Job Description P0A9P6 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:10:55 GMT 2012 Rank 45 Aligned Residues 327 % Identity 24% Template c2d7dA_ PDB info PDB header:hydrolase/dna Chain: A: PDB Molecule:uvrabc system protein b; PDBTitle: structural insights into the cryptic dna dependent atp-ase2 activity of uvrb Resolution 2.10 Å

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		24	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.						.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.
Query Sequence		L	G	Y	E	K	P	S	P	I	Q	A	E	C	I	P	H	L	L	N	G	.	.	.	.	.	R	D	V	L	G	M	A	Q	T	G	S	G	K	T	A	A	F	S	L	P	L	L	Q	N	L	D	P	E	L	K	A	P	Q	I	L	V	L	A	P	T	R	E	L	A	V	Q	V	A	E	A	M	T	D	F	S
Query Conservation																						.	.	.	.	.
Alig confidence						.																.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.																									.
Template Conservation						.																																													.	.	.	.	.	.																									.
Template Sequence		S	K	Y	Q	.	P	Q	G	D	Q	P	K	A	I	E	K	L	V	K	G	I	Q	E	G	K	K	H	Q	T	L	L	G	A	T	G	T	G	K	T	F	T	V	S	N	L	I	K	E	V	.	.	.	.	.	.	N	K	P	T	L	V	I	A	H	N	K	T	L	A	G	Q	L	Y	S	E	F	K	E	F	.
Template Known Secondary structure			S			.			T	T														T	T		S								T	T	S														.	.	.	.	.	.									S	S															.
Template Predicted Secondary structure						.																																													.	.	.	.	.	.																									.
Template SS confidence
		9	10	.	.		.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.							.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		99	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	H	M	R	G	V	N	V	V	A	L	Y	G	G	Q	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	D	V	Q	L	R	A	L	R	Q	G	P	Q	I	V	V	G	T	P	G	R	L	L	D	H	L	K	R	G	T	L	D	L	S	K
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.
Template Sequence		.	.	F	P	N	N	A	V	E	Y	F	V	S	Y	Y	D	Y	Y	Q	P	E	A	Y	V	P	Q	T	D	T	F	I	E	K	D	A	S	I	N	D	E	I	D	K	L	R	H	S	A	T	S	A	L	F	E	R	R	D	V	I	I	I	A	S	V	S	C	I	Y	G	L	G	S	P	E	E	Y	R	E	M	V
Template Known Secondary structure		.	.		T	T	S																			T	T	T	T																												S								G	G	G	G	S		B
Template Predicted Secondary structure		.	.
Template SS confidence
				81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
		150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	S	G	L	V	L	D	E	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	S	L	R	T	E	M	E	I	E	R	N	E	L	L	R	K	L	V	D	I	Q	Y	A	R	N	D	I	D	F	Q	R	G	T	F	R	V	R	G	D	V	V	E	I	F	P	A	S	R	D	E	H	C	V	R	V	E	F	F	G	D	E	I	E	R	I	R	E	V	D	A	L	T	G	E	I	L	G	D	R
Template Known Secondary structure						T	T		B													T	T					S	S	S			T	T						T	T							T	T		S	S								S	S	S	B									T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	H	V	A	I	F	P	A	S	H	F	V	T	R	A	E	K	M	E	K	A	I	Q	N	I	E	K	E	L	E	E	Q	L	K	V	M	H	E	N	G	K	L	L	E	A	Q	R	L	E	Q	R	T	R	Y	D	L	E	M	M	R	E	M	G	F	C	S	G	I	E	N	Y	S	R	H	L	T	L	R	P	P
Template Known Secondary structure		S							S	S	S	S																												T	T																							S			T	T	G	G	G	G					T	T			T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
																												160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	M	L	R	M	G	F	I	E	D	V	E	T	I	M	A	Q	I	P	E	G	H	Q	T	A	L	F	S	A	T	M	P	E	A	I	R	R	I	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	S	T	P	Y	T	L	L	D	Y	F	P	D	D	F	M	I	V	V	D	E	S	H	V	T	I	P	Q	V	R	G	M	F	N	G	D	Q	A	R	K	Q	V	L	V	D	H	G	F	R	L	P	S	A	L	D	N	R	P	L	R	F	E	E	F	E	K	H	M	H	N	I	V	Y	V	S	A	T	P	G	P
Template Known Secondary structure		T				B		G	G	G	G	S		S	S							T																									T	T	S	S		G	G	G	G	G	S											T		S							S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.
				199	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.
Query SS confidence		.	.
Query Sequence		.	.	R	R	F	M	K	E	P	Q	E	V	R	I	Q	S	S	V	T	T	R	P	D	I	S	Q	S	Y	W	T	V	W	G	M	R	K	N	E	A	L	V	R	F	L	E	A	E	D	F	D	A	A	I	I	F	V	R	T	K	N	A	T	L	E	V	A	E	A	L	E	R	N	G	Y	N	S	A	A	L	N
Query Conservation		.	.
Alig confidence		.	.																																											.	.
Template Conservation																																														.	.
Template Sequence		Y	E	I	E	H	T	D	E	M	V	E	Q	I	I	R	P	T	G	L	L	D	P	L	I	D	V	R	P	I	E	G	Q	I	D	D	L	I	G	E	I	Q	A	R	I	.	.	E	R	N	E	R	V	L	V	T	T	L	T	K	K	M	S	E	D	L	T	D	Y	L	K	E	I	G	I	K	V	N	Y	L	H
Template Known Secondary structure								S	S								T	T												S	T	T														.	.	T	T	T								S	S														T	T
Template Predicted Secondary structure																																														.	.
Template SS confidence
		399	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.			.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.
		277	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.						.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																		.	.	.	.	.
Query Sequence		G	D	M	N	Q	A	L	R	E	Q	T	L	E	R	L	K	D	G	R	L	D	I	L	I	A	T	D	V	A	A	R	G	L	D	V	E	R	I	S	L	V	V	N	Y	D	I	P	M	.	.	.	.	.	D	S	E	S	Y	V	H	R	I	G	R	T	G	R	A	G	R	A	G	R	A	L	L	F	V	E	N
Query Conservation																																																		.	.	.	.	.
Alig confidence																																																		.	.	.	.	.																		.
Template Conservation																																																																								.
Template Sequence		S	E	I	K	T	L	E	R	I	E	I	I	R	D	L	R	L	G	K	Y	D	V	L	V	G	I	N	L	L	R	E	G	L	D	I	P	E	V	S	L	V	A	I	L	D	A	D	K	E	G	F	L	R	S	E	R	S	L	I	Q	T	I	G	R	A	A	R	N	A	E	.	G	R	V	I	M	Y	A	D	K
Template Known Secondary structure		T	T																T	S		S					S				S	T	T				T	T							T	T	T	T			T	T	T	T	S										T	T	T	T	S	T	T	.								S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																								.
Template SS confidence
		477	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.		.	.	.	550	.	.	.	.	.
		352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	E	R	R	L	L	R	N	I	E	R	T
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		I	T	K	S	M	E	I	A	I	N	E	T
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		556	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.