Job Description P28629 Confidence 99.68% Date Wed Jan 25 15:20:47 GMT 2012 Rank 154 Aligned Residues 305 % Identity 17% Template d2bkwa1 SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases Cystathionine synthase-like Resolution 2.57

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		205	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.						.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.				.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.			.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.																				.	.	.																.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.																				.	.	.																.	.
Query Sequence		G	A	F	G	E	S	E	K	Y	A	A	R	V	F	G	A	D	R	S	.	.	.	.	.	W	S	V	V	V	G	T	S	G	S	N	R	T	I	M	Q	A	C	M	.	.	.	T	D	N	D	V	V	V	V	D	R	N	C	H	K	S	.	.	I	E	Q	G	L	M	L	T	G	A	K	P	V	Y	M	V	P
Query Conservation																					.	.	.	.	.																				.	.	.																.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.																				.	.	.																.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	I	F	Q	R	V	L	K	N	T	R	A	V	F	K	S	A	A	A	S	K	S	Q	P	F	V	L	A	G	S	G	T	L	G	W	D	I	F	A	S	N	F	I	L	S	K	A	P	N	K	N	V	L	V	V	S	T	G	T	F	S	D	R	F	A	D	C	L	R	S	Y	G	A	Q	V	D	V	V	R	P
Template Known Secondary structure															T	T			G	G	G	T								S		T	T											S		T	T		S									S	S													T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		38	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.
		275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.		.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.			.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
Predicted Secondary structure																																																	.																					.	.
Query SS confidence																																																	.																					.	.
Query Sequence		S	R	N	R	Y	G	I	I	G	P	I	Y	P	Q	E	M	Q	P	E	T	L	Q	K	K	I	S	E	S	P	L	T	K	D	K	A	G	Q	K	P	S	Y	C	V	V	T	N	C	.	T	Y	D	G	V	C	Y	N	A	K	E	A	Q	D	L	L	E	K	T	S	.	.	D	R	L	H	F	D	E	A	W	Y
Query Conservation																																																	.																					.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.											.																					.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	K	I	G	E	S	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	L	E	L	I	T	E	K	L	S	Q	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	Y	G	A	V	T	V	T	H	V	D	T	S	T	A	V	L	S	D	L	K	A	I	S	Q	A	I	K	Q	T	S	P	E	T	F	F	V	V	D	A	V	C	S
Template Known Secondary structure		S	S	T	T	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.												S	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S						S			T	T	T	T																	T	T	S							T	T	T
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		118	.	120	.	.	.	.										.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.										.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.																.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	Y	A	R	F	N	P	I	Y	A	D	H	Y	A	M	R	G	E	P	G	D	H	N	G	P	T	V	F	A	T	H	S	T	H	K	L	L	N	A	L	S	Q	A	S	Y	I	H	V	R	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	R	G	A	I	N	F	S	R	F	N	Q	A	Y	M
Query Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.									.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.									.
Template Sequence		I	G	C	E	.	.	.	.	.	.	E	F	E	F	D	E	W	G	V	D	.	.	.	.	.	.	.	F	A	L	T	A	S	Q	A	.	I	G	A	P	A	G	L	S	I	S	L	C	S	S	R	F	X	D	Y	A	L	N	D	S	K	N	G	H	V	H	G	Y	F	S	S	L	R	R	W	T	P	I	X	E
Template Known Secondary structure		T	T	T	S	.	.	.	.	.	.				T	T	T	T	T		S	.	.	.	.	.	.	.									.					S																T									S		S	T	T
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.									.
Template SS confidence
		180	.	.	.							.	.	.	.	.	.	190	.	.	.								.	.	.	.	.	.	200	.		.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
		417	.							.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	H	.	.	.	.	.	.	A	T	T	S	P	L	Y	A	I	C	A	S	N	D	V	A	V	S	M	M	D	G	N	S	G	L	S	L	T	Q	E	V	I	D	E	A	V	D	F	R	Q	A	M	A	R	L	Y	K	E	F	T	A	D	G	S	W	F	F	K	P	W	N	K	E	V	V	T	D	P	Q	T	G
Query Conservation				.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	Y	E	A	G	K	G	A	Y	F	A	T	P	P	V	Q	L	I	N	S	L	D	V	A	L	K	E	I	L	E	E	G	L	H	K	R	W	D	L	H	R	E	X	S	D	W	F	K	D	S	L	V	N	G	L	Q	L	T	S	V	S	R	Y	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					T	T					S	S																																										T	T	T					S	S		S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
		491	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	T	Y	D	F	A	D	A	P	T	K	L	L	T	T	V	Q	D	C	W	V	M	H	P	G	E	S	W	H	G	F	K	D	I	P	D	N	W	S	M	L	D	P	I	K	V	S	I	L	A	P	G	M	G	E	D	G	E	L	E	E	T	G	V	P	A	A	L	V	T	A	W	L	G	R	H	G	I	V	P
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	N	X	S	A	H	G	L	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	V	Y	V	A	D	P	P	D	V	I	A	F	L	K	S	H	G	V	V	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	T	B		S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.					S												T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																											311	.	.	.	.	.	.	.	.										320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340
							571	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.		.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.														.
Query SS confidence		.	.	.	.	.														.
Query Sequence		.	.	.	.	.	T	R	T	T	D	F	Q	I	M	F	L	F	S	.	M	G	V	T	R	G	K	W	G	T	L	V	N	T	L	C	S	F	K	R	H	Y	D	A
Query Conservation		.	.	.	.	.														.
Alig confidence		.	.	.	.	.														.
Template Conservation
Template Sequence		A	G	G	I	H	K	D	I	G	P	K	Y	I	R	I	G	H	X	G	V	T	A	C	N	K	N	L	P	Y	X	K	N	C	F	D	L	I	K	L	A	L	Q	R
Template Known Secondary structure		B					T	T	T	G	G	G								G	G	G	T	S	S	T	T		T													T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		341	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.