Job Description P52073 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:05:09 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 328 % Identity 18% Template c1f0xA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:d-lactate dehydrogenase; PDBTitle: crystal structure of d-lactate dehydrogenase, a peripheral2 membrane respiratory enzyme. Resolution 1.90 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40								.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	Y	S	Q	A	L	L	E	Q	V	N	Q	A	I	S	D	K	T	P	L	V	I	Q	G	S	N	S	K	A	F	L	G	R	P	V	.	.	.	.	.	.	.	T	G	Q	T	L	D	V	R	C	H	R	G	I	V	N	Y	D	P	T	E	L	V	I	T	A	R	V	G	T	P	L	V	T	I	E	A	A	L
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																					.	.	.	.	.	.	.																								.
Template Conservation																																																																			.
Template Sequence		G	S	L	L	E	L	W	R	V	L	K	A	C	V	T	A	D	K	I	I	L	M	Q	A	A	N	T	G	L	T	E	G	S	T	P	N	G	N	D	Y	D	R	D	V	V	I	I	S	T	L	R	L	D	K	L	H	V	L	G	K	G	E	Q	V	L	.	A	Y	P	G	T	T	L	Y	S	L	E	K	A	L
Template Known Secondary structure		S	S														T	T							S	S				S	S	S	T	T	S			B	S			S	S								T	T								T	T	T	T				.			T	T		B
Template Predicted Secondary structure																																																																			.
Template SS confidence
		53	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.		.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	S	A	G	Q	M	L	P	C	E	P	P	H	Y	G	E	E	A	T	W	G	G	M	V	A	C	G	L	A	G	P	R	R	P	W	S	G	S	V	R	D	F	V	L	G	T	R	I	I	T	G	A	G	K	H	L	R	F	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	P	L	G	R	E	P	H	S	V	I	G	S	S	C	I	G	A	S	V	I	G	G	I	C	N	N	S	G	G	S	L	V	Q	R	G	P	A	Y	T	E	M	S	L	F	A	R	I	N	E	D	G	K	L	T	L	V	N	H	L	G	I	D	L	G	E	T	P	E	Q	I	L	S	K	L	D	D	D	R	I
Template Known Secondary structure		G	G	G	T				S				G	G	G	G	G	T		B							T	T				S		T	T	S		S	S			S									T	T	S								S	S	B				S	S										T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		132	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.
																							138	.	140	.	.	.	.	.	.	.						.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	V	M	K	N	V	A	G	Y	.	.	.	.	.	D	L	S	R	L	M	V	G	S	Y	G	C	L	G	V	L	T	E	I	S	M	K	V	L	P	R	P	R	A	S	L	S	L	R	R	E	I	S	L	Q	E	A	M	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.																		.
Template Conservation																																																							.
Template Sequence		K	D	D	D	V	R	H	D	G	R	H	A	H	D	Y	D	Y	V	H	R	V	R	D	I	E	A	D	T	P	A	R	Y	N	A	D	P	D	R	L	F	E	S	S	G	C	A	G	K	L	A	V	F	A	.	V	R	L	D	T	F	E	A	E	K	N	Q	Q	V	F	Y	I	G	T	N	Q	P	E	V	L	T
Template Known Secondary structure			G	G	G	B				S			S	S		T	T								T	T		S	S		S			T	T		G	G	G			S	S	T	T		T	T	S	S					.										S	S									S
Template Predicted Secondary structure																																																							.
Template SS confidence
		212	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.		.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290
		192	.	.	.	.	.	.	.			200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.						.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.							.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	I	A	E	W	Q	L	Q	.	.	P	L	P	I	S	G	L	C	Y	F	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	A	L	W	I	R	L	E	G	G	E	.	.	.	.	.	G	S	V	K	A	A	R	E	L	L	G	.	.	.	.	.	.	G	E	E	V	A
Query Conservation										.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	I	R	R	H	I	L	A	N	F	E	N	L	P	V	A	G	E	Y	M	H	R	D	I	Y	D	I	A	E	L	P	P	R	M	K	N	W	R	D	K	Y	E	H	H	L	L	L	K	M	A	G	D	G	V	G	E	A	K	S	W	L	V	D	Y	F	K	Q	A	E	G	D	F	F	V	C	T	P	E	E	G
Template Known Secondary structure												S	S			S																											S									T	T																S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
		238	.	240	.	.	.	.										.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	Q	F	W	Q	Q	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	E	Q	Q	L	P	F	F	S	L	P	G	T	L	W	R	I	S	L	P	S	D	A	P	M	M	D	L	P	G	E	Q	L	I	D	W	G	G	A	L	R	W	L	K	S	T	A	E	D	N	Q	I	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	K	A	F	L	H	R	F	A	A	A	G	A	A	I	R	Y	Q	A	V	H	S	D	E	V	E	D	I	L	A	L	D	I	A	L	R	R	N	D	T	E	W	Y	E	H	L	P	P	E	I	D	S	Q	L	V	H	K	L	Y	Y	G	H	F	M	C	Y	V	F	H	Q	D	Y	I	V	K	K	G	V	D	V
Template Known Secondary structure									T	T												T	T	T	T													T	T		S			S									T	T										T	T	T	T										T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		428	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.
										298	.	300	.	.	.	.	.						.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	R	I	A	R	N	A	G	G	.	.	.	.	.	H	A	T	R	F	S	A	G	D	G	G	F	A	P	L	S	A	P	L	F	R	Y	H	Q	Q	L	K	Q	Q	L	D	P	C	G	V	F	N	P	G	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	A	L	K	E	Q	M	L	E	L	L	Q	Q	R	G	A	Q	Y	P	A	E	H	N	V	G	H	L	Y	K	A	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	T	L	Q	K	F	Y	R	E	N	D	P	T	N	S	M	N	P	G	I
Template Known Secondary structure															T	T		B	S		S	S	S			T	T	T	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	T			B	S	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		508	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.											.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.