Job Description P52073 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:05:09 GMT 2012 Rank 15 Aligned Residues 338 % Identity 16% Template c1i19B_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: B: PDB Molecule:cholesterol oxidase; PDBTitle: crystal structure of cholesterol oxidase from b.sterolicum Resolution 1.70 Å

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		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.								.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.		.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.												.
Query SS confidence																																									.	.	.	.	.	.	.												.
Query Sequence		E	C	D	Y	S	Q	A	L	L	E	Q	V	N	Q	A	I	S	D	K	T	P	L	V	I	Q	G	S	N	S	K	A	F	L	G	R	P	V	T	G	.	.	.	.	.	.	.	Q	T	L	D	V	R	C	H	R	G	I	.	V	N	Y	D	P	T	E	L	V	I	T	A	R	V	G	T	P	L	V	T	I	E
Query Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.												.
Alig confidence																																									.	.	.	.	.	.	.												.
Template Conservation
Template Sequence		S	P	K	T	P	Q	D	V	V	R	L	A	N	W	A	H	E	H	D	Y	K	I	R	P	R	G	A	M	H	G	W	T	P	L	T	V	E	K	G	A	N	V	E	K	V	I	L	A	D	T	M	T	H	L	N	G	I	T	V	N	T	G	G	P	V	A	T	V	T	A	G	A	G	A	S	I	E	A	I	V
Template Known Secondary structure				S	S															T								S					S	S	S	S			T	T				T	T						S	T	T	T										S	S	S							T	T	S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.
		76	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.											.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	A	L	E	S	A	G	Q	M	L	P	C	E	P	P	H	Y	G	E	E	A	T	W	G	G	M	V	A	C	G	L	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	R	R	P	W	S	G	S	V	R	D	F	V	L	G	T	R	I	I	T	G	A	G	K	H	L	R	F	G	G	E	V	M	K	N	V	A
Query Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.																																																									.	.	.	.	.
Template Sequence		T	E	L	Q	K	H	D	L	G	W	A	N	L	P	A	P	.	.	G	V	L	S	I	G	G	A	L	A	V	N	A	H	G	A	A	L	P	A	V	G	Q	T	T	L	P	G	H	T	Y	G	S	L	S	N	L	V	T	E	L	T	A	V	V	W	N	G	T	T	Y	A	L	E	T	Y	.	.	.	.	.	Q
Template Known Secondary structure						T	T	T				S	S			S		.	.	T	T	S	B							T	T				S					T	T					T	T			S	S		G	G	G	G											S	S	S							.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																		.	.																																																									.	.	.	.	.
Template SS confidence
		173	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.			.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.						.
		146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190										.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	Y	D	L	S	R	L	M	V	G	S	Y	G	C	L	G	V	L	T	E	I	S	M	K	V	L	P	R	P	R	A	S	L	S	L	R	R	E	I	S	L	Q	E	A	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	E	I	A	E	W	Q	L	Q	P	L	P	I	S	G	L	C	Y	F	D	N	A	L	W	I	R
Query Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	N	D	P	R	I	T	P	L	L	T	N	L	G	R	C	F	L	T	S	V	T	M	Q	A	G	P	N	F	R	Q	R	C	Q	S	Y	T	D	I	P	W	R	E	L	F	A	P	K	G	A	D	G	R	T	F	E	K	F	V	A	E	S	G	G	A	E	A	I	W	Y	P	F	T	E	K	P	W	M	K	V
Template Known Secondary structure		T	T		T	T	S					S		T	T	S	S																							S						T			T	T		S	S	S										S								T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
		217	.	.	220	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	E	G	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	V	K	A	A	R	E	L	L	G	G	E	E	V	A	G	Q	F	W	Q	Q	L	R	E	Q	Q	L	P	F	F	S	L	P	G	T	L	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	T	V	S	V	G	K	P	P	Q	A	R	E	V	S	G	P	Y	N	Y	I	F	S	D	N	L	P	E	P	I	T	D	M	I	G	A	I	N	A	G	N	P	G	I	A	P	L	F	G	P	A	M	Y	E	I	T	K	L	G	L	A	A	T	N	A	N	D	I	W	G	W	S	K	D	V	Q	F	Y	I	K
Template Known Secondary structure										T	T	S				S	S	S								S														T	T		G	G	G																			T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
											260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	I	S	L	P	S	D	A	P	M	M	D	L	P	G	E	Q	L	I	D	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	A	L	R	W	L	K	S	T	A	E	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	T	T	L	R	L	T	E	G	G	G	A	V	V	T	S	R	A	N	I	A	T	V	I	N	D	F	T	E	W	F	H	E	R	I	E	F	Y	R	A	K	G	E	F	P	L	N	G	P	V	E	I	R	C	C	G	L	D	Q	A	A	D	V	K	V	P	S	V	G	P	P	T	I	S	A	T	R	P	R	P
Template Known Secondary structure		T	T	S														G	G	G																						T	T						S												G	G	G			S			S		S		T	T		T	T				T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		425	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.
																												294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	Q	I	H	R	I	A	R	N	A	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	A	T	R	F	S	A	G	D	G	G	F	A	P	L	S	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	H	P	D	W	D	V	A	I	W	L	N	V	L	G	V	P	G	T	P	G	M	F	E	F	Y	R	E	M	E	Q	W	M	R	S	H	Y	N	N	D	D	A	T	F	R	P	E	W	S	K	G	W	A	F	G	P	D	P	Y	T	D	N	D	I	V	T	N	K	M	R	A	T	Y	I	E	G	V	P	T	T
Template Known Secondary structure		T		T	T													T	T		T	T																S	B	S	S	S							T	T	S			S		S	S	S	T	T								T						T	T	T	T	S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		505	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.		.	.			.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.			.	.
Query SS confidence																					.			.	.
Query Sequence		P	L	F	R	Y	H	Q	Q	L	K	Q	Q	L	D	P	C	G	V	F	.	N	P	.	.	G	R	M	Y	A
Query Conservation																					.			.	.
Alig confidence																					.			.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	N	W	D	T	A	R	A	R	Y	N	Q	I	D	P	H	R	V	F	T	N	G	F	M	D	K	L	L	P
Template Known Secondary structure		S	S													T	T			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		585	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.