Job Description P76558 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:24:36 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 370 % Identity 27% Template c1o0sB_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: B: PDB Molecule:nad-dependent malic enzyme; PDBTitle: crystal structure of ascaris suum malic enzyme complexed with nadh Resolution 2.00 Å

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		33	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.				.	50	.	.	.	.	.	.	.	.		.	60	.	.	.			.	.														.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.											.						.	.			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.											.						.	.			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	D	L	A	L	A	Y	S	P	G	V	A	A	P	C	L	.	.	.	E	I	E	K	D	P	L	K	A	Y	.	K	Y	T	A	R	.	.	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	V	A	V	I	S	N	G	T	A	V	L	G	L	G	N	I	G	A	L	A	G	K	P	V	M	E	G
Query Conservation																		.	.	.											.						.	.			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.											.						.	.			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Conservation																																																																									.
Template Sequence		E	L	M	P	I	V	Y	T	P	T	V	G	L	A	C	Q	N	F	G	Y	I	Y	R	K	P	K	G	L	Y	I	T	I	N	D	N	S	V	S	K	I	Y	Q	I	L	S	N	W	H	E	E	D	V	R	A	I	V	V	T	D	G	E	R	I	L	G	L	G	D	L	G	A	.	Y	G	I	G	I	P	V	G
Template Known Secondary structure								S	T	T											S				S			S					T	T	S		S									T	T	S	S		S										S	T	T	B	T	T	T	B			G	G	.	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																																									.
Template SS confidence
		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190		.	.	.	.	.	.	.	.
		94	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.								.	.	.	.	110	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	G	V	L	F	K	K	F	A	G	I	D	.	.	.	.	.	.	.	V	F	D	I	E	V	D	E	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	K	F	I	E	V	V	A	A	L	E	P	T	F	G	G	I	N	L	E	D	I	K	A	P	E	C
Query Conservation														.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	L	A	L	Y	V	A	L	G	G	V	Q	P	K	W	C	L	P	V	L	L	D	V	G	T	N	N	M	D	L	L	N	D	P	F	Y	I	G	L	R	H	K	R	V	R	G	K	D	Y	D	T	L	L	D	N	F	M	K	A	C	T	K	K	Y	G	Q	K	T	L	I	Q	F	E	D	F	A	N	P	N	A
Template Known Secondary structure														G	G	G								S											T	T			S		S	S					S																				T	T							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		199	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.
		144	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.									.	.
Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	Y	I	E	Q	K	L	R	E	R	M	N	I	P	V	F	H	D	D	Q	H	G	T	A	I	I	S	T	A	A	I	L	N	G	L	R	V	V	E	K	N	I	S	D	V	R	M	V	V	S	G	A	G	A	A	A	I	A	C	M	N	L	L	V	A	L	G	L	Q	K	.	.	.	.	.	.	.	.	H	N
Query Conservation																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.																																																											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.
Template Sequence		F	R	L	L	D	K	Y	Q	D	K	.	.	Y	T	M	F	N	D	D	I	Q	G	T	A	S	V	I	V	A	G	L	L	T	C	T	R	V	T	K	K	L	V	S	Q	E	K	Y	L	F	F	G	A	G	A	A	S	T	G	I	A	E	M	I	V	H	Q	M	Q	N	E	G	I	S	K	E	E	A	C	N	R
Template Known Secondary structure									T	T	T	.	.	S	S																									T			G	G	G									S																T	T	T									T
Template Predicted Secondary structure												.	.
Template SS confidence
		279	280	.	.	.	.	.	.	.	.			.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
		216	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.			.	.	.	.	260	.	.	.	.	.		.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.				.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.											.														.	.	.
Query SS confidence																																										.	.											.														.	.	.
Query Sequence		I	V	V	C	D	S	K	G	V	I	Y	Q	G	R	E	P	N	M	A	E	T	K	A	A	Y	A	V	V	D	D	G	K	R	T	L	D	D	V	I	E	.	.	G	A	D	I	F	L	G	C	S	G	.	P	K	V	L	T	Q	E	M	V	K	K	M	A	.	.	.	R	A	P	M	I	L	A	L	A	N	P
Query Conservation																																										.	.											.														.	.	.
Alig confidence																		.																								.	.											.														.	.	.
Template Conservation																		.
Template Sequence		I	Y	L	M	D	I	D	G	L	V	T	K	N	R	K	E	.	M	N	P	R	H	V	Q	F	A	K	D	M	P	E	T	T	S	I	L	E	V	I	R	A	A	R	P	G	A	L	I	G	A	S	T	V	R	G	A	F	N	E	E	V	I	R	A	M	A	E	I	N	E	R	P	I	I	F	A	L	S	N	P
Template Known Secondary structure							T	T				B	S	S		S	S	.			T	T	T	T	T	T		B	S	S																S						S	S		T	T		S													S	S								S	S
Template Predicted Secondary structure																		.
Template SS confidence
		357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.		.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.
		290			.	.	.	.	.	.	.	.	.		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310											.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.										.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.										.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	.	.	P	E	I	L	P	P	L	A	K	.	E	V	R	P	D	A	I	I	C	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	S	D	Y	P	N	Q	V	N	N	V	L	C	F	P	F	I	F	R	G	A	L	D	V	G	A	T	A	I	N	E	E	M	K	L	A	A	V	R	A	I	A	E	L	A	H
Query Conservation			.	.										.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.										.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	S	K	A	E	C	T	A	E	E	A	Y	T	F	T	N	G	A	A	L	Y	A	S	G	S	P	F	P	N	F	E	L	N	G	H	T	Y	K	P	G	Q	G	N	N	A	Y	I	F	P	G	V	A	L	G	T	I	L	F	Q	I	R	H	V	D	N	D	L	F	L	L	A	A	K	K	V	A	S	C	V	T
Template Known Secondary structure		G	G	G		S	S								T	T	T	S							S	S								T	T										G	G	G	T											T	T	B	S																	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		436	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.
		357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.		.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410			.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Predicted Secondary structure																																	.																								.	.
Query SS confidence																																	.																								.	.
Query Sequence		A	E	Q	S	E	V	V	A	S	A	Y	G	D	Q	D	L	S	F	G	P	E	Y	I	I	P	K	P	F	D	P	R	.	L	I	V	K	I	A	P	A	V	A	K	A	A	M	E	S	G	V	A	T	R	P	I	.	.	A	D	F	D	V	Y	I	D	K	L
Query Conservation																																	.																								.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.																								.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	K	V	G	R	V	Y	P	Q	L	K	E	I	R	E	I	S	I	Q	I	A	V	E	M	A	K	Y	C	Y	K	N	G	T	A	N	L	Y	P	Q	P	E	D	L	E	K	Y	V	R	A	Q
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T			S			G	G	G																			T	T		B		S	S	S			S	S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		516	.															.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.