Job Description P76461 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:23:06 GMT 2012 Rank 37 Aligned Residues 293 % Identity 27% Template c2wggA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase 1; PDBTitle: crystal structure of mycobacterium tuberculosis c171q kasa2 variant with bound tlm Resolution 2.00 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10		.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.										.	30
Predicted Secondary structure												.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	K	N	C	V	I	V	S	A	V	.	R	T	A	I	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	N	G	S	L	A	S	T	S	A	I	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G
Query Conservation												.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	P	S	V	V	V	T	A	V	T	A	T	T	S	I	S	P	D	I	E	S	T	W	K	G	L	L	A	G	E	S	G	I	H	A	L	E	D	E	F	V	T	K	W	D	L	A	V	K	I	G	G	H	L	K	D	P	V	D	S	H	M	G	R	L	D	M	R	R	M	S	Y	V	Q	R	M	G	K	L	L
Template Known Secondary structure		S													S	S		S	S										T	T									S							T		S					B			S	S		G	G	G	G									S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90
		31	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	T	V	I	K	A	A	I	E	R	A	K	I	D	S	Q	H	V	D	E	V	I	M	G	N	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	Q	A	G	L	G	Q	N	P	A	R	Q	A	L	L	K	S	G	L	A	E	T	V	C	G	F	T	V	N
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.
Template Conservation																																																																								.	.
Template Sequence		G	G	Q	L	W	E	S	A	G	S	P	E	V	D	P	D	R	F	A	V	V	V	G	T	G	L	G	G	A	E	R	I	V	E	S	Y	D	L	M	N	A	G	G	P	R	K	V	S	P	L	A	V	Q	M	I	M	P	N	G	A	A	A	V	I	G	L	Q	L	G	A	.	.	R	A	G	V	M	T	P	V
Template Known Secondary structure									T	T						G	G	G								S	S		S																G	G	G	S		T	T						S	T	T											T		.	.		S
Template Predicted Secondary structure																																																																								.	.
Template SS confidence
		91	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160			.	.	.	.	.	.	.	.
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	V	C	G	S	G	L	K	S	V	A	L	A	A	Q	A	I	Q	A	G	Q	A	Q	S	I	V	A	G	G	M	E	N	M	S	L	A	P	Y	L	L	D	A	K	A	R	S	G	Y	R	L	G	D	G	Q	V	Y	D	V	I	L	R	D	G	L	M	C	A	T	H	G	Y	H	M	G	I	T	A	E	N	V
Query Conservation
Alig confidence																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	A	Q	S	S	G	S	E	A	I	A	H	A	W	R	Q	I	V	M	G	D	A	D	V	A	V	C	G	G	V	E	G	P	I	E	A	L	P	I	A	A	F	S	M	M	R	A	M	S	T	R	N	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			G	G	G															T	T	S		S																					T	T	T		B				T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	K	E	Y	G	I	T	R	E	M	Q	D	E	L	A	L	H	S	Q	R	K	A	A	A	A	I	E	S	G	A	F	T	A	E	I	V	P	V	N	V	V	T	R	K	K	T	F	V	F	S	Q	D	E	F	P	K	A	N	S	T	A	E	A	L	G	A	L	R	P	A	F	D	K	A	G	T	V	T	A	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	P	E	R	A	S	R	P	F	D	K	D	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	G	G	S			T	T	B	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																					222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.						.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.	.	.
Query Sequence		N	A	S	G	I	N	D	G	A	A	A	L	V	I	M	E	E	S	A	A	L	A	A	G	L	T	P	L	A	R	I	K	S	Y	A	S	G	G	V	.	.	.	.	.	P	P	A	L	M	G	M	G	P	V	P	A	T	Q	K	A	L	Q	L	A	G	L	Q	L	A	D	I	D	L	I	E	A	N	E	A	F
Query Conservation																																									.	.	.	.	.
Alig confidence																																									.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	G	F	V	F	G	E	A	G	A	L	M	L	I	E	T	E	E	H	A	K	A	R	G	A	K	P	L	A	R	L	L	G	A	G	I	T	S	D	A	F	H	M	V	A	P	A	A	D	G	V	R	A	G	R	A	M	T	R	S	L	E	L	A	G	L	S	P	A	D	I	D	H	V	N	A	H	G	T	A
Template Known Secondary structure			S	B		B	B																		T				S													S		S	S	S			T	T																T			G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
		321					.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.		.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.																										.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.																										.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	.	.	.	.	A	Q	F	L	A	V	G	K	N	L	G	F	D	S	E	K	V	N	V	N	G	G	A	I	A	.	L	G	H	P	I	G	A	S	G	A	R	I	L	V	T	L	L	H	A	M	Q	A	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation			.	.	.	.																										.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.																		.	.	.						.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.
Template Sequence		T	P	I	G	D	A	A	E	A	N	A	I	R	V	A	G	C	D	Q	A	A	V	.	.	.	Y	A	P	K	S	A	L	G	H	S	I	G	A	V	G	A	L	E	S	V	L	T	V	L	T	L	R	D	G	V	I	P	P	T	L	N	Y	E	T	P	D	P	E	I	D	L	D	V	V	A	G	E	P	R	Y
Template Known Secondary structure																T	T		T	T	S			.	.	.			T						B		T	T	T																T						T	T			S	B		T	T								S	S
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.
Template SS confidence
		315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.				.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
			370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.
Predicted Secondary structure		.
Query SS confidence		.
Query Sequence		.	D	K	T	L	G	L	A	T	L	C	I	G	G	G	Q	G	I	A	M	V	I	E	R
Query Conservation		.
Alig confidence		.
Template Conservation
Template Sequence		G	D	Y	R	Y	A	V	N	N	S	F	G	F	G	G	H	N	V	A	L	A	F	G	R
Template Known Secondary structure														T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		392	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.