Job Description P10443 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:32:19 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 786 % Identity 27% Template c3f2cA_ PDB info PDB header:transferase/dna Chain: A: PDB Molecule:geobacillus kaustophilus dna polc; PDBTitle: dna polymerase polc from geobacillus kaustophilus complex with dna,2 dgtp and mn Resolution 2.50 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	P	R	F	V	H	L	R	V	H	S	D	Y	S	M	I	D	G	L	A	K	T	A	P	L	V	K	K	A	A	A	L	G	M	P	A	L	A	I	T	D	F	T	N	L	C	G	L	V	K	F	Y	G	A	G	H	G	A	G	I	K	P	I	V	G	A	D	F	N	V	Q	C	D	L	L	G	D	E	L	T
Query Conservation
Alig confidence																																																																									.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																									.	.	.	.	.
Template Sequence		G	E	K	R	V	E	L	H	L	H	T	P	M	S	Q	M	D	A	V	T	S	V	T	K	L	I	E	Q	A	K	K	W	G	H	P	A	I	A	V	T	D	H	A	V	V	Q	S	F	P	E	A	Y	S	A	A	K	K	H	G	M	K	V	I	Y	G	L	E	A	N	I	V	.	.	.	.	.	D	D	P	F
Template Known Secondary structure		T					B		S	B			T	T	S	T	T	T			S													T		S							B	S			T	T												T													.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.	.	.
Template SS confidence
		339	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.						410	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	L	T	V	L	A	A	N	N	T	G	Y	Q	N	L	T	L	L	I	S	K	A	Y	Q	R	G	Y	G	A	A	G	P	I	I	D	R	D	W	L	I	E	L	N	E	G	L	I	L	L	S	G	G	R	M	G	D	V	G	R	S	L	L	R	G	N	S	A	L	V	D	E	C	V	A	F	Y	E	E	H	F
Query Conservation
Alig confidence																													.																																		.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.																																		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	V	T	L	L	A	Q	N	E	T	G	L	K	N	L	F	K	L	V	S	L	S	H	I	Q	Y	F	.	H	R	V	P	R	I	P	R	S	V	L	V	K	H	R	D	G	L	L	V	G	S	G	C	D	K	G	E	L	F	D	N	V	.	.	.	.	.	.	E	D	I	A	R	F	Y	D	F	L	E	V	H
Template Known Secondary structure									S																T	T	T		.	S	S	S											T		T	T							S	T	T	B	T	T	T	T			.	.	.	.	.	.						T		S	B
Template Predicted Secondary structure																													.																																		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.		.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.							680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.
		163		.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure			.
Query SS confidence			.
Query Sequence		P	.	D	R	Y	F	L	E	L	I	R	T	G	R	P	D	E	E	S	Y	L	H	A	A	V	E	L	A	E	A	R	G	L	P	V	V	A	T	N	D	V	R	F	I	D	S	S	D	F	D	A	H	E	I	R	V	A	I	H	D	G	F	T	L	D	D	P	K	R	P	R	N	Y	S	P	Q	Q	Y	M	R
Query Conservation			.
Alig confidence			.											.	.																																																							.	.	.	.
Template Conservation														.	.																																																							.	.	.	.
Template Sequence		P	P	D	V	Y	K	P	L	V	K	D	E	.	.	E	M	I	K	N	I	I	R	S	I	V	A	L	G	E	K	L	D	I	P	V	V	A	T	G	N	V	H	Y	L	N	P	E	D	K	I	Y	R	K	I	L	I	H	S	Q	G	G	A	N	P	L	N	R	H	.	.	.	.	E	L	P	D	V	Y	F	R
Template Known Secondary structure			G	G	G	G								.	.																	T	T									B	S	B	S	S	G	G	G										T	T	G	G	G	S	S	S	S	S	S	.	.	.	.						B
Template Predicted Secondary structure														.	.																																																							.	.	.	.
Template SS confidence
		701	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.			.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.					.	.	.	770	.	.	.	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.							.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.		.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.																																.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.																																.
Query Sequence		S	E	E	E	M	C	E	L	F	A	D	I	P	E	.	.	.	.	.	.	A	L	A	N	T	V	E	I	A	K	R	C	N	V	T	V	R	L	G	E	Y	F	L	P	Q	F	P	T	G	D	M	.	S	T	E	D	Y	L	V	K	R	A	K	E	G	L	E	E	R	L	A	F	L	F	P	D	E	E	E	R
Query Conservation																.	.	.	.	.	.																																.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.														.	.	.	.															.																									.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.																																								.	.	.	.
Template Sequence		T	T	N	E	M	L	D	C	F	S	F	L	G	P	E	K	A	K	E	I	V	V	D	N	T	Q	K	I	A	S	L	I	G	.	.	.	.	D	V	K	P	I	K	D	E	L	Y	T	P	R	I	E	G	A	D	E	E	I	R	E	M	S	Y	R	R	A	K	E	I	Y	G	D	P	L	P	K	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										T	G	G	G										T									T			.	.	.	.				S	S		S	S		B					T	T																			S	S				.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.																																								.	.	.	.
Template SS confidence
		780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.					.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.
		315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	K	R	R	P	E	Y	D	E	R	L	E	T	E	L	Q	V	I	N	Q	M	G	F	P	G	Y	F	L	I	V	M	E	F	I	Q	W	S	K	D	N	G	V	P	V	G	P	G	R	G	S	G	A	G	S	L	V	A	Y	A	L	K	I	T	D	L	D	P	L	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																																									.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																																									.
Template Sequence		.	.	.	.	.	L	V	E	E	R	L	E	K	E	L	K	S	I	I	G	H	G	F	A	V	I	Y	L	I	S	H	K	L	V	K	K	S	L	D	D	G	Y	L	V	G	.	S	R	G	S	V	G	S	S	F	V	A	T	M	T	E	I	T	E	V	N	P	L	P	P	H	Y	V	C	P	N	C	K	H	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.																T	T																		T	T					.			G	G	G	G	G							T	T	S		S				S		S					S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																									.
Template SS confidence
							852	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.		.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.
																																384	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	L	L	F	E	R	F	L	N	P	E	R	V	S	M	P	D	F	D	V	D	F	C	M	E	K	R	D	Q	V	I	E	H	V	A	D	M	Y	G	R	D	A	V	S	Q	I	I	T	F
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	F	F	N	D	G	S	V	G	S	G	F	D	L	P	D	K	N	C	P	R	C	G	T	K	Y	K	K	D	G	H	D	I	P	F	E	T	F	L	G	F	K	G	D	K	V	P	D	I	D	L	N	F	S	G	E	Y	Q	P	R	A	H	N	Y	T	K	V	L	F	G	E	D	N	V	Y	R	A	G	T	I
Template Known Secondary structure						S	S		S	S		G	G	G	S				B		T	T	T			B										T						S	S	S		S										T	T	T														T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		926	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.
		434	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	T	M	A	A	K	A	V	I	R	D	V	G	R	V	L	G	H	P	Y	G	F	V	D	R	I	S	K	L	I	P	P	D	P	G	M	T	L	A	K	A	F	E	A	E	P	Q	L	P	E	I	Y	E	A	D	E	E	V	K	A	L	I	D	M	A	R	K	L	E	G	V	T	R	N	A	G	K	H	A	G
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	T	V	A	D	K	T	A	Y	G	F	V	K	A	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	D	H	N	L	E	L	R	G	A	E	I	D	R	L	A	A	G	C	T	G	V	K	R	T	T	G	Q	H	P	G
Template Known Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T																T	T
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1006	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.
		514	.	.	.			.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.				530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.													.	.	.
Query SS confidence						.	.													.	.	.
Query Sequence		G	V	V	I	.	.	A	P	T	K	I	T	D	F	A	P	L	Y	.	.	.	C	D	E	E	G	K	H	P	V	T	Q	F	D	K	S	D	V	E	Y	A	G	L	V	K	F	D	F	L	G	L	R	T	L	T	I	I	N	W	A	L	E	M	I	N	K	R	R	A	K	N	G	E	P	P	L	D	I	A	A
Query Conservation						.	.													.	.	.
Alig confidence						.	.													.	.	.																				.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	I	I	V	V	P	D	Y	M	E	I	Y	D	F	T	P	I	Q	Y	P	A	D	D	T	S	S	E	W	R	T	T	H	F	D	F	H	S	I	H	D	.	N	L	L	K	L	D	I	L	G	H	D	D	P	T	V	I	R	M	L	Q	D	L	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	D	P	K	T
Template Known Secondary structure								T	T	S		G	G	G	T						G	G	G		T	T		S	S				S	S						T	T	.	T	B									S														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																										.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1053	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.		.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.											.	.	.	1120	.
		589	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.															.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	P	L	D	D	K	K	S	F	D	M	L	Q	R	S	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	A	V	F	Q	L	E	S	R	G	M	K	D	L	I	K	R	L	Q	P	D	C	F	E	D	M	I	A	L	V	A	L	F	R	P	G	P	L	Q	S	G	M	V	D	N	F	I	D	R
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	P	T	D	D	P	D	V	M	G	I	F	S	S	T	E	P	L	G	V	T	P	E	Q	I	M	C	N	V	G	T	I	G	I	P	E	F	G	T	R	F	V	R	Q	M	L	E	E	T	R	P	K	T	F	S	E	L	V	Q	I	S	G	L	S	H	G	T	D	V	W	L	G	N	A	Q	E	L	I	Q	N
Template Known Secondary structure				T	T						G	G	G	T		S	G	G	G	T							T		S	S	S		T	T	S	T	T	T	S	S														S											T	S	S	T	T	S	T	T	T	T							T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1122	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200	.
		655	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	H	G	R	E	E	I	S	Y	P	D	V	Q	W	Q	H	E	S	L	K	P	V	L	E	P	T	Y	G	I	I	L	Y	Q	E	Q	V	M	Q	I	A	Q	V	L	S	G	Y	T	L	G	G	A	D	M	L	R	R	A	M	G	K	K	K	P	E	E	M	A	K	Q	R	S	V	F	A	E	G	A	E	K	N
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	C	T	L	S	E	V	I	G	C	R	D	D	I	M	V	Y	L	I	Y	R	G	.	.	L	E	P	S	L	A	F	K	I	M	E	S	V	R	K	G	K	G	L	T	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	E	A	E	M	R	K	H
Template Known Secondary structure		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S		G	G	G	S			S											T	T	.	.															T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1202															.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.			.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.												.	.	.	1250	.	.	.	.
		735	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	I	N	A	E	L	A	M	K	I	F	D	L	V	E	K	F	A	G	Y	G	F	N	K	S	H	S	A	A	Y	A	L	V	S	Y	Q	T	L	W	L	K	A	H	Y	P	A	E	F	M	A	A	V	M	T	A	D	M	D	N	T	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.
Template Sequence		D	V	P	E	W	Y	I	D	S	C	.	.	.	.	.	K	K	I	K	Y	M	F	P	K	A	H	A	A	A	Y	V	L	M	A	V	R	I	A	Y	F	K	V	H	H	P	L	L	Y	Y	A	S	Y	F	T	V	R	A	E	D	F	D	L	D	A	M	I	K	G	S	A	A	I	R	K	R	I	E	E	I	N
Template Known Secondary structure		T										.	.	.	.	.																													S												T
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1255	.	.	.	.	1260	.	.	.	.						.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																796	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	V	V	G	L	V	D	E	C	W	R	M	G	L	K	I	L	P	P	D	I	N	S	G	L	Y	H	F	H	V	N	D	D	G	E	I	V	Y	G	I	G	A	I	K	G	V	G	E	G	P	I	E	A	I	I	E	A	R	N	K	G	G	Y	F	R	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																													.
Template Conservation																																																																												.
Template Sequence		A	K	G	I	Q	A	T	A	K	E	K	S	L	L	T	V	L	E	V	A	L	E	M	C	E	R	G	F	S	F	K	N	I	D	L	Y	R	S	Q	A	T	E	F	V	I	D	G	N	S	L	I	P	P	F	N	A	I	P	G	L	G	T	N	V	A	Q	A	I	V	R	A	R	E	E	.	G	E	F	L	S
Template Known Secondary structure		T	T	G	G	G	S																				T	T								T	T	T			S	S						T	T						G	G	G	S	T	T																.	S				S
Template Predicted Secondary structure																																																																												.
Template SS confidence
		1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.		.	.	.	.	.
		862	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	F	D	L	C	A	R	T	D	T	K	K	L	N	R	R	V	L	E	K	L	I	M	S	G	A	F	D	R	L	G	P	H	R	A	A	L	M	N
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.
Template Conservation										.	.	.
Template Sequence		K	E	D	L	Q	Q	R	G	.	.	.	K	L	S	K	T	L	L	E	Y	L	E	S	R	G	C	L	D	S	L	P	D	H	N	Q	L	S	L	F
Template Known Secondary structure									T	.	.	.	T												T	T	T	T	T	T	S		S	S		S
Template Predicted Secondary structure										.	.	.
Template SS confidence
		1409	1410	.	.	.	.	.	.				.	.	.	1420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1440	.	.	.	.