Job Description P77783 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:32:48 GMT 2012 Rank 21 Aligned Residues 601 % Identity 23% Template d1vlfm2 SCOP info Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Resolution 2.00

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		59	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.															.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		C	T	V	N	C	G	S	R	C	L	L	R	L	H	V	K	D	D	T	V	Y	W	V	E	S	D	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	D	V	Y	G	N	H	Q	V	R	A	C	L	R	G	R	S	I	R	R	R	M	N	H	P	D	R	L	K	Y	P	M	K	R	V	G	K
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.
Template Sequence		L	T	.	N	S	S	T	G	G	P	V	F	V	Y	V	K	D	G	K	I	I	R	M	T	P	M	D	F	D	D	A	V	D	A	P	S	W	K	I	E	A	R	G	K	T	F	T	P	P	R	K	T	S	I	A	P	Y	T	A	G	F	K	S	M	I	Y	S	D	L	R	I	P	Y	P	M	K	R	K	S	F
Template Known Secondary structure				.				T	T									T	T									B			T	T	T	S									T	T							S	B									T	T					T		T	T	B			S					T	T
Template Predicted Secondary structure				.
Template SS confidence
		7	.		.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
		125	.	.	.	.																			130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.		.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.
Query Sequence		R	G	E	G	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	E	R	I	S	W	D	E	A	L	D	T	I	S	D	N	L	R	R	I	L	K	D	Y	G	N	E	A	V	H	V	L	Y	G	T	G	V	D	G	G	N	I	.	T	N	S	N	V	P	Y	R	L	M	N	S	C	G
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.
Template Conservation
Template Sequence		D	P	N	G	E	R	N	P	Q	L	R	G	A	G	L	S	K	Q	D	P	W	S	D	Y	E	R	I	S	W	D	E	A	T	D	I	V	V	A	E	I	N	R	I	K	H	A	Y	G	P	S	A	I	L	S	T	P	S	S	H	H	M	W	G	N	V	G	Y	R	H	S	T	Y	F	R	F	M	N	M	M	G
Template Known Secondary structure			T	T	S				G	G	G	T	T					T	T		G	G	G	G																								T		G	G	G							S				S		T	T	T	S	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
		186	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.									.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.			.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.
Query Sequence		G	F	L	S	R	Y	G	S	Y	S	T	A	Q	I	S	A	A	M	S	Y	M	F	G	.	.	.	.	.	.	.	.	A	N	D	G	N	S	P	D	D	I	A	N	T	K	L	V	V	M	F	G	N	N	P	A	E	T	R	M	S	.	.	G	G	G	V	T	Y	Y	V	E	Q	A	R	E	R	S	N	A	R
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.															.
Template Conservation																																																																														.
Template Sequence		F	T	Y	A	D	H	N	P	D	S	W	E	G	W	H	W	G	G	M	H	M	W	G	F	S	W	R	L	G	N	P	E	Q	Y	D	L	L	E	D	G	L	K	H	A	E	M	I	V	F	W	S	S	D	P	E	T	N	S	G	I	Y	A	G	F	E	S	N	I	R	R	Q	W	L	K	D	L	.	G	V	D
Template Known Secondary structure										T	T	T						T								G	G	G	T	T					T	T										S						S								S	S	S		T	T	T	T										T	.	T
Template Predicted Secondary structure																																																																														.
Template SS confidence
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.		.	.	.
		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	I	V	I	D	P	R	Y	N	D	T	A	A	G	R	E	D	E	W	L	P	I	R	P	G	T	D	G	A	L	A	C	A	I	A	W	V	L	I	T	E	N	M	V	D	Q	P	F	L	D	K	Y	C	V	G	Y	D	E	K	T	L	P	A	N	A	P	R	N	A	H	Y	K	A	Y	I	L	G	E	G	P
Query Conservation
Alig confidence																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	V	F	I	D	P	H	M	N	H	T	A	R	L	V	A	D	K	W	F	S	P	K	I	G	T	D	H	A	L	S	F	A	I	A	Y	T	W	L	K	E	D	S	Y	D	K	E	Y	V	A	A	N	A	H	G	F	E	E	W	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	V	L	G	K	T
Template Known Secondary structure							S	S										S							T	T																	T		S											S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.														.	.	.	.	310	.
		336	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.					.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.
Query Sequence		D	G	I	A	K	T	P	E	W	A	A	K	I	T	S	I	P	A	E	K	I	I	Q	L	A	R	E	I	G	S	A	K	P	A	Y	I	C	Q	G	W	.	.	.	.	G	P	Q	R	H	S	N	G	E	Q	T	S	R	A	I	A	M	L	S	V	L	T	G	N	V	G	I	N	G	G	N	S	G	V	R	E
Query Conservation																																										.	.	.	.
Alig confidence																																										.	.	.	.																								.
Template Conservation																																																																					.
Template Sequence		D	G	T	P	K	T	C	E	W	A	E	E	E	S	G	V	P	A	C	E	I	R	A	L	A	R	Q	W	A	K	K	N	T	Y	L	A	A	G	G	L	G	G	W	G	G	A	C	R	A	S	H	G	I	E	W	A	R	G	M	I	A	L	A	T	M	Q	G	.	M	G	K	P	G	S	N	M	W	S	T	T
Template Known Secondary structure		T	S																													S							T	T	T	T	S			G	G	G	S	S	T	T															T	T	.	T	T	S	T	T						S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																					.
Template SS confidence
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.		.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	440	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	S	W	D	L	G	V	E	W	F	P	M	L	E	N	P	V	K	T	Q	I	S	V	F	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	T	D	A	I	D	H	G
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	G	V	P	L	D	Y	E	F	Y	F	P	G	Y	A	E	G	G	I	S	G	D	C	E	N	S	A	A	G	F	K	F	A	W	R	M	F	D	G	K	T	T	F	P	S	P	S	N	L	N	T	S	A	G	Q	H	I	P	R	L	K	I	P	E	C	I	M	G	G	K	F	Q	W	S	G	K	G	F	A	G
Template Known Secondary structure		S						T	T	S					G	G	G		T	T	S			T	T	T	S	G	G	G	T	T								S	S	S							S	S	S	S	T	T	S					G	G	G								S								S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
		445	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	E	M	T	A	T	R	D	G	V	R	G	K	E	K	L	D	V	P	I	K	F	L	W	C	Y	A	S	N	T	L	I	N	Q	H	G	D	I	N	H	T	H	E	V	L	Q	D	D	S	K	C	E	M	I	V	G	I	D	H	F	M	T	A	S	A	K	Y	C	D	I	L	L	P	D	L	M	P	T	E	Q
Query Conservation
Alig confidence																																					.												.
Template Conservation																																					.												.
Template Sequence		G	D	I	S	H	Q	L	H	Q	Y	E	Y	P	A	P	G	Y	S	K	I	K	M	F	W	K	Y	G	G	P	H	L	G	T	M	T	.	A	T	N	R	Y	A	K	M	Y	T	H	.	D	S	L	E	F	V	V	S	Q	S	I	W	F	E	G	E	V	P	F	A	D	I	I	L	P	A	C	T	N	F	E	R
Template Known Secondary structure		S	S	T	T	G	G	G						S		T	T											S							S	S	.	S	T							T	T		.	T	T									S	B	S		T	T	G	G	G		S					B			G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																																					.												.
Template SS confidence
		471	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.		.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.		.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.
		525	.	.											.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	S	H	E	S	A	G	N	M	G	Y	V	I	L	A	Q	P	A	T	S	A	K	F	E	R	K	P	I	Y	W	M	L	S	E	V	A	K	R	L	G	P	D	V	Y	Q	T	F	T	E	G	R	S	Q	H	E	W	I	K	Y	L	H	A	K	T	K	E	R
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.																			.	.
Template Conservation																																																											.	.																			.	.
Template Sequence		W	D	I	S	E	F	A	N	C	S	G	Y	I	P	D	N	Y	Q	L	C	N	H	R	V	I	S	L	Q	A	K	C	I	E	P	V	G	E	S	M	S	D	Y	E	I	Y	R	L	F	A	K	K	L	N	I	E	E	M	.	.	F	S	E	G	K	D	E	L	A	W	C	E	Q	Y	F	N	A	T	.	.	D
Template Known Secondary structure							T	T			B	T	T	B	T	T	G	G	G	G	S	S	S										S			S	T	T		B													T	T					.	.			T	T													T	S	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.																			.	.
Template SS confidence
		549	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.			.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.			.
		595	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	P	E	M	P	D	Y	E	E	M	K	T	T	G	I	F	K	K	K	C	P	E	E	H	Y	V	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	R	A	F	R	E	D	P	Q	A	N	P	L	K	T	P	S	G	K	I	E	I	Y	S	E	R	L	A	K	I	A	D	T	W	E	L
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	P	K	Y	M	T	W	D	E	F	F	K	K	G	Y	F	V	V	P	D	N	P	N	R	K	K	T	V	A	L	R	W	F	A	E	G	R	E	K	D	T	P	D	W	G	P	R	L	N	N	Q	V	C	R	K	G	L	Q	T	T	T	G	K	V	E	F	I	A	T	S	L	K	N	F	E	E	Q	G	Y	I
Template Known Secondary structure		G	G	G	T																		T	T	S					T	T					T	T	S				S	S		S		S		G	G	G	S	B	T	T	B	S		S	S	T	T	S	S			S	B										T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		625	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.
		658	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	K	D	E	I	I	H	P	L	P	A	Y	T	P	G	F	D	G	W	D	D	P	L	R	K	T	Y	P	L	Q	L
Query Conservation
Alig confidence			.	.																.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.																.	.	.	.	.
Template Sequence		D	.	.	E	H	R	P	S	M	H	T	Y	V	P	A	W	E	S	.	.	.	.	.	Q	K	H	S	P	L	A	V
Template Known Secondary structure			.	.	T	T	S		S	B							T	T	S	.	.	.	.	.	T	T	T		G	G	G
Template Predicted Secondary structure			.	.																.	.	.	.	.
Template SS confidence
		705			.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720						.	.	.	.	.	.	.	.