Job Description P76192 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:20:18 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 601 % Identity 29% Template c1b4nD_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: D: PDB Molecule:formaldehyde ferredoxin oxidoreductase; PDBTitle: formaldehyde ferredoxin oxidoreductase from pyrococcus furiosus,2 complexed with glutarate Resolution 2.40 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.			.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.
Query SS confidence																							.	.
Query Sequence		A	N	G	W	T	G	N	I	L	R	V	N	L	T	T	G	N	I	T	L	E	.	.	D	S	S	K	F	K	S	F	V	G	G	M	G	F	G	Y	K	I	M	Y	D	E	V	P	P	G	T	K	P	F	D	E	A	N	K	L	V	F	A	T	G	P	L	T	G	S	G	A	P	C	S	S	R	V	N	I	T
Query Conservation																							.	.
Alig confidence																							.	.																									.
Template Conservation																																																	.
Template Sequence		M	Y	G	W	W	G	R	I	L	R	V	N	L	T	T	G	E	V	K	V	Q	E	Y	P	E	E	V	A	K	K	F	I	G	G	R	G	L	A	A	W	I	L	W	N	E	A	R	.	G	V	E	P	L	S	P	E	N	K	L	I	F	A	A	G	P	F	N	G	L	P	T	P	S	G	G	K	L	V	V	A
Template Known Secondary structure				S										T	T	T																		S	T													T	.	T			T	T	S	T	T	S								T	T	T	T	S			T	T
Template Predicted Secondary structure																																																	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.		.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	L	S	T	F	T	K	G	N	L	V	V	D	A	H	M	G	G	F	F	A	A	Q	M	K	F	A	G	Y	D	V	I	I	I	E	G	K	A	K	S	P	V	W	L	K	I	K	D	D	K	V	S	L	E	K	A	D	F	L	W	G	K	G	T	R	A	T	T	E	E	I	C	R	L	T	S	P	E	T	C
Query Conservation
Alig confidence								.	.
Template Conservation								.	.
Template Sequence		A	K	S	P	L	T	.	.	G	G	Y	G	D	G	N	L	G	T	M	A	S	V	H	L	R	R	A	G	Y	D	A	L	V	V	E	G	K	A	K	K	P	V	Y	I	Y	I	E	D	D	N	V	S	I	L	S	A	E	G	L	W	G	K	T	T	F	E	T	E	R	E	L	K	E	I	H	G	K	N	V	G
Template Known Secondary structure					T	T	T	.	.	S	S																	T	T		S						S			S	S								T	T								T	T	T	T	T																S	S	S
Template Predicted Secondary structure								.	.
Template SS confidence
		80	.	.	.	.	.			.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.		.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.
Query SS confidence																									.
Query Sequence		V	A	A	I	G	Q	A	G	E	N	L	V	P	L	S	G	M	L	N	S	R	N	H	.	S	G	G	A	G	T	G	A	I	M	G	S	K	N	L	K	A	I	A	V	E	G	T	K	G	V	N	I	A	D	R	Q	E	M	K	R	L	N	D	Y	M	M	T	E	L	I	G	A	N	N	N	H	V	V	P	S
Query Conservation																									.
Alig confidence																									.																																																		.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	L	T	I	G	P	A	G	E	N	L	V	K	Y	A	V	V	I	S	Q	E	G	R	A	A	G	R	P	G	M	G	A	V	M	G	S	K	K	L	K	A	V	V	I	R	G	T	K	E	I	P	V	A	D	K	E	E	L	K	K	L	S	Q	E	A	Y	N	E	I	L	N	S	P	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure											T	T		T	T	B					T	T	T					T	T	T								T	T															S																		S	S	T	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	P	Q	S	W	A	E	Y	S	D	P	K	S	R	W	T	A	R	K	G	L	F	W	G	A	A	E	G	G	P	I	E	T	G	E	I	P	P	G	N	Q	N	T	V	G	F	R	T	Y	K	S	V	F	D	L	G	P	A	A	E	K	Y	T	V	K	M	S	G	C	H	S	C	P	I	R	C	M	T	Q	M
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.
Template Sequence		G	Y	P	F	W	K	R	Q	G	T	M	A	A	V	E	W	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	T	N	Y	A	L	P	T	R	N	F	S	D	G	Y	F	E	F	A	R	S	I	D	G	Y	T	M	.	.	E	G	M	K	V	Q	Q	R	G	C	P	Y	C	N	M	P	C	G	N	V	V
Template Known Secondary structure		T								G	G	G	G						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T		S		B	T	T	T	T	B	S			T	T	G	G	G	G	S					.	.		T	T								T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.
Template SS confidence
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.														.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.			.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	I	P	R	V	K	E	F	G	V	P	S	T	G	G	N	T	C	V	A	N	F	V	H	T	T	I	F	P	N	G	P	K	D	F	E	D	K	D	D	G	R	V	I	G	N	L	V	G	L	N	L	F	D	D	Y	G	L	W	C	N	Y	G	Q	L	H	R	D	F	T	Y	C	Y	S	K	G	V	F	K	R
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.	.														.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.														.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	D	A	E	G	Q	E	S	E	.	.	.	.	.	L	D	Y	E	N	V	A	L	L	G	S	N	L	.	.	.	G	I	G	K	L	N	E	V	S	V	L	N	R	I	A	D	E	M	G	M	D	T	I	.	.	.	.	.	.	.	S	L	G	V	S	I	A	H	V	M	E	A	V	E	R	G	I	L	K	E
Template Known Secondary structure				T	T	S					.	.	.	.	.										T	G	G	G	.	.	.	T																	T	T	B				.	.	.	.	.	.	.															T	T	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.														.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		296	.	.	.	300	.	.	.	.						.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.				.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340								.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
		399	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.		.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.					.	.	.	.	.	.	470	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.																															.	.	.	.
Query SS confidence																																					.																															.	.	.	.
Query Sequence		V	L	P	A	E	E	Y	A	E	I	R	W	D	Q	L	E	A	G	D	V	N	F	I	K	D	F	Y	Y	R	L	A	H	R	V	G	.	E	L	S	H	L	A	D	G	S	Y	A	I	A	E	R	W	N	L	G	E	E	Y	W	G	Y	A	K	N	K	L	.	.	.	.	W	S	P	F	G	Y	P	V	H	H
Query Conservation																																					.																															.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.																		.	.												.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	P	T	F	G	D	F	K	G	A	K	Q	L	A	L	D	I	A	Y	R	K	G	E	L	G	N	L	A	A	E	G	V	K	A	M	A	E	K	L	G	.	.	T	H	D	F	A	M	H	V	K	G	L	E	V	S	G	Y	N	C	Y	I	Y	P	A	M	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S			T	T														T	T									T	T										T	.	.		G	G	G					T	T					S				S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.
Template SS confidence
															361	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400			.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.
		474	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	N	E	A	S	A	Q	V	G	S	I	V	N	C	M	F	N	R	D	C	M	T	H	T	H	I	N	F	I	G	S	G	L	P	L	K	L	Q	R	E	V	A	K	E	L	F	G	S	E	D	A	Y	D	E	T	K	N	Y	T	P	I	N	D	A	K	I	K	Y	A	K	W	S	L	L	R	V	C	L	H	N
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.
Template Sequence		L	A	Y	G	T	S	A	I	G	A	H	H	K	E	A	W	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	A	W	E	I	G	T	A	P	I	E	Y	K	I	S	Y	D	.	.	.	.	P	I	K	A	Q	K	V	V	E	L	Q	R	L	R	G	G	L	F	E
Template Known Secondary structure								T	T	S	S		S	S	S			T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T			T	T								.	.	.	.	T														T	T
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.
Template SS confidence
		426	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.					460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.
		554	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	V	T	L	C	N	W	V	W	P	M	T	V	S	P	L	K	S	R	N	Y	R	G	D	L	A	L	E	A	K	F	F	K	A	I	T	G	E	E	M	T	Q	E	K	L	D	L	A	A	E	R	I	F	T	L	H	R	A	Y	T	V	K	L	M	Q	T	K	D	M	R	N	E	H	D	L	I	C	S	W	V
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.
Template Sequence		M	L	T	A	C	R	L	P	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	E	V	G	L	S	L	D	Y	Y	P	K	L	L	K	A	I	T	G	V	T	Y	T	W	D	D	L	Y	K	A	A	D	R	V	Y	S	L	I	R	A	Y	W	V	R	E	F	N	G	K	.	W	D	R	K	M	D	Y	P	P	K	R	W
Template Known Secondary structure				T			S				.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T											S																											T	T	T		.			G	G	G	G				T
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.
Template SS confidence
		487	.	.	490	.	.	.	.	.										.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.		.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.
		634		.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.
Query SS confidence			.
Query Sequence		F	.	D	K	D	P	Q	I	P	V	F	T	E	G	T	D	K	M	D	R	D	D	M	H	A	S	L	T	M	F	Y	K	E	M	G	W	D	P	Q	L	G	C	P	T	R	E	T	L	Q	R	L	G	L	E	D	I	A	A	D	L	A	A	H	N	L	L
Query Conservation			.
Alig confidence			.								.	.	.																												.
Template Conservation											.	.	.																												.
Template Sequence		F	T	E	G	L	K	S	G	P	.	.	.	H	K	G	E	H	L	D	E	K	K	Y	D	E	L	L	S	E	Y	Y	R	I	R	G	W	D	E	R	.	G	I	P	K	K	E	T	L	K	E	L	D	L	D	F	V	I	P	E	L	E	K	V	T	N	L
Template Known Secondary structure							S	S	S	T	.	.	.	T	T	T																				T	B		T	T	.	S		B								T	T		T	T						T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure											.	.	.																												.
Template SS confidence
		557	.	.	560	.	.	.	.	.				.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.		.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.