Job Description P28629 Confidence 99.72% Date Wed Jan 25 15:20:47 GMT 2012 Rank 134 Aligned Residues 324 % Identity 14% Template d1w7la_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases AAT-like Resolution 2.0

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		201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220									.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	D	H	T	G	A	F	G	E	S	E	K	Y	A	A	R	V	F	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	D	R	S	W	S	V	V	V	G	T	S	G	S	N	R	T	I	M	Q	A	C	M	T	D	N	D	V	V	V	V	D	R	N	C	H	K	S	I	E	Q	G	L	M	L	T	G	A	K	P	V	Y	M
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	T	K	T	F	G	Y	P	P	L	T	K	I	L	A	S	F	F	G	E	L	L	G	Q	E	I	D	P	L	R	N	V	L	V	T	V	G	G	Y	G	A	L	F	T	A	F	Q	A	L	V	D	E	G	D	E	V	I	I	I	E	P	F	F	D	C	Y	E	P	M	T	M	M	A	G	G	R	P	V	F	V
Template Known Secondary structure					T	T																		T													S																T	T								S			T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		63	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.
		273	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.					.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.
Query SS confidence																																																				.	.	.	.
Query Sequence		V	P	S	R	N	R	Y	G	I	I	G	P	I	Y	P	Q	E	M	Q	P	E	T	L	Q	K	K	I	S	E	S	P	L	T	K	D	K	A	G	Q	K	P	S	Y	C	V	V	T	N	C	T	.	.	.	.	Y	D	G	V	C	Y	N	A	K	E	A	Q	D	L	L	E	K	T	S	D	R	L	H	F	D	E
Query Conservation																																																				.	.	.	.
Alig confidence															.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.
Template Conservation															.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	L	K	P	G	P	G	E	L	G	S	S	S	.	N	W	Q	L	D	P	M	E	L	A	G	K	F	T	S	R	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	L	V	L	N	T	P	N	N	P	L	G	K	V	F	S	R	E	E	L	E	L	V	A	S	L	C	Q	Q	H	D	V	V	C	I	T	D	E
Template Known Secondary structure										S			G	G	.	G														T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S	S		T	T	T																				T
Template Predicted Secondary structure															.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		143	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.		.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.											.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.
		349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	W	Y	G	Y	A	R	F	N	P	I	Y	A	D	H	Y	A	M	R	G	E	P	G	D	H	N	G	P	T	V	F	A	T	H	S	T	H	K	L	L	N	A	L	S	Q	A	S	Y	I	H	V	R	E	G	R	G	A	I	N	F	S	R	F	N	Q	A	Y	M	M	H	A	T	T	S	P	L	Y	A	I	C
Query Conservation
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.
Template Sequence		V	Y	Q	W	M	V	Y	D	G	H	Q	H	I	S	I	A	S	L	P	G	M	W	E	R	.	.	.	.	.	.	T	L	T	I	G	S	A	G	T	F	S	A	T	G	W	K	V	G	W	V	L	G	P	.	.	.	.	D	H	I	M	K	H	L	R	T	V	H	Q	N	S	V	F	H	C	P	T	Q	S	Q
Template Known Secondary structure		T	T	T	T		B		T	T						G	G	G	S	T	T	T	G	G	G	.	.	.	.	.	.											S		G	G	G									.	.	.	.													T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.
Template SS confidence
		215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.							.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.					.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
		429	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.							440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	S	N	D	V	A	V	S	M	M	D	.	.	.	.	.	.	G	N	S	G	L	S	L	T	Q	E	V	I	D	E	A	V	D	F	R	Q	A	M	A	R	L	Y	K	E	F	T	A	D	G	S	W	F	F	K	P	W	N	K	E	V	V	T	D	P	Q	T	G	K	T	Y	D	F	A	D	A	P	T	K	L
Query Conservation													.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	A	V	A	E	S	F	E	R	E	Q	L	L	F	R	Q	P	S	S	Y	F	V	Q	F	P	Q	A	M	Q	R	C	R	D	H	M	I	R	S	L	Q	S	V	G	L	K	P	L	I	P	Q	G	S	Y	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure														T	T	T	S	T	T	S																						T	T	T							S	B	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		503	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.					.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.
Query Sequence		L	T	T	V	Q	D	C	W	V	M	H	P	G	E	S	W	H	G	F	K	D	I	P	D	N	W	S	M	L	D	P	I	K	V	S	I	L	A	P	G	.	.	.	.	M	G	E	D	G	E	L	E	E	T	G	V	P	A	A	L	V	T	A	W	L	G	R	H	G	I	V	P	T	R	T	T	D	F	Q	I
Query Conservation																																										.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	I	T	D	I	S	D	F	K	R	K	M	P	D	L	P	G	A	V	D	E	P	Y	D	R	R	F	V	K	W	M	I	K	N	K	G	L	V	A	I	P	V	S	I	F	Y	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			T	T																						G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																			340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
											579	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	F	L	F	S	M	G	V	T	R	G	K	W	G	T	L	V	N	T	L	C	S	F	K	R	H
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	P	H	Q	K	H	F	D	H	Y	I	R	F	C	F	V	K	D	E	A	T	L	Q	A	M	D	E	K	L	R	K	W	K	V	E
Template Known Secondary structure						T	T	S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		387	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.

No model constructed - rank, confidence too low