Job Description P76461 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:23:06 GMT 2012 Rank 34 Aligned Residues 293 % Identity 22% Template c2buiC_ PDB info PDB header:synthase Chain: C: PDB Molecule:3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase i; PDBTitle: e.coli beta-ketoacyl (acyl carrier protein) synthase i in2 complex with octanoic acid, 120k Resolution 2.4 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10		.	.	.	.	.	.	.												.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	30	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	K	N	C	V	I	V	S	A	V	.	R	T	A	I	G	S	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	S	L	A	S	T	S	A	I	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	A	T	V	I	K
Query Conservation												.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	K	R	A	V	I	T	G	L	G	I	V	S	S	I	G	N	N	Q	Q	E	V	L	A	S	L	R	E	G	R	S	G	I	T	F	S	Q	E	L	K	D	S	G	M	R	S	H	V	W	G	N	V	K	L	D	T	T	G	L	I	D	R	K	V	V	R	F	M	S	D	A	S	I	Y	A	F	L	S	M	E
Template Known Secondary structure														B	T	T	B	S	S											T													T	T		S												T	T	S	S						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		36	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.						50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	A	I	E	R	A	K	I	D	S	Q	H	V	D	.	.	.	.	.	E	V	I	M	G	N	V	L	Q	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	Q	N	P	A	R	Q	A	L	L	K	S	G	L	A	E	T	V	C	G	F	T
Query Conservation																.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.
Template Conservation																																																																										.	.
Template Sequence		Q	A	I	A	D	A	G	L	S	P	E	A	Y	Q	N	N	P	R	V	G	L	I	A	G	S	G	G	G	S	P	R	F	Q	V	F	G	A	D	A	M	R	G	P	R	G	L	K	A	V	G	P	Y	V	V	T	K	A	M	A	S	G	V	S	A	C	L	A	T	P	F	K	I	.	.	H	G	V	N	Y	S
Template Known Secondary structure								T							T	T		T	T								S	S														T	S	T	T							S							S	T	T								T	T	T	T		.	.		S
Template Predicted Secondary structure																																																																										.	.
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.			.	.	.	.	.	.
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	N	K	V	C	G	S	G	L	K	S	V	A	L	A	A	Q	A	I	Q	A	G	Q	A	Q	S	I	V	A	G	G	M	E	N	M	S	L	A	P	Y	L	L	D	A	K	A	R	S	G	Y	R	L	G	D	G	Q	V	Y	D	V	I	L	R	D	G	L	M	C	A	T	H	G	Y	H	M	G	I	T	A	E
Query Conservation
Alig confidence																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	S	S	A	C	A	T	S	A	H	C	I	G	N	A	V	E	Q	I	Q	L	G	K	Q	D	I	V	F	A	G	G	G	E	E	L	C	W	E	M	A	C	E	F	D	A	M	G	A	L	S	T	K	Y	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					G	G	G															T	T	S		S																						T		B			S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	V	A	K	E	Y	G	I	T	R	E	M	Q	D	E	L	A	L	H	S	Q	R	K	A	A	A	A	I	E	S	G	A	F	T	A	E	I	V	P	V	N	V	V	T	R	K	K	T	F	V	F	S	Q	D	E	F	P	K	A	N	S	T	A	E	A	L	G	A	L	R	P	A	F	D	K	A	G	T	V	T
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	T	P	E	K	A	S	R	T	Y	D	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S							T	T	B	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																						213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.
		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.				290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
Predicted Secondary structure																																																.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.
Query Sequence		A	G	N	A	S	G	I	N	D	G	A	A	A	L	V	I	M	E	E	S	A	A	L	A	A	G	L	T	P	L	A	R	I	K	S	Y	A	S	G	G	V	P	P	A	L	M	.	.	.	G	M	G	P	V	P	A	T	Q	K	A	L	Q	L	A	G	L	Q	L	A	D	I	D	L	I	E	A	N	E	A	F
Query Conservation																																																.	.	.
Alig confidence																																																.	.	.																		.	.	.
Template Conservation																																																																				.	.	.
Template Sequence		H	R	D	G	F	V	I	A	G	G	G	G	M	V	V	V	E	E	L	E	H	A	L	A	R	G	A	H	I	Y	A	E	I	V	G	Y	G	A	T	S	D	G	A	D	M	V	A	P	S	G	E	G	A	V	R	C	M	K	M	A	M	H	G	V	D	T	.	.	.	P	I	D	Y	L	N	S	H	G	T	S
Template Known Secondary structure		T			S	B		B	B																	T	T																	S		S	S	S			S												T	T			S	.	.	.			S								S
Template Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.
Template SS confidence
		225	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290				.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.
		321	.					.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	A	.	.	.	.	Q	F	L	A	V	G	K	N	L	G	F	D	S	E	K	V	N	V	N	G	G	A	I	A	L	G	H	P	I	G	A	S	G	A	R	I	L	V	T	L	L	H	A	M	Q	A	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation				.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.										.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.
Template Sequence		T	P	V	G	D	V	K	E	L	A	A	I	R	E	V	.	F	G	D	K	S	P	A	I	S	A	T	K	A	M	T	G	H	S	L	G	A	A	G	V	Q	E	A	I	Y	S	L	L	M	L	E	H	G	F	I	A	P	S	I	N	I	E	E	L	D	E	Q	A	A	G	L	N	I	V	T	E	T	T	D	R
Template Known Secondary structure																	.		T	T								T						B		G	G	G																T									S	S	B		G	G	G	T	T	S		B			S
Template Predicted Secondary structure																	.
Template SS confidence
		302	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.		.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	K	T	L	G	L	A	T	L	C	I	G	G	G	Q	G	I	A	M	V	I	E	R	L
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		E	L	T	T	V	M	S	N	S	F	G	F	G	G	T	N	A	T	L	V	M	R	K	L
Template Known Secondary structure													T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		381	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.