Job Description P52073 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:05:09 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 338 % Identity 13% Template c3d2hA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:berberine bridge-forming enzyme; PDBTitle: structure of berberine bridge enzyme from eschscholzia californica,2 monoclinic crystal form Resolution 1.65 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.				.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.
Query Sequence		D	Y	S	Q	A	L	L	E	Q	V	N	Q	A	I	S	D	K	T	P	L	V	I	Q	G	S	N	S	K	A	F	L	G	R	P	V	T	.	.	.	G	Q	T	L	D	V	R	C	H	R	G	I	V	N	Y	D	P	T	E	L	V	I	T	A	R	V	G	T	P	L	V	T	I	E	A	A	L	E	S	A	G
Query Conservation																																						.	.	.
Alig confidence																																						.	.	.													.
Template Conservation																																																					.
Template Sequence		G	S	K	E	E	L	S	N	T	I	R	C	I	R	K	G	S	W	T	I	R	L	R	S	G	G	H	S	Y	E	G	L	S	Y	T	S	D	T	P	F	I	L	I	D	L	M	N	L	N	R	V	.	S	I	D	L	E	S	E	T	A	W	V	E	S	G	S	T	L	G	E	L	Y	Y	A	I	T	E	S	S
Template Known Secondary structure			S													T	S	S							S	S				T	T		T	T	T			S	S								T	T					.				T	T	T	T						T	T		B
Template Predicted Secondary structure																																																					.
Template SS confidence
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.		.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	M	L	P	C	E	P	P	H	Y	G	E	E	A	T	W	G	G	M	V	A	C	G	L	A	G	P	R	R	P	W	S	G	S	V	R	D	F	V	L	G	T	R	I	I	T	G	A	G	K	H	L	R	F	G	G	E	V	M	K	N	V	A	G	Y	D	L	S	R	L	M	V	G	S	Y	G	C	L	G	V
Query Conservation
Alig confidence											.																																																			.	.	.	.	.
Template Conservation											.																																																			.	.	.	.	.
Template Sequence		S	K	L	G	F	T	A	G	W	.	C	P	T	V	G	T	G	G	H	I	S	G	G	G	F	G	M	M	S	R	K	Y	G	L	A	A	D	N	V	V	D	A	I	L	I	D	A	N	G	A	I	L	D	R	Q	A	M	G	E	D	.	.	.	.	.	V	F	W	A	I	R	G	G	G	G	G	V	W	G	A
Template Known Secondary structure		S	S							S	.		T	T		B							T					T	T							G	G	G	G									T	T													.	.	.	.	.						T	T	S		T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure											.																																																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
		157	.	.	160	.	.	.	.	.		.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.						.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.						.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.									.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	T	E	I	S	M	K	V	L	P	R	P	R	A	S	L	S	L	R	R	E	I	S	L	.	.	.	.	.	Q	E	A	M	S	E	I	A	E	W	Q	L	Q	P	L	P	I	S	G	L	C	Y	F	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	W	I	R	L	E	G	G	E	G	S	V	K	A	A	R	E
Query Conservation																										.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	Y	A	W	K	I	K	L	L	P	V	P	E	K	V	T	V	F	R	V	T	K	N	V	A	I	D	E	A	T	S	L	L	H	K	W	Q	F	V	A	E	E	L	E	E	D	F	T	L	S	V	L	G	G	A	D	E	K	Q	V	W	L	T	M	L	G	F	H	F	G	L	K	T	V	A	K	S	T	F	D
Template Known Secondary structure														S																														S		T	T											T	T											S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
		230	.	.														.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.								.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	E	V	A	G	Q	F	W	Q	Q	L	R	E	Q	Q	L	P	F	F	S	L	P	G	T	L	.	.	.	.	.	.	.	W	R	I	S	L	P	S	D	A	P	M	M	D	L	P	G	E	Q	L	I	D	W	G	G	A	L	R	W	L	K	S
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	L	F	P	E	L	G	L	V	E	E	D	Y	L	E	M	S	W	G	E	S	F	A	Y	L	A	G	L	E	T	V	S	Q	L	N	N	R	F	L	K	F	D	E	R	A	F	K	T	K	V	D	L	T	K	E	P	L	P	S	K	A	F	Y	G	L	L	E	R	L	S	K	E	P	N	G	F	I	A	L	N
Template Known Secondary structure					G	G	G				G	G	G														T	T		S		G	G	G	G	G		T	T			S													S	S																		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
		290	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	N	Q	I	H	R	I	A	R	N	A	G	G	H	A	T	R	F	S	A	G	D	G	G	F	A	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	F	G	G	Q	M	S	K	I	S	S	D	F	T	P	F	P	H	R	S	G	T	R	L	M	V	E	Y	I	V	A	W	N	Q	S	E	Q	K	K	K	T	E	F	L	D	W	L	E	K	V	Y	E	F	M	K	P	F	V	S	K	N	P	R	L	G	Y	V	N	H	I	D	L	D	L	G	G	I	D	W	G
Template Known Secondary structure					G	G	G	G	T	S		T	T	S	S	S					T	T													G	G	G	G	G	G																G	G	G	S			S	S					G	G	G			G	G	G					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
																				320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	A	P	L	F	R	Y	H	Q	Q	L	K	Q	Q	L	D	P	C	G	V	F	N	P	G	R	M	Y	A	E	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	K	T	V	V	N	N	A	I	E	I	S	R	S	W	G	E	S	Y	F	L	S	N	Y	E	R	L	I	R	A	K	T	L	I	D	P	N	N	V	F	N	H	P	Q	S	I	P	P	M
Template Known Secondary structure								T														G	G	G													T	T			S			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		471	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.