Job Description P28629 Confidence 99.67% Date Wed Jan 25 15:20:47 GMT 2012 Rank 155 Aligned Residues 333 % Identity 15% Template d1ax4a_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases Beta-eliminating lyases Resolution 2.10

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		198	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.								.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270
Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																												.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	S	L	L	D	H	T	G	A	F	G	E	S	E	K	Y	A	A	R	V	F	G	A	D	R	S	W	S	V	V	V	G	T	S	G	S	N	R	T	I	M	Q	A	C	M	T	D	N	D	V	V	V	V	D	R	N	C	H	.	.	.	.	.	.	.	K	S	I	E	Q	G	L	M	L	T	G	A	K	P	V
Query Conservation																																																												.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																		.																										.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.
Template Sequence		D	E	A	Y	A	G	S	R	N	Y	Y	D	L	K	D	K	A	K	E	L	F	N	Y	D	Y	I	I	P	A	H	Q	G	.	R	G	A	E	N	I	L	F	P	V	L	L	K	Y	K	Q	K	E	G	K	A	K	N	P	V	F	I	S	N	F	H	F	D	T	T	A	A	H	V	E	L	N	G	C	K	A	I
Template Known Secondary structure					S	S	S																								S	S		.																		T	T			S	S						S	S												T	T
Template Predicted Secondary structure																																		.
Template SS confidence
		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100		.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
		271	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.				.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.	.
Query SS confidence																																																												.	.	.
Query Sequence		Y	M	V	P	S	R	N	R	Y	G	I	I	G	P	I	Y	P	Q	E	M	Q	P	E	T	L	Q	K	K	I	S	E	S	P	L	T	K	D	K	A	G	Q	K	P	S	Y	C	V	V	T	N	C	T	Y	D	G	V	C	Y	.	.	.	N	A	K	E	A	Q	D	L	L	E	K	T	S	D	R	L	H	F	D
Query Conservation																																																												.	.	.
Alig confidence																																			.	.	.	.																						.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.
Template Sequence		N	I	V	T	E	K	A	F	D	S	E	T	Y	D	D	W	K	G	D	F	D	I	K	K	L	K	E	N	I	A	Q	H	G	.	.	.	.	A	D	N	I	V	A	I	V	S	T	V	T	C	N	S	A	G	G	Q	P	V	S	M	S	N	L	K	E	V	Y	E	I	A	K	Q	H	G	I	F	V	V	M	D
Template Known Secondary structure				B		G	G	G	G		T	T	S			T	T	T	T		B														.	.	.	.	G	G	G								S	S	B	T	T	T	T	S	B																		T
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.
Template SS confidence
		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180					.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
		348	.	350	.												.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	A	W	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Y	A	R	F	N	P	I	Y	A	D	H	Y	A	M	R	G	E	P	G	D	H	N	G	P	T	V	F	A	T	H	S	T	H	K	L	L	N	A	L	S	Q	A	S	Y	I	H	V	R	E	G	R	G	A	I	N	F	S	R	F	N	Q	A	Y	M
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.															.	.									.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.															.	.									.	.	.
Template Sequence		S	A	R	F	C	E	N	A	Y	F	I	K	A	R	D	P	K	Y	K	N	A	T	I	K	E	V	I	F	D	M	Y	K	Y	A	D	.	.	.	.	.	.	.	A	L	T	M	S	A	K	D	P	L	L	N	I	G	.	.	G	L	V	A	I	R	D	N	.	.	.	E	E	I	F	T	L	A	R	Q	R	C
Template Known Secondary structure			T	T													G	G	G	T	T											G	G	G		S	.	.	.	.	.	.	.												S	S		.	.						S	S		.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.															.	.									.	.	.
Template SS confidence
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.								.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.			.	.	.	.	.	.	.	280				.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
		417	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.			.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.
Query SS confidence																												.	.
Query Sequence		M	H	A	T	T	S	P	L	Y	A	I	C	A	S	N	D	V	A	V	S	M	M	D	G	N	S	.	.	G	L	S	L	T	Q	E	V	I	D	E	A	V	D	F	R	Q	A	M	A	R	L	Y	K	E	F	T	A	D	G	S	W	F	F	K	P	W	N	K	E	V	V	T	D	P	Q	T	G	K	T	Y	D
Query Conservation																												.	.
Alig confidence																												.	.																							.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	P	M	E	G	F	V	T	Y	G	G	L	A	G	R	D	M	A	A	M	V	Q	G	L	E	E	G	T	E	E	E	Y	L	H	Y	R	I	G	Q	V	K	Y	L	G	D	R	L	R	E	A	.	G	I	P	I	Q	Y	P	T	G	G	H	A	V	F	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					T		S	T	T	T	T	T																T	T																						T	.	T			B		S	S			S	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																				.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		293	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.		.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.
		495	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570
Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Query SS confidence																																																																														.	.	.	.
Query Sequence		F	A	D	A	P	T	K	L	L	T	T	V	Q	D	C	W	V	M	H	P	G	E	S	W	H	G	F	K	D	I	P	D	N	W	S	M	L	D	P	I	K	V	S	I	L	A	P	G	M	G	E	D	G	E	L	E	E	T	G	V	P	A	A	L	V	T	A	W	L	G	R	H	G	I	V	P	.	.	.	.
Query Conservation																																																																														.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	C	K	K	L	V	P	Q	I	P	G	D	Q	F	P	A	Q	A	.	.	.	.	.	.	.	.	V	I	N	A	L	Y	L	E	S	G	V	R	A	V	E	I	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	T	T	T		T	T	S		G	G	G						.	.	.	.	.	.	.	.																	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																							358	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.									.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.
															571	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.		.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	R	T	T	D	F	Q	I	M	F	L	F	S	M	G	V	.	T	R	G	K	W	G	T	L	V	N	T	L	C	S	F	K	R	H	Y	D	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Template Conservation
Template Sequence		S	F	L	L	G	R	D	P	A	T	G	E	Q	K	H	A	D	M	E	F	M	R	L	T	I	A	R	R	V	Y	T	N	D	H	M	D	Y	I	A	D	A	L	I	G	L	K	E	K	F	A	T
Template Known Secondary structure							B		T	T	T		S	B				S										T	T	S	S														T	T					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		393	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.