Job Description P09099 Confidence 94.36% Date Wed Jan 25 15:20:14 GMT 2012 Rank 109 Aligned Residues 308 % Identity 18% Template c1tuuA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:acetate kinase; PDBTitle: acetate kinase crystallized with atpgs Resolution 2.50 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.		.	20	.	.	.	.	.	.											.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.						.	.
Predicted Secondary structure																			.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	I	G	I	D	L	G	T	S	G	V	K	V	I	L	L	N	.	E	Q	G	E	V	V	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	T	E	K	L	T	V	S	R	P	H	P	L	W	S	E	Q	D	P	E	Q	W	W	Q	A	T	D	R	A	M	K	A	L	G	D	Q	H	.	.	.	.	.	S	L
Query Conservation																			.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.
Alig confidence																			.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	L	V	I	N	A	G	S	S	S	L	K	Y	Q	L	I	D	M	T	N	E	S	A	L	A	V	G	L	C	E	R	I	G	I	D	N	S	I	I	T	Q	K	K	F	D	G	K	K	L	E	K	L	T	D	L	P	T	H	K	D	A	L	E	E	V	V	K	A	L	T	D	D	E	F	G	V	I	K	D	M
Template Known Secondary structure									S	S									T	T	T	T											T	T	S	S	S								T	T	S											S													T		T	T	T		S		S	S	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
		66	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	D	V	K	A	L	G	I	A	G	Q	M	H	G	A	T	L	L	D	A	Q	Q	R	V	L	R	P	A	I	L	W	N	D	G	R	C	A	Q	E	C	T	L	L	E	A	R	V	P	Q	S	R	V	I	T	G	N	L	M	M	P	G	F	T	A	P	K	L	L	W	V	Q	R	H	E	P	E	I	F	R	Q
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.					.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.					.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	E	I	N	A	V	G	.	.	.	.	.	H	R	V	V	.	.	.	.	H	G	G	E	K	F	T	T	S	A	L	Y	D	E	G	V	E	K	A	I	K	D	C	F	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	P	L	H	N	P	P	N	M	M	G	I	S	A	C	A	E	I	M	P	G	T	P	M	V
Template Known Secondary structure		G	G						.	.	.	.	.				S	.	.	.	.			T	T	T			S															T	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	T	T																T	T	S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.					.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		83	.	.	.	.	.	.						90	.	.	.					.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.										120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
		146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.			.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																										.	.
Query SS confidence																																																										.	.
Query Sequence		I	D	K	V	L	L	P	K	D	Y	L	R	L	R	M	T	G	E	F	A	S	D	M	S	D	A	A	G	T	M	W	L	D	V	A	K	R	D	W	S	D	V	M	L	Q	A	C	D	L	S	R	D	Q	M	P	A	.	.	L	Y	E	G	S	E	I	T	G	A	L	L	P	E	V	A	K	A	W	G	M	A
Query Conservation																																																										.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.						.														.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.														.	.	.
Template Sequence		I	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	T	A	F	H	Q	T	M	P	P	Y	A	Y	M	Y	A	L	P	Y	D	L	Y	E	K	H	G	V	R	K	Y	G	.	F	H	G	T	S	H	K	Y	V	A	E	R	A	.	.	.
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	G	G	G	G	G									S	S															.														.	.	.
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.														.	.	.
Template SS confidence
		145	.																														.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.		.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.								.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	V	P	V	V	A	G	G	G	D	N	A	A	G	A	V	G	V	G	M	V	D	A	N	Q	A	M	L	S	L	G	T	S	G	V	Y	F	A	V	S	E	G	F	L	S	K	P	E	S	A	V	H	S	F	C	H	A	L	P	Q	R	W	.	.	.	.	.	.	.	H	L	M	S	V	M	L	S	A	A	S
Query Conservation																																																																.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	M	L	G	K	P	A	E	E	T	K	I	I	T	C	H	L	G	N	G	S	S	I	T	A	V	E	G	G	K	S	V	E	T	S	M	G	F	T	P	L	E	G	L	A	M	G	T	R	C	G	S	I	D	P	A	I	V	P	F	L	M	E	K	E	G	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	S		G	G	G									S	S	S								T	T						S			S	S	T	T	S	S	S			S	S				S			T	T										T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
														192	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		297	.	.	300	.	.	.	.	.											.		.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		.
Query Sequence		C	L	D	W	A	A	K	L	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	.	L	S	N	V	P	A	L	I	A	A	A	Q	Q	A	D	E	S	A	E	P	V	W	F	L	P	Y	L	S	G	E	R	T	P	H	N	N	P	Q	A	K	G	V	F	F	G	L	T	H	Q	H	G	P	N	E	L	A	R	A	V
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	T	R	E	I	D	T	L	M	N	K	K	S	G	V	L	G	V	S	G	L	S	N	D	F	R	D	L	D	E	A	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	G	N	R	K	A	E	L	A
Template Known Secondary structure													S								S	S		S											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	300	.
		366	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.		.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.		.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
Predicted Secondary structure																			.																.
Query SS confidence																			.																.
Query Sequence		L	E	G	V	G	Y	A	L	A	D	G	M	D	V	V	H	A	.	C	G	I	K	P	Q	S	V	T	L	I	G	G	G	A	.	R	S	E	Y	W	R	Q	M	L	A	D	I	S	G
Query Conservation																			.																.
Alig confidence																			.				.												.
Template Conservation																							.
Template Sequence		L	E	I	F	A	Y	K	V	K	K	F	I	G	E	Y	S	A	V	L	N	G	.	A	D	A	V	V	F	T	A	G	I	G	E	N	S	A	S	I	R	K	R	I	L	T	G	L	D
Template Known Secondary structure																				T	T	S	.		S																					T	T		G
Template Predicted Secondary structure																							.
Template SS confidence
		302	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.		.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.