D	A	S	R	E	P	R	L	K	G	L	F	A	P	Y	A	V	V	V	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	E	R	V	G	I	I	G
Template Known Secondary structure								T	T								G	G	G	G	T	T										T	T			S					T	T				T	T		G	G	G	T	T	S		B	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.										.	.	.	.	.	.	.	.	170
		179	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	V	P	P	Q	I	M	G	W	D	K	A	N	L	S	G	K	V	T	V	N	D	I	T	E	T	V	R	K	Y	V	P	E	M	R	E	K	G	A	D	V	V	V	V	L	A	H	S	G	L	S	A	D	P	Y	K	V	M	A	E	N	S	V	Y	Y	L	S	E	I	P	G	V	N	A	I	M	F	G	H	A
Query Conservation
Alig confidence															.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	T	T	P	D	T	R	E	I	S	N	P	G	.	.	P	T	V	A	F	L	D	P	Y	E	S	A	Q	K	A	V	Y	E	L	L	A	K	G	V	N	K	I	V	V	L	S	H	L	G	Y	G	E	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	L	A	R	R	L	V	G	V	Q	V	I	V	G	G	H	S
Template Known Secondary structure					T	T					S				.	.	T	T																				T	T										S							.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T		S	S								S	S
Template Predicted Secondary structure															.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		171	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.			.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.										.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		259	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.						270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.
Query Sequence		H	A	V	F	P	G	K	D	F	A	D	.	.	.	.	.	I	E	G	A	D	I	A	K	G	T	L	N	G	V	P	A	V	M	P	G	M	W	G	D	H	L	G	V	V	D	L	Q	L	S	N	D	S	G	K	W	Q	V	T	Q	A	K	A	E	A	R	P	I	Y	D	I	A	N	K	K	S	L	A	A	E
Query Conservation													.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	T	L	L	G	S	F	P	H	K	E	L	S	P	A	G	P	Y	P	T	V	V	K	N	P	E	G	K	D	V	L	V	V	Q	A	W	E	W	G	K	V	V	G	L	L	E	V	T	F	D	A	K	G	E	L	L	A	Y	K	G	E	A	L	L	M	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	A	P	E
Template Known Secondary structure					B	S			S		T	T				S	B		S	S						T	T	S										S	T	T	S											T	T	S													S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.									.	.	.	310	.
		334	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.			.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
Predicted Secondary structure																																					.	.
Query SS confidence																																					.	.
Query Sequence		D	S	K	L	V	E	T	L	K	A	D	H	D	A	T	R	Q	F	V	S	K	P	I	G	K	S	A	D	N	M	Y	S	Y	L	A	.	.	L	V	Q	D	D	P	T	V	Q	V	V	N	N	A	Q	K	A	Y	V	E	H	Y	I	Q	G	D	P	D	L	A	K	L	P	V	L	S	A	A	A	P	F	K	V
Query Conservation																																					.	.
Alig confidence																																					.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	F	F	A	K	E	A	L	L	A	Y	A	Q	P	V	M	A	L	M	Q	Q	V	I	A	E	A	K	V	D	L	V	G	E	R	A	V	V	R	R	R	E	S	N	L	G	N	L	I	T	D	G	M	L	W	K	T	R	N	A	G	T	Q	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure														G	G	G												S	S		B								T	T	S																T	G	G	G	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	G	R	K	N	D	P	A	S	Y	V	E	V	E	K	G	Q	L	T	F	R	N	A	A	D	L	Y	L	Y	P	N	T	L	I	V	V	K	A	S	G	K	E	V	K	E	W	L	E	C	S	A	G	Q	F	N	Q	I	D	P	N	S	T	K	P	Q	S	L	I	N	W	D	G	F	R	T	Y	N	F	D	V
Query Conservation
Alig confidence		.																																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.																																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	A	L	Q	N	G	G	G	I	R	A	S	I	P	K	G	P	I	T	V	G	K	V	Y	E	V	L	P	F	G	N	T	L	V	V	M	D	L	K	G	K	E	I	L	A	A	L	E	N	G	V	S	Q	W	E	N	T	A	G	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	L	Q
Template Known Secondary structure		.					G	G	G					B		S												S		S																							T	T	G	G	G	T		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.																																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			375	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.																		.	.	.
		492	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.					530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.		550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.		.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.																					.													.
Query SS confidence																																								.	.	.	.																					.													.
Query Sequence		I	D	G	V	N	Y	Q	I	D	V	T	Q	P	A	R	Y	D	G	E	C	Q	M	I	N	A	N	A	E	R	I	K	N	L	T	F	N	G	K	.	.	.	.	P	I	D	P	N	A	M	F	L	V	A	T	N	N	Y	R	A	Y	G	G	.	K	F	A	G	T	G	D	S	H	I	A	F	.	A	S	P	D
Query Conservation																																								.	.	.	.																					.													.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.																					.													.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	S	G	L	R	Y	A	F	D	L	S	R	P	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	R	V	V	R	V	E	V	K	T	E	K	G	Y	V	P	L	D	L	E	A	T	Y	R	V	V	V	N	N	F	I	A	N	G	G	D	G	F	T	V	L	K	E	A	Q	G	Y	R	V	D	T	G	F
Template Known Secondary structure				S							T	T	S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S										T	T							T	T	S												T	T	G	G	G						T			S
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		437	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450													.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.
		566	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	N	R	S	V	L	A	A	W	I	A	D	E	S	K	R	A	G	E	I	H	P	A	A	D	N	N	W	R	L	A	P	I	A
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.
Template Sequence		S	D	A	E	S	F	M	D	Y	L	K	E	L	.	.	.	.	K	V	V	E	A	G	L	E	G	R	I	E	V	L	N	E	P
Template Known Secondary structure															.	.	.	.	S								S						S
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.
Template SS confidence
		505	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.					.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.