Job Description P52073 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:05:09 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 337 % Identity 18% Template c3bw7A_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:cytokinin dehydrogenase 1; PDBTitle: maize cytokinin oxidase/dehydrogenase complexed with the allenic2 cytokinin analog ha-1 Resolution 1.95 Å

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		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.				.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40		.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.						.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.																				.														.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.																				.														.	.	.	.	.
Query Sequence		C	D	Y	S	Q	A	L	L	E	Q	V	N	Q	A	I	S	D	.	.	.	K	T	P	L	V	I	Q	G	S	N	S	K	A	F	L	G	R	P	V	.	T	G	Q	T	L	D	V	R	C	H	R	G	I	.	.	.	.	.	V	N	Y	D	P	T	E	L	V	I	T	A	R	V	G	T	P	L	V	T	I	E
Query Conservation																			.	.	.																				.														.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.																				.														.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	S	S	T	A	D	L	V	A	L	L	S	A	A	N	S	T	P	G	W	P	Y	T	I	A	F	R	G	R	G	H	S	L	M	G	Q	A	F	A	P	G	G	V	V	V	N	M	A	S	L	G	D	A	A	A	P	P	R	I	N	V	S	A	D	G	R	Y	V	D	A	G	G	E	Q	V	W	I	D	V	L
Template Known Secondary structure			S	S														S	T	T									S	S				S	S	S	T	T			T	T	S					G	G	G	G	G		S	S	S	S		S					T	T	S	S						T	T		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		75	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.
		76	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	A	L	E	S	A	G	Q	M	L	P	C	E	P	P	H	Y	G	E	E	A	T	W	G	G	M	V	A	C	G	L	A	G	P	R	R	P	W	S	G	S	V	R	D	F	V	L	G	T	R	I	I	T	G	A	G	K	H	L	R	F	G	G	E	V	M	K	N	V	A	G	Y	D	L	S	R	L	M	V	G
Query Conservation
Alig confidence																		.	.																																															.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.																																															.	.	.	.	.
Template Sequence		R	A	S	L	A	R	G	V	A	P	R	S	W	T	D	Y	.	.	L	Y	L	T	V	G	G	T	L	S	N	A	G	I	S	G	Q	A	F	R	H	G	P	Q	I	S	N	V	L	E	M	D	V	I	T	G	H	G	E	M	V	T	C	S	K	Q	.	.	.	.	.	L	N	A	D	L	F	D	A	V	L	G
Template Known Secondary structure						T	T	T				S	S			S		.	.	S		S	B						T	T					T	T							G	G	G	S									T	T	S							S	S	.	.	.	.	.	S	S								T	T
Template Predicted Secondary structure																		.	.																																															.	.	.	.	.
Template SS confidence
		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170			.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.						.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
		156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.
Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	Y	G	C	L	G	V	L	T	E	I	S	M	K	V	L	P	R	P	R	A	S	L	S	L	R	R	E	I	S	L	Q	E	A	M	S	E	I	A	E	W	Q	L	Q	P	L	P	I	S	G	L	C	Y	F	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	L	G	Q	F	G	V	I	T	R	A	R	I	A	V	E	P	A	P	A	R	A	R	W	V	R	L	V	Y	T	D	F	A	A	F	S	A	D	Q	E	R	L	T	A	P	R	S	F	G	P	M	S	Y	V	E	G	S	V	F	V	N	Q	S	L	A	T	D	L	A	N	T	G	F	F	T	D	A	D	V	A
Template Known Secondary structure			T	T	S	S															S										S															B			B		S		S									G	G	G							T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
																			212	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.																.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.						.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	W	I	R	L	E	G	G	E	G	S	V	K	A	A	R	E	L	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	E	V	A	G	Q	F	W	Q	Q	L	R	E	Q	Q	L	P	F	.	.	.	.	.	F	S	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	I	V	A	L	A	G	E	R	N	A	T	T	V	Y	S	I	E	A	T	L	N	Y	D	N	A	T	A	A	A	A	A	V	D	Q	E	L	A	S	V	L	G	T	L	S	Y	V	E	G	F	A	F	Q	R	D	V	A	Y	A	A	F	L	D	R	V	H	G	E	E	V	A	L	N	K	L	G	L	W	R	V
Template Known Secondary structure											T		S													S		T	T															T			S		T	T														T												T	T		S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		314	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
		255	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.			.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	G	T	L	W	R	I	S	L	P	S	D	A	P	M	M	D	L	P	.	.	G	E	Q	L	I	D	W	G	G	A	L	R	W	L	K	S	T	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																					.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	H	P	W	L	N	M	F	V	P	R	S	R	I	A	D	F	D	R	G	V	F	K	G	I	L	Q	G	T	D	I	V	G	P	L	I	V	Y	P	L	N	K	S	M	W	D	D	G	M	S	A	A	T	P	S	E	D	V	F	Y	A	V	S	L	L	F	S	S	V	A	P	N	D	L	A	R	L	Q	E	Q
Template Known Secondary structure												G	G	G													T	T	T	S				S									G	G	G	S		T	T	S	S					S	S	S													S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		394	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.
		293	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.					.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.		.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.																																									.
Query SS confidence															.	.	.	.																																									.
Query Sequence		D	N	Q	I	H	R	I	A	R	N	A	G	G	.	.	.	.	H	A	T	R	F	S	A	G	D	G	G	F	A	P	L	S	A	P	L	F	R	Y	H	Q	Q	L	K	Q	Q	L	D	P	C	G	V	F	N	P	G	R	.	M	Y	A
Query Conservation															.	.	.	.																																									.
Alig confidence															.	.	.	.																																									.
Template Conservation
Template Sequence		N	R	R	I	L	R	F	C	D	L	A	G	I	Q	Y	K	T	Y	L	A	R	H	T	D	R	S	D	W	V	R	H	F	G	A	A	K	W	N	R	F	V	E	M	K	N	K	Y	D	P	K	R	L	L	S	P	G	Q	D	I	F	N
Template Known Secondary structure												T	T						S	S				S	S																									T	T			B		G	G	G		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		474	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.