Job Description P77783 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:32:48 GMT 2012 Rank 20 Aligned Residues 642 % Identity 21% Template d1kqfa2 SCOP info Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Resolution 1.60

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		48	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.								.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	P	V	E	E	K	A	V	W	S	S	C	T	V	N	C	G	S	R	C	L	L	R	L	H	V	.	.	.	.	.	.	.	K	D	D	T	V	Y	W	V	E	S	D	T	T	G	D	D	V	Y	G	N	H	Q	V	R	A	C	L	R	G	R	S	I	R	R	R	M	N	H	P	D	R	L	K	Y	P	M	K
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.												.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.
Template Conservation																.																																.	.	.	.
Template Sequence		K	L	L	R	A	K	E	I	R	N	T	C	T	Y	.	C	S	V	G	C	G	L	L	M	Y	S	L	G	D	G	A	K	N	A	R	E	A	I	Y	H	I	E	G	D	P	D	.	.	.	.	H	P	V	S	R	G	A	L	C	P	K	G	A	G	L	L	D	Y	V	N	S	E	N	R	L	R	Y	P	E	Y
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	S								S	S	.	B	T	T										S		S		T	T	S											T	T	.	.	.	.		T	T	T	T	T								T	T					T		T	T	B			S
Template Predicted Secondary structure																.																																.	.	.	.
Template SS confidence
		39	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.		.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.					.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.
		121	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.													.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	V	G	K	R	G	E	G	K	F	E	R	I	S	W	D	E	A	L	D	T	I	S	D	N	L	R	R	I	L	K	D	Y	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	V	H	V	L	Y	G	T	G	V	D	G	G	N	I	T	N	S	N	V	P	Y	R	L	M	N	S	C	G	G	F	L
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.
Template Conservation				.	.																																																		.	.	.
Template Sequence		R	A	.	.	P	G	S	D	K	W	Q	R	I	S	W	E	E	A	F	S	R	I	A	K	L	M	K	A	D	R	D	A	N	F	I	E	K	N	E	Q	G	V	T	V	N	R	W	L	S	T	G	M	L	.	.	.	C	A	S	G	A	S	N	E	T	G	M	L	T	Q	K	F	A	R	S	L	G	M	L	A
Template Known Secondary structure				.	.	T	T		S	S																														T	T	S						B		S					.	.	.			T	T	S															T	T	B
Template Predicted Secondary structure				.	.																																																		.	.	.
Template SS confidence
		114	.			.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.				.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.
		189	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210		.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.
Query SS confidence																								.
Query Sequence		S	R	Y	G	S	Y	S	T	A	Q	I	S	A	A	M	S	Y	M	F	G	A	N	.	D	G	N	S	P	D	D	I	A	N	T	K	L	V	V	M	F	G	N	N	P	A	E	T	R	M	S	G	G	G	V	T	Y	Y	V	E	Q	A	R	E	R	S	N	A	R	M	I	V	I	D	P	R	Y	N	D	T	A
Query Conservation																								.
Alig confidence																								.																													.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.
Template Sequence		V	D	N	Q	A	R	V	H	G	P	T	V	A	S	L	A	P	T	F	G	R	G	A	M	T	N	H	W	V	D	I	K	N	A	N	V	V	M	V	M	G	G	N	A	A	E	A	H	P	V	G	.	.	.	F	R	W	A	M	E	A	K	N	N	N	D	A	T	L	I	V	V	D	P	R	F	T	R	T	A
Template Known Secondary structure					G	G	G														S			S		S	S		T	G	G	G	G	G		S						S							S	T	T	T	.	.	.	T										S									S	S
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.
Template SS confidence
		189	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.				240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
		268	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310																																		.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	G	R	E	D	E	W	L	P	I	R	P	G	T	D	G	A	L	A	C	A	I	A	W	V	L	I	T	E	N	M	V	D	Q	P	F	L	D	K	Y	C	V	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	D	E	K
Query Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.
Template Sequence		S	.	V	A	D	I	Y	A	P	I	R	S	G	T	D	I	T	F	L	S	G	V	L	R	Y	L	I	E	N	N	K	I	N	A	E	Y	V	K	H	Y	T	N	A	S	L	L	V	R	D	D	F	A	F	E	D	G	L	F	S	G	Y	D	A	E	K	R	Q	Y	D	K	S	S	W	N	Y	Q	L	D	E	N
Template Known Secondary structure			.	T		S							T	T																T	T		S									B	S	T	T	B	B	B		T	T					T	T			T	T			T	T	T	T					T	T	S	S	B		B		T	T
Template Predicted Secondary structure			.
Template SS confidence
		267		.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
		315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.					.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.
Query SS confidence																																																						.	.	.	.
Query Sequence		T	L	P	A	N	A	P	R	N	A	H	Y	K	A	Y	I	L	G	E	G	P	D	G	I	A	K	T	P	E	W	A	A	K	I	T	S	I	P	A	E	K	I	I	Q	L	A	R	E	I	G	S	A	.	.	.	.	K	P	A	Y	I	C	Q	G	W	G	P	Q	R	H	S	N	G	E	Q	T	S	R	A	I
Query Conservation																																																						.	.	.	.
Alig confidence																																																						.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	Y	A	K	R	D	E	T	L	T	H	P	R	C	V	W	N	L	L	K	E	H	V	S	R	Y	T	P	D	V	V	E	N	I	C	G	T	P	K	A	D	F	L	K	V	C	E	V	L	A	S	T	S	A	P	D	R	T	T	T	F	L	Y	A	L	G	W	T	Q	H	T	V	G	A	Q	N	I	R	T	M
Template Known Secondary structure		S	S	B		B		T	T	S		S	T	T	B										T	T																										G	G	G	S	T	T								S					S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		346	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.												.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	M	L	S	V	L	T	G	N	V	G	I	N	G	G	N	S	G	V	R	E	G	S	W	D	L	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	W	F	P	M	L	E	N	P	V	K	T	Q	I	S	V	F	T	W	T	D	A	I	D	H	G	T	E	M	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	M	I	Q	L	L	L	G	N	M	G	M	A	G	G	G	V	N	A	L	R	G	H	S	N	I	Q	G	L	T	D	L	G	L	L	S	T	S	L	P	G	Y	L	T	L	P	S	E	K	Q	V	D	L	Q	S	Y	L	E	A	N	T	P	K	A	T	L	A	D	Q	V	N	Y	W	S	N	Y	P	K	F	F
Template Known Secondary structure									T		T	T		T	T		S							B	T	T							T	T		S	T	T			G	G	G					B	T	T			S									S				S	S	S	S				G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		426	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.
																														449	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	T	R	D	G	V	R	G	K	E	K	L	D	V	P	I	K	F	L	W	C	Y	A	S	N	T	L	I	N	Q	H	G	D	I	N	H	T	H	E	V	L	Q	D	D	S	K	C	E	M	I	V	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.
Template Sequence		V	S	L	M	K	S	F	Y	G	D	A	A	Q	K	E	N	N	W	G	Y	D	W	L	P	K	W	D	Q	T	Y	D	V	I	K	Y	F	N	M	M	D	E	G	K	V	T	G	Y	F	C	Q	G	F	N	P	V	A	S	F	P	.	.	.	.	D	K	N	K	V	V	S	C	L	S	K	L	K	Y	M	V	V
Template Known Secondary structure										G	G	G			G	G	G	G	G	G	G	G	G	S			B	S	S													T	T									S							S	S	.	.	.	.	S									T	T		S
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.
Template SS confidence
		506	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.					.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.
		501	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	D	H	F	M	T	A	S	A	K	Y	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	I	L	L	P	D	L	M	P	T	E	Q	E	D	L	I	S	H	E	S	A	G	N	M	G	Y	V	I	L	A	Q	P	A	T	S	A	K	F	E	R	K	P	I	Y	W	M	L	S	E	V	A
Query Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.
Template Sequence		I	D	P	L	V	T	E	T	S	T	F	W	Q	N	H	G	E	S	N	D	V	D	P	A	S	I	Q	T	E	V	F	R	L	P	S	T	C	F	A	E	E	D	G	S	I	A	N	S	G	R	W	.	.	.	.	L	Q	W	H	W	K	G	Q	D	A	P	G	E	A	R	N	D	G	E	I	L	A	G	I	Y
Template Known Secondary structure				S	B			T	T	T	T	T	T	S			G	G	G	G				G	G	G										B			G	G	G	S							T	T			.	.	.	.								S			S	T	T		B
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.
Template SS confidence
		582	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.					.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.
		564	.	.	.																	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	R	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	V	Y	Q	T	F	T	E	G	R	S	Q	H	E	W	I	K	Y	L	H	A	K	T	K	E	R	N	P	E	M	P	D	Y	E	E	M	K	T	T	G	I	F	K	K	K	C	P	E	E	H	Y	V	A	F	R	A	F	R	E
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	H	L	R	E	L	Y	Q	S	E	G	G	K	G	V	E	P	L	M	K	M	S	W	N	Y	K	Q	P	H	E	P	Q	S	D	E	V	A	K	E	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	Y	A	L	E	D	L	Y	D	A	N	G	V	L	I	A	K	K	G	Q	L	L	S	S	F	A	H	L	R	D
Template Known Secondary structure														S	S							S					S	S	T	T	S											.	.	.	.	.	.	.	.	.					S	S					T	T	S						T	T		B		S		G	G	G			S
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		658	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.										.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.
		628	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	P	Q	A	N	P	L	K	T	P	S	G	K	I	E	I	Y	S	E	R	L	A	K	I	A	D	T	W	E	L	K	K	D	E	I	I	H	P	L	P	A	Y	T	P	G	F	D	G	W	D	D	P	L	R	K	T	Y	P	L	Q	L	T	G	F	H	Y	K	A	R	T	H	S	S	Y	G	N	I	D	V	L
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.	.							.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.							.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	.	.	.	.	.	G	T	T	A	S	S	.	C	W	I	Y	T	G	S	W	T	E	Q	G	N	Q	M	A	N	R	D	N	S	D	P	S	G	L	G	N	T	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	A	W	A	W	P	L	N	R	R	V	L	Y	N	R	A	S	A	D	I	N	G
Template Known Secondary structure		S	.	.	.	.	.	S	S				S	.		G	G	G	T	T	S			T	T			G	G	G		B					T	T	S	S	S			T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B	S			T	T	T	T		S	S	T	T	G	G	G	G	B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.							.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		729						730	.	.	.	.	.		.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.															.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.
		708	.	710	.	.			.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740
Predicted Secondary structure							.	.
Query SS confidence							.	.
Query Sequence		Q	Q	A	C	P	.	.	Q	E	V	W	I	N	P	I	D	A	Q	A	R	G	I	R	H	G	D	T	V	R	V	F	N	N	N	G
Query Conservation							.	.
Alig confidence							.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	P	W	D	P	K	R	M	L	I	Q	W	N	G	S	K	W	T	G	N	D	I	P	D	F	G	N	A	A	P	G	T	P	T	G
Template Known Secondary structure			B	S	S	T	T	S							S	S	S				S	S			S	S		S			T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		789	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.