Job Description P52073 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:05:09 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 336 % Identity 16% Template c2exrA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:cytokinin dehydrogenase 7; PDBTitle: x-ray structure of cytokinin oxidase/dehydrogenase (ckx)2 from arabidopsis thaliana at5g21482 Resolution 1.70 Å

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		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20		.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40		.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.							.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.																					.														.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.																					.														.	.	.	.	.	.
Query Sequence		C	D	Y	S	Q	A	L	L	E	Q	V	N	Q	A	I	S	.	D	K	T	P	L	V	I	Q	G	S	N	S	K	A	F	L	G	R	P	V	.	T	G	Q	T	L	D	V	R	C	H	R	G	I	.	.	.	.	.	.	V	N	Y	D	P	T	E	L	V	I	T	A	R	V	G	T	P	L	V	T	I	E	A
Query Conservation																		.																					.														.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.																					.														.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	V	G	P	E	D	I	A	G	A	V	K	A	A	L	R	S	D	K	L	T	V	A	A	R	G	N	G	H	S	I	N	G	Q	A	X	A	E	G	G	L	V	V	D	X	S	T	T	A	E	N	H	F	E	V	G	Y	L	S	G	G	D	A	T	A	F	V	D	V	S	G	G	A	L	W	E	D	V	L	K
Template Known Secondary structure			S	S														S	S	S							S	S	S			S	S	S	T	T			T	T	S					G	G	G	G	T	T	S									S	S	S	S	S							T	T		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		68	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	L	E	S	A	G	Q	M	L	P	C	E	P	P	H	Y	G	E	E	A	T	W	G	G	M	V	A	C	G	L	A	G	P	R	R	P	W	S	G	S	V	R	D	F	V	L	G	T	R	I	I	T	G	A	G	K	H	L	R	F	G	G	E	V	M	K	N	V	A	G	Y	D	L	S	R	L	M	V	G	S
Query Conservation
Alig confidence																		.																																															.	.	.	.	.
Template Conservation																		.																																															.	.	.	.	.
Template Sequence		R	C	V	S	E	Y	G	L	A	P	R	S	W	T	D	Y	.	L	G	L	T	V	G	G	T	L	S	N	A	G	V	S	G	Q	A	F	R	Y	G	P	Q	T	S	N	V	T	E	L	D	V	V	T	G	N	G	D	V	V	T	C	S	E	I	.	.	.	.	.	E	N	S	E	L	F	F	S	V	L	G	G
Template Known Secondary structure								S				S				S		.		S	S	B						T	T					T	T							G	G	G	S									T	T	S							S	S	.	.	.	.	.	S	S								T	T
Template Predicted Secondary structure																		.																																															.	.	.	.	.
Template SS confidence
		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.		.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.						210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	G	C	L	G	V	L	T	E	I	S	M	K	V	L	P	R	P	R	A	S	L	S	L	R	R	E	I	S	L	Q	E	A	M	S	E	I	A	E	W	Q	L	Q	P	L	P	I	S	G	L	C	Y	F	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	G	Q	F	G	I	I	T	R	A	R	V	L	L	Q	P	A	P	D	X	V	R	W	I	R	V	V	Y	T	E	F	D	E	F	T	Q	D	A	E	W	L	V	S	Q	K	N	E	S	S	F	D	Y	V	E	G	F	V	F	V	N	G	A	D	P	V	N	G	W	P	T	V	P	L	H	P	D	H	E	F	D
Template Known Secondary structure		T	T	S	S															S										S														T	S		T	T	S	S		S									S	S			T	T	T	S	G	G	G	S		S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.
																			212	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.													.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.						.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	W	I	R	L	E	G	G	E	G	S	V	K	A	A	R	E	L	L	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	V	A	G	Q	F	W	Q	Q	L	R	E	Q	Q	L	P	F	F	.	.	.	.	.	S	L	P	G	T
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	T	R	L	P	Q	S	C	G	S	V	L	Y	C	L	E	L	G	L	H	Y	R	D	S	D	S	N	S	T	I	D	K	R	V	E	R	L	I	G	R	L	R	F	N	E	G	L	R	F	E	V	D	L	P	Y	V	D	F	L	L	R	V	K	R	S	E	E	I	A	K	E	N	G	T	W	E	T	P	H	P
Template Known Secondary structure		G	G	G	S		T	T			S													T	T	S														T	T					T	T														T	T	T										T	T		S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		302	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
		258	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	W	R	I	S	L	P	S	D	A	P	M	M	D	L	P	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	Q	L	I	D	W	G	G	A	L	R	W	L	K	S	T	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	L	N	L	F	V	S	K	R	D	I	G	D	F	N	R	T	V	F	K	E	L	V	K	N	G	V	N	G	P	X	L	V	Y	P	L	L	R	S	R	W	D	D	R	T	S	V	V	I	P	E	E	G	E	I	F	Y	I	V	A	L	L	R	F	V	P	P	C	A	K	V	S	S	V	E	K	X	V	A	Q
Template Known Secondary structure																								T	T	T			S	S									G	G	G	S		T	T	S	S					S	S		S													T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.
		293	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.					.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.
Query Sequence		D	N	Q	I	H	R	I	A	R	N	A	G	G	.	.	.	.	H	A	T	R	F	S	A	G	D	G	G	F	A	P	L	S	A	P	L	F	R	Y	H	Q	Q	L	K	Q	Q	L	D	P	C	G	V	F	N	P	G	R	M	Y
Query Conservation															.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.																	.
Template Conservation																																			.
Template Sequence		N	Q	E	I	V	H	W	C	V	K	N	G	I	D	Y	K	L	Y	L	P	H	Y	K	S	Q	E	E	W	I	R	H	F	G	.	N	R	W	S	R	F	V	D	R	K	A	X	F	D	P	X	A	I	L	S	P	G	Q	K	I
Template Known Secondary structure												T	T						S	S					S									G	.	G	G													T	T			B		G	G	G		S
Template Predicted Secondary structure																																			.
Template SS confidence
		462	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.		.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.