Job Description P28629 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:20:47 GMT 2012 Rank 4 Aligned Residues 454 % Identity 32% Template d1c4ka2 SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases Ornithine decarboxylase major domain Resolution 2.70

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		140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.		.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.
Query SS confidence																																																									.
Query Sequence		P	P	L	F	S	A	L	M	K	Y	S	D	I	H	E	Y	S	W	A	A	P	G	H	Q	G	G	V	G	F	T	K	T	P	A	G	R	F	Y	H	D	Y	Y	G	E	N	L	F	R	T	D	M	G	I	E	R	.	T	S	L	G	S	L	L	D	H	T	G	A	F	G	E	S	E	K	Y	A	A	R	V	F
Query Conservation																																																									.
Alig confidence																																																						.			.
Template Conservation																																																						.
Template Sequence		P	P	F	F	K	S	L	K	E	Y	V	S	R	Y	L	I	Q	F	D	C	P	G	H	Q	G	G	Q	Y	Y	R	K	H	P	A	G	R	E	F	Y	D	F	F	G	E	T	V	F	R	A	D	L	C	.	N	A	D	V	A	L	G	D	L	L	I	H	E	G	P	A	V	A	A	E	K	H	A	A	R	V	Y
Template Known Secondary structure													T	S						S	S	S	T	T	T	T	T	T	T	G	G	G	S												S					S				.	T	T	S	G	G	G		B	T	T	T	T	B	T													T
Template Predicted Secondary structure																																																						.
Template SS confidence
		108	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.
		219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260		.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.
Query SS confidence																																												.
Query Sequence		G	A	D	R	S	W	S	V	V	V	G	T	S	G	S	N	R	T	I	M	Q	A	C	M	T	D	N	D	V	V	V	V	D	R	N	C	H	K	S	I	E	Q	.	G	L	M	L	T	G	A	K	P	V	Y	M	V	P	S	R	N	R	Y	G	I	I	G	P	I	Y	P	Q	E	M	Q	P	E	T	L	Q	K
Query Conservation																																												.
Alig confidence																																												.
Template Conservation
Template Sequence		N	A	D	K	T	Y	F	V	L	G	G	S	S	N	A	N	N	T	V	T	S	A	L	V	S	N	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	V	Y	N	S	A	L	A	M	A	G	G	R	P	V	Y	L	Q	T	N	R	N	P	Y	G	F	I	G	G	I	Y	D	S	D	F	D	E	K	K	I	R	E
Template Known Secondary structure		T		S						S	S																T	T							T	T										T	T	T	T													T	T								G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		187	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.
		298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	I	S	E	S	P	L	T	K	D	K	A	G	Q	K	P	S	Y	C	V	V	T	N	C	T	Y	D	G	V	C	Y	N	A	K	E	A	Q	D	L	L	E	K	T	S	D	R	L	H	F	D	E	A	W	Y	G	Y	A	R	F	N	P	I	Y	A	D	H	Y	A	M	R	G	E	P	G	D	H	N	G	P	T
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	A	A	K	V	D	P	E	R	A	K	W	K	R	P	F	R	L	A	V	I	Q	L	G	T	Y	D	G	T	I	Y	N	A	H	E	V	V	K	R	I	G	H	L	C	D	Y	I	E	F	D	S	A	W	V	G	Y	E	Q	F	I	P	M	M	R	N	S	S	P	L	L	I	D	D	L	G	P	E	D	P	G
Template Known Secondary structure			T	T	T	S	S					T		S			B	S						S	B		T	T	S													G	G	G	B	S							T	T			G	G	G	S	S	G	G	G	G	G	G		T	T	S						T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		267	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.
		378	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.						.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.
Query Sequence		V	F	A	T	H	S	T	H	K	L	L	N	A	L	S	Q	A	S	Y	I	H	V	R	E	G	R	G	.	.	.	.	.	A	I	N	F	S	R	F	N	Q	A	Y	M	M	H	A	T	T	S	P	L	Y	A	I	C	A	S	N	D	V	A	V	S	M	M	D	G	N	S	G	L	S	L	T	Q	E	V	I	D
Query Conservation																													.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	I	V	V	Q	S	V	H	K	Q	Q	A	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	S	H	I	K	G	Q	L	R	Y	C	D	H	K	H	F	N	N	S	F	N	L	F	M	S	T	S	P	F	Y	P	M	Y	A	A	L	D	V	N	A	A	M	Q	E	G	E	A	G	R	K	L	W	H	D	L	L	I
Template Known Secondary structure												S	S			T	T									G	G	G	T	T	S	T	T															S		S	S																	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		347	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.
		453	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	A	V	D	F	R	Q	A	M	A	R	L	Y	K	E	F	T	A	D	G	S	W	F	F	K	P	W	N	K	E	V	V	T	D	P	Q	T	G	K	T	Y	D	F	A	D	A	P	T	K	L	L	T	T	V	Q	D	C	W	V	M	H	P	G	E	S	W	H	G	F	K	D	I	P	D	N	W	S	M	L	D
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	T	I	E	A	R	K	K	L	I	K	A	G	S	M	F	R	P	F	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	P	V	V	N	G	K	K	W	E	D	G	D	T	E	D	M	A	N	N	I	D	Y	W	R	F	E	K	G	A	K	W	H	A	Y	E	G	Y	G	D	N	Q	Y	Y	V	D
Template Known Secondary structure													T	T		S	S			S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S			T	T			G	G	G	S						T	T		G	G	G	G	B			T	T		T	T	T			T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		427	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.															.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.
		533	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.		.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.
Query SS confidence															.
Query Sequence		P	I	K	V	S	I	L	A	P	G	M	G	E	.	D	G	E	L	E	E	T	G	V	P	A	A	L	V	T	A	W	L	G	R	H	G	I	V	P	T	R	T	T	D	F	Q	I	M	F	L	F	S	M	G	V	T	R	G	K	W	G	T	L	V	N	T	L	C	S	F	K	R	H	Y	D	A	N
Query Conservation															.
Alig confidence															.
Template Conservation
Template Sequence		P	N	K	F	M	L	T	T	P	G	I	N	P	E	T	G	D	Y	E	D	F	G	V	P	A	T	I	V	A	N	Y	L	R	D	H	G	I	I	P	E	K	S	D	L	N	S	I	L	F	L	M	T	P	A	E	T	P	A	K	M	N	N	L	I	T	Q	L	L	Q	L	Q	R	L	I	E	E	D
Template Known Secondary structure		T	T							S	S			T	T	T	T				S	S														T	T				S				S	S								T	T																						T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		493	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.