Job Description P77783 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:32:48 GMT 2012 Rank 14 Aligned Residues 672 % Identity 24% Template c2iv2X_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: X: PDB Molecule:formate dehydrogenase h; PDBTitle: reinterpretation of reduced form of formate dehydrogenase h2 from e. coli Resolution 2.27 Å

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		53	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.					.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.
Query SS confidence																																																															.	.	.	.
Query Sequence		K	A	V	W	S	S	C	T	V	N	C	G	S	R	C	L	L	R	L	H	V	K	D	D	T	V	Y	W	V	E	S	D	T	T	G	D	D	V	Y	G	N	H	Q	V	R	A	C	L	R	G	R	S	I	R	R	R	M	N	H	P	D	.	.	.	.	R	L	K	Y	P	M	K	R	V	G	K	R	G	E	G
Query Conservation																																																															.	.	.	.
Alig confidence											.																								.	.	.	.	.																								.	.	.	.										.	.
Template Conservation											.																								.	.	.	.	.																																					.	.
Template Sequence		K	K	V	V	T	V	C	P	Y	.	C	A	S	G	C	K	I	N	L	V	V	D	N	G	K	I	V	R	A	E	A	A	Q	.	.	.	.	.	G	K	T	N	Q	G	T	L	C	L	K	G	Y	Y	G	W	D	F	I	N	D	T	Q	I	L	T	P	R	L	K	T	P	M	I	R	R	.	.	Q	R	G	G
Template Known Secondary structure									S	S	.	B	T	T										T	T										.	.	.	.	.		T	T	T	T	T									T	T	G	G	G	G				S	S	S		B			S						.	.	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure											.																								.	.	.	.	.																																					.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10		.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.						.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.			70	.	.	.
		129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190		.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																.
Query SS confidence																																																																.
Query Sequence		K	F	E	R	I	S	W	D	E	A	L	D	T	I	S	D	N	L	R	R	I	L	K	D	Y	G	N	E	A	V	H	V	L	Y	G	T	G	V	D	G	G	N	I	T	N	S	N	V	P	Y	R	L	M	N	S	C	G	G	F	L	S	R	.	Y	G	S	Y	S	T	A	Q	I	S	A	A	M	S	Y	M	F
Query Conservation																																																																.
Alig confidence																																							.	.																								.
Template Conservation																																							.	.
Template Sequence		K	L	E	P	V	S	W	D	E	A	L	N	Y	V	A	E	R	L	S	A	I	K	E	K	Y	G	P	D	A	I	Q	T	T	G	S	S	R	.	.	G	T	G	N	E	T	N	Y	V	M	Q	K	F	A	R	A	V	I	G	T	N	N	V	D	C	C	A	R	V	H	G	P	S	V	A	G	L	H	Q	S	V
Template Known Secondary structure																												G	G	G							S	S	.	.	T	T															T	T								S	S					S	S	S		S
Template Predicted Secondary structure																																							.	.
Template SS confidence
		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110			.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
		208	.	210		.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.
Query SS confidence					.
Query Sequence		G	A	N	.	D	G	N	S	P	D	D	I	A	N	T	K	L	V	V	M	F	G	N	N	P	A	E	T	R	M	S	G	G	G	V	T	Y	Y	V	E	Q	A	R	E	R	S	N	A	R	M	I	V	I	D	P	R	Y	N	D	T	A	A	G	R	E	D	E	W	L	P	I	R	P	G	T	D	G	A	L	A
Query Conservation					.
Alig confidence					.																													.	.	.											.																	.
Template Conservation																																		.	.	.											.																	.
Template Sequence		G	N	G	A	M	S	N	A	I	N	E	I	D	N	T	D	L	V	F	V	F	G	Y	N	P	A	D	S	H	P	I	V	.	.	.	A	N	H	V	I	N	A	K	R	N	.	G	A	K	I	I	V	C	D	P	R	K	I	E	T	A	R	.	I	A	D	M	H	I	A	L	K	N	G	S	N	I	A	L	L
Template Known Secondary structure		S			S		S	S		G	G	G	G	G	G		S						S											.	.	.										T	.	T								S	S							.	T		S							T	T
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.											.																	.
Template SS confidence
		153	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.				.	.	.	.	.	190	.	.	.	.		.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210		.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
		287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	A	I	A	W	V	L	I	T	E	N	M	V	D	Q	P	F	L	D	K	Y	C	V	G	Y	D	E	K	T	L	P	A	N	A	P	R	N	A	H	Y	K	A	Y	I	L	G	E	G	P	D	G	I	A	K	T	P	E	W	A	A	K	I	T	S	I	P	A	E	K	I	I	Q	L	A	R	E	I	G	S	A
Query Conservation
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	A	M	G	H	V	I	I	E	E	N	L	Y	D	K	A	F	V	A	S	R	T	E	G	F	E	E	Y	R	K	I	V	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Y	T	P	E	S	V	E	D	I	T	G	V	S	A	S	E	I	R	Q	A	A	R	M	Y	A	Q	A
Template Known Secondary structure											T	T		S																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T			S	G	G	G																					S
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.
		367	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.										.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	P	A	Y	I	C	Q	G	W	G	P	Q	R	H	S	N	G	E	Q	T	S	R	A	I	A	M	L	S	V	L	T	G	N	V	G	I	N	G	G	N	S	G	V	R	E	G	S	W	D	L	G	V	E	W	F	P	M	L	E	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	V	K	T	Q	I	S	V	F	T	W
Query Conservation																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	S	A	A	I	L	W	G	M	G	V	T	Q	F	Y	Q	G	V	E	T	V	R	S	L	T	S	L	A	M	L	T	G	N	L	G	K	P	H	A	G	V	N	P	V	R	G	Q	N	N	V	Q	G	A	C	D	M	G	A	L	P	D	T	Y	P	G	Y	Q	Y	V	K	D	P	A	N	R	E	K	F	A	K
Template Known Secondary structure		S	S							T	T	G	G	G	S	S	S															T	T		S	S	S	T	T		S						S	B	T	T							T	T		B	T	T			G	G	G			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		289	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.
		438	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	D	A	I	D	H	G	T	E	M	T	A	T	R	D	G	V	R	G	K	E	K	L	D	V	P	I	K	F	L	W	C	Y	A	S	N	T	L	I	N	Q	H	G	D	I	N	H	T	H	E	V	L	Q	D	D	S	K	C	E	M	I	V	G	I	D	H	F	M	T	A	S	A	K	Y	C	D	I	L	L	P
Query Conservation
Alig confidence																																												.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.
Template Sequence		A	W	G	V	E	S	L	P	A	H	T	G	Y	R	I	S	E	L	P	H	R	A	A	H	G	E	V	R	A	A	Y	I	M	G	E	D	P	L	Q	T	D	A	.	.	.	.	E	L	S	A	V	R	K	A	F	E	D	L	E	L	V	I	V	Q	D	I	F	M	T	K	T	A	S	A	A	D	V	I	L	P
Template Known Secondary structure			T	T		S					S					G	G	G							T	T	S								S							S	S	.	.	.	.	S											S	S							S	B							T		S
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.
Template SS confidence
		369	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410					.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.
		518	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	L	M	P	T	E	Q	E	D	L	I	S	H	E	S	A	G	N	M	G	Y	V	I	L	A	Q	P	A	T	S	A	K	F	E	R	K	P	I	Y	W	M	L	S	E	V	A	K	R	L	G	P	D	V	Y	Q	T	F	T	E	G	R	S	Q	H	E	W	I	K	Y	L	H	A	K	T	K	E	R	N	P	E
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.																																				.	.	.	.	.														.	.
Template Conservation																			.	.	.	.																																				.	.	.	.	.														.	.
Template Sequence		S	T	S	W	G	E	H	E	G	V	F	T	A	A	D	R	G	.	.	.	.	F	Q	R	F	F	K	A	V	E	P	K	W	D	L	K	T	D	W	Q	I	I	S	E	I	A	T	R	M	G	Y	P	M	H	Y	N	.	.	.	.	.	N	T	Q	E	I	W	D	E	L	R	H	L	C	.	.	P	D	F	Y
Template Known Secondary structure		B			B	T	T	B							T	T	S		.	.	.	.								S			S	S	S		B													T	T						S	.	.	.	.	.	S													.	.	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.																																				.	.	.	.	.														.	.
Template SS confidence
		445	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.					.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.						.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.			510	.	.	.
		598	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	P	D	Y	E	E	M	K	T	T	G	I	F	K	K	K	C	P	E	E	H	Y	V	A	F	R	A	F	R	E	D	P	Q	A	N	P	L	K	T	P	S	G	K	I	E	I	Y	S	E	R	L	A	K	I	A	D	T	W	E	L	K	K	D	E	I	I	H	P	L	P	A	Y	T	P	G	F	D	G	W	D
Query Conservation
Alig confidence																											.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	A	T	Y	E	K	M	G	E	L	G	F	I	Q	W	P	C	R	D	T	S	D	A	D	Q	.	.	G	T	S	Y	L	F	K	E	K	F	D	T	P	N	G	L	A	Q	F	F	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	D	W	V	A	P	I
Template Known Secondary structure		T							T	T	T					S					S	S	T	T			.	.	B		S	S	S		S	S			S	S	T	T	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S
Template Predicted Secondary structure																											.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		514	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.			.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										560	.	.	.	.	.	.
		678	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.			.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.			.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.																			.	.
Query SS confidence																			.	.																			.	.
Query Sequence		D	P	L	R	K	T	Y	P	L	Q	L	T	G	F	H	Y	K	.	.	A	R	T	H	S	S	Y	G	N	I	D	V	L	Q	Q	A	C	P	.	.	Q	E	V	W	I	N	P	I	D	A	Q	A	R	G	I	R	H	G	D	T	V	R	V	F	N	N	N	G	E	M	L	I	A	A	K	V	T	P	R	I	L
Query Conservation																			.	.																			.	.
Alig confidence																			.	.																			.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	K	L	T	D	E	Y	P	M	V	L	S	T	V	R	E	V	G	H	Y	S	C	R	S	M	T	G	N	C	A	A	L	A	A	L	A	D	E	P	G	Y	A	Q	I	N	T	E	D	A	K	R	L	G	I	E	D	E	A	L	V	W	V	H	S	R	K	G	K	I	I	T	R	A	Q	V	S	D	R	P	N
Template Known Secondary structure		S				S	S	S										T	T			S	S		T	T	G	G	G	S					T	T			S	S														T			T	T								S	S											S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		567	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.
		754	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	G	V	T	A	I	G	Q	G	A	W	L	K	A	D	M	F	G	D	R	V	D	H	G	G	S	I	N	I	L	T	S	H	R	P	S	P	L	A	K	G	N	P	S	H	S	N	L	V	Q	I	E	K
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	G	A	I	Y	M	T	Y	Q	W	W	P	E	Y	K	Y	C	.	.	.	.	.	.	A	V	R	V	E	P	I	A	D	Q	R	A	A	E	Q	Y	V	I	D	E	Y	N	K	L	K	T	R	L	R	E
Template Known Secondary structure		T	T												T	T			.	.	.	.	.	.								S
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		647	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.							.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.