Job Description P76461 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:23:06 GMT 2012 Rank 35 Aligned Residues 285 % Identity 25% Template c2hg4A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:6-deoxyerythronolide b synthase; PDBTitle: structure of the ketosynthase-acyltransferase didomain of module 52 from debs. Resolution 2.73 Å

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		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.										.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.					50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	S	A	V	R	T	A	I	G	S	F	N	G	S	L	A	S	T	S	A	I	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	A	T	V	I	K	A	A	I	E	R	A	K	I	D	S	Q	H	V	D	.	.	.	.	E	V	I	M	G	N	V	L	Q	A	G	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	G	G	X	L	A	A	A	G	D	F	D	A	G	F	F	G	I	S	P	R	E	A	L	A	X	D	P	Q	Q	R	I	X	L	E	I	S	W	E	A	L	E	R	A	G	H	D	P	V	S	L	R	G	S	A	T	G	V	F	T	G	V	G	T	V	D	Y	G	P	R	P	D	E	A	P	D	E	V	L	G
Template Known Secondary structure				B			T	T	T	T				T	G	G	G	T									S																		T	T			G	G	G	G	T	T	S														S			T	T	S	S		G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
										63	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	Q	N	P	A	R	Q	A	L	L	K	S	G	L	A	E	T	V	C	G	F	T	V	N	K	V	C	G	S	G	L	K	S	V	A	L	A	A	Q	A	I	Q	A	G	Q	A	Q	S	I	V	A	G	G	M	E	N	M	S	L	A	P	Y	L	L	D	A	K	A	R	S	G	Y	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																																																									.
Template Conservation																							.	.																																																									.
Template Sequence		Y	V	G	T	G	T	A	S	S	V	A	S	G	R	V	A	Y	C	L	G	L	.	.	E	G	P	A	X	T	V	D	T	A	C	S	S	G	L	T	A	L	H	L	A	X	E	S	L	R	R	D	E	C	G	L	A	L	A	G	G	V	T	V	X	S	S	P	G	A	F	T	E	F	R	S	Q	G	G	L	.
Template Known Secondary structure		G																			T		.	.		S								G	G	G															T	T	S		S												S	T							T	T	S	S		B	.
Template Predicted Secondary structure																							.	.																																																									.
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.			.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
		135	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	G	D	G	Q	V	Y	D	V	I	L	R	D	G	L	M	C	A	T	H	G	Y	H	M	G	I	T	A	E	N	V	A	K	E	Y	G	I	T	R	E	M	Q	D	E	L	A	L	H	S	Q	R	K	A	A	A	A	I	E	S	G	A	F	T	A	E	I	V	P	V	N	V	V	T	R	K	K	T	F	V	F
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.						.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																									.	.	.	.	.
Query Sequence		S	Q	D	E	F	P	K	A	N	S	T	A	E	A	L	G	A	L	R	P	A	F	D	K	A	G	T	V	T	A	G	N	A	S	G	I	N	D	G	A	A	A	L	V	I	M	E	E	S	A	A	L	A	A	G	L	T	P	L	A	R	I	K	S	Y	A	S	G	G	V	P	.	.	.	.	.	P	A	L	M
Query Conservation																																																																									.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	D	G	R	C	K	P	F	S	K	A	A	D	G	F	G	L	A	E	G	A	G	V	L	V	L	Q	R	L	S	A	A	R	R	E	G	R	P	V	L	A	V	L	R	G	S	A	V	N	Q	D	G	A	S	N	G	L	T	A	P	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S				T	T	B	T	T				B		B	B																	T	T																	S		S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																				245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.
		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.					.	.	.	.	.	.	.	.	330	.				.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.		.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.											.	.	.																.
Query SS confidence																																		.	.	.	.											.	.	.																.
Query Sequence		G	M	G	P	V	P	A	T	Q	K	A	L	Q	L	A	G	L	Q	L	A	D	I	D	L	I	E	A	N	E	A	F	A	.	.	.	.	A	Q	F	L	A	V	G	K	N	L	.	.	.	G	F	D	S	E	K	V	N	V	N	G	G	A	I	A	.	L	G	H	P	I	G	A	S	G	A	R	I	L	V	T
Query Conservation																																		.	.	.	.											.	.	.																.
Alig confidence																																		.	.	.	.											.	.	.																.
Template Conservation
Template Sequence		G	P	A	Q	Q	R	V	I	R	R	A	L	E	N	A	G	V	R	A	G	D	V	D	Y	V	E	A	H	G	T	G	T	R	L	G	D	P	I	E	V	H	A	L	L	S	T	Y	G	A	E	R	D	P	D	D	P	L	W	I	G	S	V	K	S	N	I	G	H	T	Q	A	A	A	G	V	A	G	V	X	K
Template Known Secondary structure																	T			G	G	G												T	T											T	T	T	T	T	S	S		T	T	S							T						B		G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		307	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
		362	.	.	.	.	.	.	.																																	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	L	H	A	M	Q	A	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	K	T	L	G	L	A	T	L	C	I	G	G	G	Q	G	I	A	M	V	I	E	R
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	V	L	A	L	R	H	G	E	X	P	R	T	L	H	F	D	E	P	S	P	Q	I	E	W	A	V	S	V	V	S	Q	A	R	S	W	P	A	G	E	R	P	R	R	A	G	V	S	S	F	G	I	S	G	T	N	A	H	V	I	V	E	E
Template Known Secondary structure									T						T	T			S	B		T	T	S									S								S	S											T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		387	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.