Job Description P52073 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:05:09 GMT 2012 Rank 13 Aligned Residues 341 % Identity 16% Template c2ipiD_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: D: PDB Molecule:aclacinomycin oxidoreductase (aknox); PDBTitle: crystal structure of aclacinomycin oxidoreductase Resolution 1.65 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40			.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.
Query SS confidence																																					.	.
Query Sequence		D	Y	S	Q	A	L	L	E	Q	V	N	Q	A	I	S	D	K	T	P	L	V	I	Q	G	S	N	S	K	A	F	L	G	R	P	V	.	.	T	G	Q	T	L	D	V	R	C	H	R	G	I	V	N	Y	D	P	T	E	L	V	I	T	A	R	V	G	T	P	L	V	T	I	E	A	A	L	E	S	A	G	Q
Query Conservation																																					.	.
Alig confidence																																					.	.														.
Template Conservation																																																				.
Template Sequence		H	T	A	D	Q	V	V	D	A	V	N	Q	A	M	A	A	G	Q	R	I	A	V	R	S	G	G	H	C	F	E	G	F	V	D	D	P	A	V	R	A	V	I	D	M	S	Q	M	R	Q	V	.	F	Y	D	S	G	K	R	A	F	A	V	E	P	G	A	T	L	G	E	T	Y	R	A	L	Y	L	D	W	G
Template Known Secondary structure			S														T	T							S	S				T	T		G	G	G		T	T								T	T					.				T	T	T	T						T	T	S	B													S
Template Predicted Secondary structure																																																				.
Template SS confidence
		44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.		.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.			.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.		.	.	.	.	160
Predicted Secondary structure																																																								.	.																			.
Query SS confidence																																																								.	.																			.
Query Sequence		M	L	P	C	E	P	P	H	Y	G	E	E	A	T	W	G	G	M	V	A	C	G	L	A	G	P	R	R	P	W	S	G	S	V	R	D	F	V	L	G	T	R	I	I	T	G	A	G	K	H	L	R	F	G	.	.	G	E	V	M	K	N	V	A	G	Y	D	L	S	R	L	M	V	G	.	S	Y	G	C	L
Query Conservation																																																								.	.																			.
Alig confidence										.	.																																													.	.																			.
Template Conservation										.	.
Template Sequence		V	T	I	P	A	G	V	C	.	.	P	Q	V	G	V	G	G	H	V	L	G	G	G	Y	G	P	L	S	R	R	D	G	V	V	A	D	H	L	Y	A	V	E	V	V	V	V	D	A	S	G	R	A	R	K	V	V	A	T	S	A	A	D	D	P	N	R	E	L	W	W	A	H	T	G	G	G	G	G	N	F
Template Known Secondary structure		B						S		.	.	T	T	S	B					G	G	G	T				T	T							G	G	G	G											T	T	S											T	T		T	T							T	S	S	S		S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure										.	.
Template SS confidence
		123	.	.	.	.	.	.	130			.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	V	L	T	E	I	S	M	K	V	L	P	R	P	R	A	S	L	S	L	R	R	E	I	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	E	A	M	S	E	I	A	E	W	Q	L	Q	P	L	P	I	S	G	L	C	Y	F	D	N	A	L	W	I	R	L	E	G	G
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	I	V	T	R	Y	W	F	R	T	P	G	A	T	G	T	D	P	S	Q	L	L	P	K	A	P	T	S	T	L	R	H	I	V	T	W	D	W	S	A	L	T	E	E	A	F	T	R	I	I	D	N	H	G	A	W	H	Q	S	N	S	A	A	G	T	P	Y	A	S	M	H	S	V	F	Y	L	N	S	R	A
Template Known Secondary structure		S										S	S			S	S		G	G	G	S	S		B			S											T	T	T																					S	S		S	S	G	G	G	G										T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	270	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	G	S	V	K	A	A	R	E	L	L	G	G	E	E	V	A	G	Q	F	W	Q	Q	L	R	E	Q	Q	L	P	F	F	S	L	P	G	T	L	W	R	I	S	L	P	S	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	M	M	D	L	P
Query Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	G	Q	I	L	L	D	I	Q	I	D	G	G	L	D	G	A	E	A	L	L	N	D	F	V	A	A	V	N	E	G	T	G	V	E	P	A	V	Q	R	S	T	E	P	W	L	R	A	T	L	A	N	K	F	D	T	G	G	F	D	R	T	K	S	K	G	A	Y	L	R	K	P	W	T	A	A	Q	A	A	T
Template Known Secondary structure		T	S										T	T	S	T	T													T	T	T		S	S																T							T	T												S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		281	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
		274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	E	Q	L	I	D	W	G	G	A	L	R	W	L	K	S	T	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	N	Q	I	H	R	I	A	R	N	A	G	G	H	A	T	R	F	S
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	Y	R	H	L	S	A	D	S	Q	V	W	G	E	V	S	L	Y	S	Y	G	G	K	V	N	S	V	P	E	T	A	T	A	T	A	Q	R	D	S	I	I	K	V	W	M	S	A	T	W	M	D	P	A	H	D	D	A	N	L	A	W	I	R	E	I	Y	R	E	I	F	A	T	T	G	G	V	P	V	P	D
Template Known Secondary structure								S			S	S											G	G	G	G	G	S		T	T	S	S	S					S		S										S		G	G	G																T	T	T	T	T	T	S			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		361	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440
		312	.	.	.	.	.	.																							.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	G	D	G	G	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	L	S	A	P	L	F	R	Y	H	Q	Q	L	K	Q	Q	L	D	P	C	G	V	F	N	P	G	R	M	Y	A	E
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	R	T	E	G	T	F	I	N	Y	P	D	V	D	L	V	D	E	R	W	N	T	S	G	V	P	W	Y	T	L	Y	Y	K	G	N	Y	P	R	L	Q	K	V	K	A	R	W	D	P	R	D	V	F	R	H	A	L	S	V	R	P
Template Known Secondary structure		S	S	B					T	T	S			G	G	G	G		T	T	T	S			S	S								G	G	G													T	T			S			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		441	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500