Job Description P52073 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:05:09 GMT 2012 Rank 10 Aligned Residues 336 % Identity 15% Template c1zr6A_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:glucooligosaccharide oxidase; PDBTitle: the crystal structure of an acremonium strictum glucooligosaccharide2 oxidase reveals a novel flavinylation Resolution 1.55 Å

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		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.				40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.	.
Query SS confidence																																				.	.	.
Query Sequence		D	Y	S	Q	A	L	L	E	Q	V	N	Q	A	I	S	D	K	T	P	L	V	I	Q	G	S	N	S	K	A	F	L	G	R	P	.	.	.	V	T	G	Q	T	L	D	V	R	C	H	R	G	I	V	N	Y	D	P	T	E	L	V	I	T	A	R	V	G	T	P	L	V	T	I	E	A	A	L	E	S	A	G
Query Conservation																																				.	.	.
Alig confidence																																				.	.	.															.				.
Template Conservation																																																					.				.
Template Sequence		R	S	T	E	D	I	A	A	A	V	Q	C	G	L	D	A	G	V	Q	I	S	A	K	G	G	G	H	S	Y	G	S	Y	G	F	G	G	E	D	G	H	L	M	L	E	L	D	R	M	Y	R	V	.	S	V	D	.	D	N	N	V	A	T	I	Q	G	G	A	R	L	G	Y	T	A	L	E	L	L	D	Q	G
Template Known Secondary structure			S															T							S	S				T	T		T	T	T	T	S	S	S	S							T	T					.				.	T	T	S						T	T		B											T	T
Template Predicted Secondary structure																																																					.				.
Template SS confidence
		44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.		.	.	.		.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	M	L	P	C	E	P	P	H	Y	G	E	E	A	T	W	G	G	M	V	A	C	G	L	A	G	P	R	R	P	W	S	G	S	V	R	D	F	V	L	G	T	R	I	I	T	G	A	G	K	H	L	R	F	G	G	E	V	M	K	N	V	A	G	Y	D	L	S	R	L	M	V	G	S	Y	G	C	L	G	V
Query Conservation
Alig confidence											.	.																																															.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.																																															.	.	.	.	.
Template Sequence		N	R	A	L	S	H	G	T	C	.	.	P	A	V	G	V	G	G	H	V	L	G	G	G	Y	G	F	A	T	H	T	H	G	L	T	L	D	W	L	I	G	A	T	V	V	L	A	D	A	S	I	V	H	V	S	E	T	.	.	.	.	.	E	N	A	D	L	F	W	A	L	R	G	G	G	G	G	F	A	I
Template Known Secondary structure		S							S		.	.	T	T	S	B											S	T	T							G	G	G	G									T	T	S						B	T	T	.	.	.	.	.	B	S								T	T			S	S	S
Template Predicted Secondary structure											.	.																																															.	.	.	.	.
Template SS confidence
		122	.	.	.	.	.	.	.	130			.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.						.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.						.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.						.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.
Query Sequence		L	T	E	I	S	M	K	V	L	P	R	P	R	A	S	L	S	L	R	R	E	I	S	L	.	.	.	.	.	Q	E	A	M	S	E	I	A	E	W	Q	L	Q	P	L	P	I	S	G	L	C	Y	F	D	N	.	.	.	.	.	A	L	W	I	R	L	E	G	G	E	G	S	V	K	A	A	R	E	L	L	G
Query Conservation																										.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	S	E	F	E	F	N	T	F	E	A	P	E	I	I	T	T	Y	Q	V	T	T	T	W	N	R	K	Q	H	V	A	G	L	K	A	L	Q	D	W	A	Q	N	T	M	P	R	E	L	S	M	R	L	E	I	N	A	N	A	L	N	W	E	G	N	F	F	G	N	A	K	D	L	K	K	I	L	Q	P	I	M
Template Known Secondary structure														S																														T			T	T	B								T	T									S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		195	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.
																																																						233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	E	V	A	G	Q	F	W	Q	Q	L	R	E	Q	Q	L	P	F	F	S	L	P	G	T	L	W	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	K	A	G	G	K	S	T	I	S	K	L	V	E	T	D	W	Y	G	Q	I	N	T	Y	L	Y	G	A	D	L	N	I	T	Y	N	Y	D	V	H	E	Y	F	Y	A	N	S	L	T	A	P	R	L	S	D	E	A	I	Q	A	F	V	D	Y	K	F	D	N	S	S	V	R	P	G	R	G	W	W	I	Q	W
Template Known Secondary structure				T	T	S																	T	T	S		T	T			S	S		S	S						B										S	S																S					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.
		261	.	.	.	.	.				.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.										.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure								.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	S	L	P	S	D	.	.	.	A	P	M	M	D	L	P	G	E	Q	L	I	D	W	G	G	A	L	R	W	L	K	S	T	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	N	Q	I	H	R	I	A	R	N	A	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	A	T	R	F	S
Query Conservation								.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	F	H	G	G	K	N	S	A	L	A	A	V	S	N	D	E	T	A	Y	A	H	R	D	Q	L	W	L	W	Q	F	Y	D	S	I	Y	D	Y	E	N	N	T	S	P	Y	P	E	S	G	F	E	F	M	Q	G	F	V	A	T	I	E	D	T	L	P	E	D	R	K	G	K	Y	F	N	Y	A	D	T	T	L
Template Known Secondary structure						S	T	T		S	G	G	G	S		T	T	T	S	S				T	T		S										T	T	T	T	T			T	T	T	T	T	S														T	T	S		G	G	G		B			G	G	G			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		355	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	G	D	G	G	F	A	P	L	S	A	P	L	F	R	Y	H	Q	Q	L	K	Q	Q	L	D	P	C	G	V	F	N	P	G	R	M	Y	A	E	L
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		T	K	E	E	A	Q	K	L	Y	W	R	G	N	L	E	K	L	Q	A	I	K	A	K	Y	D	P	E	D	V	F	G	N	V	V	S	V	E	P	I
Template Known Secondary structure												G	G	G													T	T		T	T			T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		435	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.