Job Description P77783 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:32:48 GMT 2012 Rank 26 Aligned Residues 564 % Identity 18% Template d1g8ka2 SCOP info Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Resolution 1.64

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		44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	80
Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	A	A	E	A	P	V	E	E	K	A	V	W	S	S	C	T	V	N	C	G	S	R	C	L	L	R	L	H	V	K	D	D	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	Y	W
Query Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.
Template Sequence		R	I	T	L	P	P	A	N	A	Q	R	T	N	M	T	C	H	F	.	C	I	V	G	C	G	Y	H	V	Y	K	W	P	E	L	E	E	G	G	R	A	P	E	Q	N	A	L	G	L	D	F	R	K	Q	L	P	P	L	A	V	T	L	T	P	A	M	T	N	V	V	T	E	H	D	G	A	R	Y	D	I	M
Template Known Secondary structure							B	T	T									S	S	.	B	T	T											T	T					S	S	G	G	G	B	T	T				T	T	S				T	T	S					G	G	G							T	T	S
Template Predicted Secondary structure																				.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.		.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.						.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.
Query SS confidence																																		.	.	.	.	.
Query Sequence		V	E	S	D	T	T	G	D	D	V	Y	G	N	H	Q	V	R	A	C	L	R	G	R	S	I	R	R	R	M	N	H	P	.	.	.	.	.	D	R	L	K	Y	P	M	K	R	V	G	K	R	G	E	G	K	F	E	R	I	S	W	D	E	A	L	D	T	I	S	D	N	L	R	R	I	L	K	D	Y	G	N
Query Conservation																																		.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.																							.	.	.	.	.											.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.																																						.	.	.	.
Template Sequence		V	V	P	D	K	A	.	.	.	.	C	V	V	N	S	G	L	S	S	T	R	G	G	K	M	A	S	Y	M	Y	T	P	T	G	D	G	K	E	R	L	S	A	P	R	L	Y	A	.	.	.	.	A	D	E	W	V	D	T	T	W	D	H	A	M	A	L	Y	A	G	L	I	K	K	T	L	D	K	D	G	P
Template Known Secondary structure						T	T	.	.	.	.		T	T	T	T	T				T	T	G	G	G	G	G	G	G	S			S	S	S	T	T	T	T				S						.	.	.	.	S	S	S																								T		G
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.																																						.	.	.	.
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90					.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.					.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
		156	.	.	.	160	.	.	.	.		.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190			.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.
Predicted Secondary structure											.																											.	.
Query SS confidence											.																											.	.
Query Sequence		E	A	V	H	V	L	Y	G	T	.	G	V	D	G	G	N	I	T	N	S	N	V	P	Y	R	L	M	N	S	C	G	G	F	L	S	R	.	.	Y	G	S	Y	S	T	A	Q	I	S	A	A	M	S	Y	M	F	G	A	N	D	G	N	S	P	D	D	I	A	N	T	K	L	V	V	M	F	G	N	N	P	A
Query Conservation											.																											.	.
Alig confidence											.																											.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	G	V	F	F	S	C	F	D	H	G	G	A	G	G	G	F	E	N	T	W	G	T	G	K	L	M	F	S	A	I	Q	T	P	M	V	R	I	H	N	R	P	A	Y	N	S	E	C	H	A	T	R	E	M	G	I	G	E	L	N	N	A	Y	E	D	A	Q	L	A	D	V	I	W	S	I	G	N	N	P	Y
Template Known Secondary structure		G	G									S	S	T	T		S													T	T	T								T	T	B	S	S	S			T	T						T	T			S			S									S						S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
		233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.														.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.									.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	T	R	M	S	G	G	G	V	T	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	V	E	Q	A	R	E	R	S	N	A	R	M	I	V	I	D	P	R	Y	N	D	T	A	A	G	R	E	D	.	.	.	.	.	.	.	.	E	W	L	P	I	R	P	G	T	D	G	A	L	A	C	A	I	A	W
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.
Template Sequence		E	S	Q	T	N	Y	F	L	N	H	W	L	P	N	L	Q	G	A	T	T	S	K	K	K	E	R	F	P	N	E	N	F	P	Q	A	R	I	I	F	V	D	P	R	E	T	P	S	V	A	.	I	A	R	H	V	A	G	N	D	R	V	L	H	L	A	I	E	P	G	T	D	T	A	L	F	N	G	L	F	T
Template Known Secondary structure				S							T							T	T	T									T	T													S	S							.								G	G	G								T	T
Template Predicted Secondary structure																																																			.
Template SS confidence
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.		.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.
		292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Query SS confidence																																																																															.	.	.
Query Sequence		V	L	I	T	E	N	M	V	D	Q	P	F	L	D	K	Y	C	V	G	Y	D	E	K	T	L	P	A	N	A	P	R	N	A	H	Y	K	A	Y	I	L	G	E	G	P	D	G	I	A	K	T	P	E	W	A	A	K	I	T	S	I	P	A	E	K	I	I	Q	L	A	R	E	I	G	S	A	K	P	.	.	.
Query Conservation																																																																															.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	V	V	E	Q	G	W	I	D	K	P	F	I	E	A	H	T	K	G	F	D	D	A	V	K	T	N	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	L	D	E	C	S	N	I	T	G	V	P	V	D	M	L	K	R	A	A	E	W	S	Y	K	P	K	A	S	G	Q
Template Known Secondary structure							T		S																			T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										S			T	T	S
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
					369	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.
Query SS confidence		.	.	.
Query Sequence		.	.	.	A	Y	I	C	Q	G	W	G	P	Q	R	H	S	N	G	E	Q	T	S	R	A	I	A	M	L	S	V	L	T	G	N	V	G	I	N	G	G	N	S	G	V	R	E	G	S	W	D	L	G	V	E	W	F	P	M	L	E	N	P	V	K	T	Q	I	S	V	F	T	W	T	D	A	I	D	H	G	T
Query Conservation		.	.	.
Alig confidence		.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	P	R	T	M	H	A	Y	E	K	G	I	I	W	G	N	D	N	Y	V	I	Q	S	A	L	L	D	L	V	I	A	T	H	N	V	G	R	R	G	T	G	C	V	R	M	G	G	H	Q	E	G	Y	T	R	P	P	Y	P	G	D	K	K	I	Y	I	D	Q	E	L	I	K	G	K	G	R	I	M	T	W	W
Template Known Secondary structure															T	S	T	T															T	T		S	S	S	T	T								S	B		B								S		S	S										T	T			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		376	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
		446	.	.						.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.		.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.																																																	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.																																																	.
Query Sequence		E	M	T	.	.	.	.	.	A	T	R	D	G	V	R	G	K	E	K	L	D	V	P	I	K	F	L	W	C	Y	A	S	N	T	L	I	N	Q	H	G	D	I	N	H	T	H	E	V	L	Q	D	D	S	K	C	E	.	M	I	V	G	I	D	H	F	M	T	A	S	A	K	Y	C	D	I	L	L	P	D	L
Query Conservation					.	.	.	.	.																																																	.
Alig confidence					.	.	.	.	.																																.	.	.	.														.
Template Conservation																																									.	.	.	.
Template Sequence		G	C	N	N	F	Q	T	S	N	N	A	Q	A	L	R	E	A	I	L	Q	R	S	A	I	V	K	Q	A	M	Q	K	A	R	G	A	T	T	E	E	.	.	.	.	M	V	D	V	I	Y	E	A	T	Q	N	G	G	L	F	V	T	S	I	N	L	Y	P	T	K	L	A	E	A	A	H	L	M	L	P	A	A
Template Known Secondary structure		S							S	T	T																					T		S	S						.	.	.	.										T	T	T									S	S			G	G	G	G	T		S					B
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.
Template SS confidence
		456	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.					.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.
		520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.											.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	P	T	E	Q	E	D	L	I	S	H	E	S	A	G	N	M	G	Y	V	I	L	A	Q	P	A	T	S	A	K	F	E	R	K	P	I	Y	W	M	L	S	E	V	A	K	R	L	G	P	D	V	Y	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	F	T	E	G	R	S	Q	H	E	W	I	K	Y	L	H	A
Query Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.
Template Sequence		H	P	G	E	M	N	L	T	S	M	N	G	E	R	R	.	.	.	.	I	R	L	S	E	K	F	M	D	P	P	G	T	A	M	A	D	C	L	I	A	A	R	I	A	N	A	L	R	D	M	Y	Q	K	D	G	K	A	E	M	A	A	Q	F	E	G	F	D	W	K	T	E	E	D	A	F	N	D	G	F	R
Template Known Secondary structure			B	T	T	B							T	T			.	.	.	.								S			S	T	T		B																				T	T								T		S				S	S								T	G	G
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.
Template SS confidence
		532	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.					.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.
		590	.	.	.	.												.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.			.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.		.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.																										.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.																										.
Query Sequence		K	T	K	E	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	P	E	M	P	D	Y	E	E	M	K	T	T	G	.	.	I	F	K	K	K	C	P	E	E	H	Y	V	A	F	R	A	F	R	E	D	P	Q	A	N	P	.	L	K	T	P	S	G	K	I	E	I	Y	S
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.																										.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.																										.
Template Conservation
Template Sequence		R	A	G	Q	P	G	A	P	A	I	D	S	Q	G	G	S	T	G	H	L	V	T	Y	D	R	L	R	K	S	G	N	N	G	V	Q	L	P	V	V	S	W	D	E	S	K	G	L	V	G	T	E	M	L	Y	T	E	G	K	F	D	T	D	D	G	K	A	H	F	K	P
Template Known Secondary structure		G	T	T		T	T							T	T	G	G	G	G	G	G										G	G	G				S	S						T	T	T						S		S		T	T	S			S	S	T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		608	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.