Job Description P08331 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:20:13 GMT 2012 Rank 1 Aligned Residues 480 % Identity 21% Template c2wdfA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:sulfur oxidation protein soxb; PDBTitle: termus thermophilus sulfate thiohydrolase soxb Resolution 2.08 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		19	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																50	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	A	T	V	D	L	R	I	M	E	T	T	D	L	H	S	N	M	M	D	F	D	Y	Y	K	D	T	A	T	E	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	G
Query Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	P	Y	G	D	A	T	L	L	Y	F	S	D	L	H	G	Q	A	F	P	H	Y	F	M	E	P	P	N	L	I	A	P	K	P	L	M	G	R	P	G	Y	L	T	G	E	A	I	L	R	Y	Y	G	V	E	R	G	T	P	L	A	Y	L	L	S	Y	V	D	F	V	E	L	A	R	T	F	G	P	I	G	G
Template Known Secondary structure					S	S										T	T			S		B	B					S						G	G	G	T	T	S	T	T	S											T			T	T	S								S	T	T											B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		35	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.
		52	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.					.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.
Query Sequence		L	V	R	T	A	S	L	I	N	D	A	R	N	E	V	K	.	.	.	.	N	S	V	L	V	D	N	G	D	L	I	Q	G	S	P	L	A	D	Y	M	S	A	K	G	L	K	A	G	D	I	H	P	V	Y	K	A	L	N	T	L	D	Y	T	V	G	T	L	G	N	H	E	F	N	Y	G	L	D	Y	L	K
Query Conservation																		.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Sequence		M	G	A	L	T	A	L	I	R	D	Q	K	A	R	V	E	A	E	G	G	K	A	L	V	L	D	G	G	D	T	W	T	N	S	G	L	S	L	L	T	R	G	E	A	.	.	.	.	.	.	.	.	V	V	R	W	Q	N	L	V	G	V	D	H	M	V	.	S	H	W	E	W	T	L	G	R	E	R	V	E
Template Known Secondary structure																			T	T									S			S	S	S	S						T	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.									T						.		S	G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template SS confidence
		115	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.									.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.		.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.
		128	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	A	L	A	G	A	K	F	P	Y	V	N	A	N	V	I	D	A	R	T	K	Q	P	M	F	T	P	Y	L	I	K	D	T	E	V	V	D	K	D	G	K	K	Q	T	L	K	I	G	Y	I	G	V	V	P	P	Q	I	M	G	W	D	K	A	N	L	S	G	K	V	T	V	N	D	I	T	E	T	V	R	K
Query Conservation
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	L	L	G	L	F	R	G	E	F	L	S	Y	N	I	V	D	D	L	F	G	D	P	L	F	P	A	Y	R	I	H	R	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	P	Y	A	L	A	V	V	G	A	S	Y	P	Y	V	K	V	S	H	P	E	S	F	T	E	G	L	S	F	A	L	D	E	R	R	L	Q	E
Template Known Secondary structure									S					S	S				T	T	T			B	S	S		S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T											T	T					S		G	G	G	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		186	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.										.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.
		208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	V	P	E	M	R	E	K	G	A	D	V	V	V	V	L	A	H	S	G	L	S	A	D	P	Y	K	V	M	A	E	N	S	V	Y	Y	L	S	E	I	P	G	V	N	A	I	M	F	G	H	A	H	A	V	F	P	G	K	D	F	A	D	I	E	G	A	D	I	A	K	G	T	L	N	G	V	P	A	V	M
Query Conservation
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	V	D	K	A	R	A	E	G	A	N	A	V	V	L	L	S	H	N	G	M	Q	L	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	A	E	R	I	R	G	I	D	L	I	L	S	G	H	T	H	D	L	T	P	R	P	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	V	G	K	T	W	I	V	A
Template Known Secondary structure									T	T		S								S							.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	S	S	S								S	S					S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		257	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.										.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.													.	.	.	310	.	.	.	.	.
		288	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	G	M	W	G	D	H	L	G	V	V	D	L	Q	L	S	N	D	S	G	K	W	Q	V	T	Q	A	K	A	E	A	R	P	I	Y	D	I	A	N	K	K	S	L	A	A	E	D	S	K	L	V	E	T	L	K	A	D	H	D	A	T	R	Q	F	V	S	K	P	I	G	K	S	A	D	N	M	Y	S	Y	L
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.												.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.												.	.	.	.	.
Template Sequence		G	S	A	A	G	K	A	L	M	R	V	D	L	K	L	W	K	G	G	.	.	.	.	I	A	N	L	R	V	R	V	L	P	V	.	.	.	.	.	L	A	E	H	L	P	K	A	E	D	V	E	A	F	L	K	A	Q	L	A	P	H	Q	D	H	L	F	T	P	L	A	V	S	E	T	L	L	Y	K	R	D
Template Known Secondary structure				S	T	T												T	T		.	.	.	.												.	.	.	.	.	B	G	G	G	S															G	G	G						S						S	S		B
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.												.	.	.	.	.
Template SS confidence
		316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.					.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.						.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
		368	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.				.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.		.
Predicted Secondary structure																																																								.	.	.																						.
Query SS confidence																																																								.	.	.																						.
Query Sequence		A	L	V	Q	D	D	P	T	V	Q	V	V	N	N	A	Q	K	A	Y	V	E	H	Y	I	Q	G	D	P	D	L	A	K	L	P	V	L	S	A	A	A	P	F	K	V	G	G	R	K	N	D	P	A	S	Y	.	.	.	V	E	V	E	K	G	Q	L	T	F	R	N	A	A	D	L	Y	L	Y	P	N	.	T
Query Conservation																																																								.	.	.																						.
Alig confidence			.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.																						.
Template Conservation			.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	.	.	L	Y	S	T	W	D	Q	L	V	G	E	A	V	K	A	I	Y	P	E	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	V	V	F	S	P	A	V	R	W	G	T	T	I	L	P	G	Q	A	I	T	W	D	H	L	Y	A	Y	T	G	F	T	Y	P	E
Template Known Secondary structure		S	.	.	S																	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									S				B	B		T	T															S	S
Template Predicted Secondary structure			.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		387			.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.
		444	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	I	V	V	K	A	S	G	K	E	V	K	E	W	L	E	C	S	A	G	Q	F	N	Q	I	D	P	N	S	T	K	P	Q	S	L	I	N	W	D	G	F	R	T	Y	N	F	D	V	I	D	G	V	N	Y	Q	I	D	V	T	Q	P	A	R	Y	D	G	E	C	Q	M	I	N	A	N	A	E	R	I	K	N
Query Conservation
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	Y	L	F	Y	L	R	G	A	Q	I	K	A	V	L	E	D	I	A	S	N	V	F	T	S	D	P	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	Q	Q	G	G	D	V	S	R	V	F	G	L	R	Y	V	L	D	P	D	A	P	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	R	V	R	E
Template Known Secondary structure																								T		S		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T											T							T	T	S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	S
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		443	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470												.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.													.	.	.	.	.	.
		524	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	T	F	N	G	K	P	I	D	P	N	A	M	F	L	V	A	T	N	N	Y	R	A	Y	G	G	K	F	A	G	T	G	D	S	H	I	A	F	A	S	P	D	E	N	R	S	V	L	A	A	W	I	A	D	E	S	K	R	A	G	E	I	H	P	A	A	D	N	N	W	R	L	A	P	I	A	G	D	K	K
Query Conservation
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.
Template Sequence		V	E	V	G	G	R	P	L	D	P	N	R	R	Y	L	A	A	A	Y	G	G	R	L	Q	R	.	.	.	.	.	.	V	G	E	A	K	P	G	Y	E	P	R	P	I	Y	E	V	L	A	E	Y	L	R	S	V	.	.	.	.	G	R	V	R	V	R	P	E	P	N	V	K	V	I	G	R	N	Y	R	L	P
Template Known Secondary structure					T	T					T	T	S								S	S	S	G	G	G	.	.	.	.	.	.	G	S				T	T																		.	.	.	.														T	T	S
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.
Template SS confidence
		500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.							.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.					.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.