Job Description P52073 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:05:09 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 344 % Identity 17% Template c1ahuB_ PDB info PDB header:flavoenzyme Chain: B: PDB Molecule:vanillyl-alcohol oxidase; PDBTitle: structure of the octameric flavoenzyme vanillyl-alcohol2 oxidase in complex with p-cresol Resolution 2.70 Å

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		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.					.	.	.	.	.	.	.		.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.								.
Query SS confidence																																						.	.	.	.								.
Query Sequence		D	Y	S	Q	A	L	L	E	Q	V	N	Q	A	I	S	D	K	T	P	L	V	I	Q	G	S	N	S	K	A	F	L	G	R	P	V	T	.	.	.	.	G	Q	T	L	D	V	R	.	C	H	R	G	I	V	N	Y	D	P	T	E	L	V	I	T	A	R	V	G	T	P	L	V	T	I	E	A	A	L	E	S
Query Conservation																																						.	.	.	.								.
Alig confidence																																						.	.	.	.								.
Template Conservation
Template Sequence		R	N	V	A	D	V	Q	S	I	V	G	L	A	N	K	F	S	F	P	L	W	P	I	S	I	G	R	N	S	G	Y	G	G	A	A	P	R	V	S	G	S	V	V	L	D	M	G	K	N	M	N	R	V	L	E	V	N	V	E	G	A	Y	C	V	V	E	P	G	V	T	Y	H	D	L	H	N	Y	L	E	A
Template Known Secondary structure		S	S															T							S	S	S			T	T	T	T	T	T			S	S	T	T							T	T	T									T	T	T	T						T	T		B										T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	G	Q	M	L	P	C	E	P	P	H	Y	G	E	E	A	T	W	G	G	M	V	A	C	G	L	A	G	P	R	R	P	W	S	G	S	V	R	D	F	V	L	G	T	R	I	I	T	G	A	G	K	H	L	R	F	G	G	E	V	M	K	N	V	A	G	Y	D	L	S	R	L	M	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.																																																													.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.
Template Sequence		N	N	L	R	D	K	L	W	L	D	V	P	.	D	L	G	G	G	S	V	L	G	N	A	V	E	R	G	V	G	Y	T	P	Y	G	D	H	W	M	M	H	S	G	M	E	V	V	L	A	N	G	E	L	L	R	T	G	M	G	A	L	P	D	P	K	R	P	E	T	M	G	L	K	P	E	D	Q	P	W	S
Template Known Secondary structure		T	T	G	G	G	T							.	S		S	S	S	B								T		B		S	S	T	T		B	T	G	G	G									T	T	S						G	G	G	G	S						T	T	T	T	T			T	T	T
Template Predicted Secondary structure														.
Template SS confidence
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.		170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
																		154	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.					.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.																									.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.																									.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	G	S	Y	G	C	L	G	V	L	T	E	I	S	M	K	V	L	P	R	P	R	A	S	L	S	L	R	R	E	I	S	L	.	.	.	.	Q	E	A	M	S	E	I	A	E	W	Q	L	Q	P	L	P	I	S	G	L	C	Y	F	D	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.																									.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.																									.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	I	A	H	L	F	P	Y	G	F	G	P	Y	I	D	G	L	F	S	Q	S	N	M	G	I	V	T	K	I	G	I	W	L	M	P	N	P	R	G	Y	Q	S	Y	L	I	T	L	P	K	D	G	D	L	K	Q	A	V	D	I	I	R	P	L	R	L	G	M	A	L	Q	N	V	P	T	I	R	H	I	L	L
Template Known Secondary structure		S	G	G	G	T		S			S	S				G	G	G	G	S	S	S	S	S															S											S	T	T																T		S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
																																				211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.																.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	A	L	W	I	R	L	E	G	G	E	G	S	V	K	A	A	R	E	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	E	E	V	A	G	Q	F	W
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	A	A	V	L	G	D	K	R	S	Y	S	S	R	T	E	P	L	S	D	E	E	L	D	K	I	A	K	Q	L	N	L	G	R	W	N	F	Y	G	A	L	Y	G	P	E	P	I	R	R	V	L	W	E	T	I	K	D	A	F	S	A	I	P	G	V	K	F	Y	F	P	E	D	T	P	E	N	S	V	L	R
Template Known Secondary structure							S		S	T	T	T				S	S															T			S									S																G	G	G	S	T	T						G	G	G	S		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
		242	.	.	.	.	.											.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.					.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	Q	L	R	E	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	L	P	F	F	S	L	P	G	T	L	W	R	I	S	L	P	S	.	.	.	.	D	A	P	M	M	D	L	P	G	E	Q	L	I	D	W	G	G	A	L	R	W	L	K	S	T	A	E	D	N	Q	I	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	R	D	K	T	M	Q	G	I	P	T	Y	D	E	L	K	W	I	D	W	L	P	N	G	A	H	L	F	F	S	P	I	A	K	V	S	G	E	D	A	M	M	Q	Y	A	V	T	K	K	R	C	Q	E	A	G	L	D	F	I	G	T	F	T	V	G	M	R	E	M	H	H	I	V	C	I	V	F	N	K	K
Template Known Secondary structure							T	T	T					G	G	G	G	G	G	G	S	S	S	S								B				S																			T	T											S	S	S											T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		397	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.
																		298	.	300	.	.	.	.	.						.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.			.	.	.	.	350
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.																																									.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.																																									.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	I	A	R	N	A	G	G	.	.	.	.	.	H	A	T	R	F	S	A	G	D	G	G	F	A	P	L	S	A	P	L	F	R	Y	H	Q	Q	L	K	Q	Q	L	D	P	C	G	V	F	N	P	G	R	.	.	M	Y	A	E	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.																																									.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.																																									.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	L	I	Q	K	R	K	V	Q	W	L	M	R	T	L	I	D	D	C	A	A	N	G	W	G	E	Y	R	T	H	L	A	F	M	D	Q	I	M	E	T	Y	N	W	N	N	S	S	F	L	R	F	N	E	V	L	K	N	A	V	D	P	N	G	I	I	A	P	G	K	S	G	V	W	P	S	Q
Template Known Secondary structure																							T	T			B	S				G	G	G																												T	T			B		T	T	G	G	G				T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		477	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.