Job Description P28629 Confidence 99.75% Date Wed Jan 25 15:20:47 GMT 2012 Rank 104 Aligned Residues 304 % Identity 12% Template c3ri6A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:o-acetylhomoserine sulfhydrylase; PDBTitle: a novel mechanism of sulfur transfer catalyzed by o-acetylhomoserine2 sulfhydrylase in methionine biosynthetic pathway of wolinella3 succinogenes Resolution 2.20 Å

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		200	.	.	.	.	.	.	.	.		.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.					.	.	.	.	270	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.																																																										.	.	.	.
Query SS confidence											.																																																										.	.	.	.
Query Sequence		L	L	D	H	T	G	A	F	G	.	E	S	E	K	Y	A	A	R	V	F	G	A	D	R	S	W	S	V	V	V	G	T	S	G	S	N	R	T	I	M	Q	A	C	M	T	D	N	D	V	V	V	V	D	R	N	C	H	K	S	I	E	Q	G	L	M	L	T	.	.	.	.	G	A	K	P	V	Y	M	V	P
Query Conservation											.																																																										.	.	.	.
Alig confidence											.																.																																										.	.	.	.
Template Conservation																											.
Template Sequence		L	H	V	P	S	N	P	T	V	E	D	L	E	Q	R	L	K	N	L	T	G	A	L	G	V	.	L	A	L	G	S	G	M	A	A	I	S	T	A	I	L	T	L	A	R	A	G	D	S	V	V	T	T	D	R	L	F	G	H	T	L	S	L	F	Q	K	T	L	P	S	F	G	I	E	V	R	F	V	D	V
Template Known Secondary structure																						T		S			.				S																T	T							T	T											T					T	T								T
Template Predicted Secondary structure																											.
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.		.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
		275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.		.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.
Query SS confidence																																																			.
Query Sequence		S	R	N	R	Y	G	I	I	G	P	I	Y	P	Q	E	M	Q	P	E	T	L	Q	K	K	I	S	E	S	P	L	T	K	D	K	A	G	Q	K	P	S	Y	C	V	V	T	N	C	T	Y	.	D	G	V	C	Y	N	A	K	E	A	Q	D	L	L	E	K	T	S	D	R	L	H	F	D	E	A	W	Y	G	Y
Query Conservation																																																			.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	S	L	A	V	E	H	A	C	D	E	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	L	L	F	L	E	T	I	S	N	P	Q	L	Q	V	A	D	L	E	A	L	S	K	V	V	H	A	K	G	I	P	L	V	V	D	T	T	M	T	P	P
Template Known Secondary structure		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S	S		T	T	T															T	T	T								T	T	S		T
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		132																.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.											.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.
		354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	R	F	N	P	I	Y	A	D	H	Y	A	M	R	G	E	P	G	D	H	N	G	P	T	V	F	A	T	H	S	T	H	K	L	L	N	A	L	S	Q	A	S	Y	I	H	V	R	E	G	R	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	I	N	F	S	R	F	N	Q	A	Y
Query Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.			.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.			.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	L	L	E	A	K	R	L	G	.	.	.	.	.	.	.	V	D	.	.	.	.	.	.	.	I	E	V	L	S	S	T	K	F	I	S	G	G	G	T	S	V	G	G	V	L	I	D	H	G	L	F	E	W	K	S	L	P	S	L	A	P	Y	Y	A	K	A	G	P	M	A	F	L	Y	K	A	R	K	E	V
Template Known Secondary structure		T	T			G	G	G	G	T	.	.	.	.	.	.	.		S	.	.	.	.	.	.	.												T	T												S		S		G	G	G	S	T	T	T								G	G	G									T
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.			.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		187	.	.	190	.	.	.	.	.								.	.								.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.
		416	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	M	H	A	T	T	S	P	L	Y	A	I	C	A	S	N	D	V	A	V	S	M	M	D	G	N	S	G	L	S	L	T	Q	E	V	I	D	E	A	V	D	F	R	Q	A	M	A	R	L	Y	K	E	F	T	A	D	G	S	W	F	F	K	P	W	N	K	E	V	V	T	D	P	Q	T	G	K	T	Y	D	F
Query Conservation
Alig confidence																										.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	Q	N	L	G	P	S	L	S	P	H	N	A	Y	L	Q	S	L	G	L	E	T	M	A	.	.	.	.	.	L	R	I	E	R	S	C	Q	N	A	Q	E	L	A	H	W	L	L	S	I	P	Q	V	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																										.	.	.	.	.																		T	T		T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.						.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
		496	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.
Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Query SS confidence																																																																															.	.	.
Query Sequence		A	D	A	P	T	K	L	L	T	T	V	Q	D	C	W	V	M	H	P	G	E	S	W	H	G	F	K	D	I	P	D	N	W	S	M	L	D	P	I	K	V	S	I	L	A	P	G	M	G	E	D	G	E	L	E	E	T	G	V	P	A	A	L	V	T	A	W	L	G	R	H	G	I	V	P	T	R	.	.	.
Query Conservation																																																																															.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	V	N	H	P	S	L	P	D	S	P	F	Y	A	I	A	K	R	Q	F	R	Y	A	G	S	I	L	T	F	E	L	E	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	E	A	S	Y	R	F	M	D	A	L	K	L	I	R	R	A	T	N	I	H	D	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	S	T	T	S	T	T									S	S			S							S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												S	S	S				S			S		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.											.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
																	573	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	D	F	Q	I	M	F	L	F	S	M	G	V	T	R	G	K	W	G	T	L	V	N	T	L	C
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	S	L	I	L	S	P	Y	H	V	I	L	K	L	E	I	S	P	A	M	M	R	L	S	V	G	I	E	E	I	E	D	L	K	E	D	I	L	Q	A	L	C
Template Known Secondary structure		S						T	G	G	G			G	G	G	S		T	T								S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.