Job Description P28629 Confidence 99.86% Date Wed Jan 25 15:20:47 GMT 2012 Rank 58 Aligned Residues 328 % Identity 12% Template c3pj0D_ PDB info PDB header:lyase Chain: D: PDB Molecule:lmo0305 protein; PDBTitle: crystal structure of a putative l-allo-threonine aldolase (lmo0305)2 from listeria monocytogenes egd-e at 1.80 a resolution Resolution 1.80 Å

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		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	S	W	A	A	P	G	H	Q	G	G	V	G	F	T	K	T	P	A	G	R	F	Y	H	D	Y	Y	G	E	N	L	F	R	T	D	M	G	I	E	R	T	S	L	G	S	L	L	D	H	T	G	A	F	G	E	S	E	K	Y	A	A	R	V	F	G	A	D	R	S	W	S	V	V	V	G	T	S	G	S	N
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.
Template Sequence		T	P	Y	K	L	G	G	N	G	P	R	N	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	L	T	E	A	L	Q	N	I	D	D	N	L	E	S	D	I	Y	G	N	G	A	V	I	E	D	F	E	T	K	I	A	K	I	L	G	K	Q	S	A	V	F	F	P	S	G	.	T	X	A	Q
Template Known Secondary structure			S			S	S	B	S	S			S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T	T	S		T	T					B	T	T	B	S															T		S						S			.
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.
Template SS confidence
		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.																.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.		.	.	.	.
		235	.	.	.	.	240	.	.			.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.				.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.																				.	.	.
Query SS confidence										.	.																				.	.	.
Query Sequence		R	T	I	M	Q	A	C	M	.	.	T	D	N	D	V	V	V	V	D	R	N	C	H	K	S	I	E	Q	G	.	.	.	L	M	L	T	G	A	K	P	V	Y	M	V	P	S	R	N	R	Y	G	I	I	G	P	I	Y	P	Q	E	M	Q	P	E	T	L	Q	K	K	I	S	E	S	P	L	T	K	D	K	A
Query Conservation										.	.																				.	.	.
Alig confidence										.	.																				.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	I	A	L	R	I	W	A	D	R	K	E	N	R	R	V	A	Y	H	P	L	S	H	L	E	I	H	E	Q	D	G	L	K	E	L	Q	Q	I	T	P	L	L	L	G	T	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	Q	L	L	T	I	D	D	I	K	S	L	R	E	P	V	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure													T								T	T						S	S	T	T														S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S									T		S	S			.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		76	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.												.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.
		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.				.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.
Query Sequence		G	Q	K	P	S	Y	C	V	V	T	N	C	T	Y	D	G	V	C	.	.	.	Y	N	A	K	E	A	Q	D	L	L	E	K	T	S	D	R	L	H	F	D	E	A	W	Y	G	Y	A	R	F	N	P	I	Y	A	D	H	Y	A	M	R	G	E	P	G	D	H	N	G	P	T	V	F	A	T	H	S	T	H	K
Query Conservation																				.	.	.
Alig confidence		.	.																	.	.	.																																		.											.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.																																																					.											.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	S	S	V	L	I	E	L	P	Q	R	E	I	G	G	Q	L	P	A	F	E	E	L	E	K	I	S	E	Y	C	H	E	Q	G	I	S	L	H	L	D	G	A	R	L	W	E	I	T	P	F	Y	Q	K	.	S	A	E	E	I	C	A	L	F	D	.	.	.	.	.	.	.	S	V	Y	V	S	F	Y	G
Template Known Secondary structure		.	.	S						S	S	B	G	G	G	T	S	B																		T								T	T		G	G	G					T		.							T	T		S	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.																																																					.											.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
				138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.								200	.	.	.	.	.	.	.
		387	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	L	N	A	L	S	Q	A	S	Y	I	H	V	R	E	G	R	G	A	I	N	F	S	R	F	N	Q	A	Y	M	M	H	A	T	T	S	P	L	Y	A	I	C	A	S	N	D	V	A	V	S	M	M	D	G	N	S	G	L	S	L	T	Q	E	V	I	D	E	A	V	D	F	R	Q	A	M	A	R	L	Y	K
Query Conservation
Alig confidence		.											.	.	.	.	.	.	.	.																																					.																								.
Template Conservation		.											.	.	.	.	.	.	.	.																																					.																								.
Template Sequence		.	I	G	G	I	A	G	A	I	L	A	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	D	D	F	V	Q	E	A	K	I	W	K	R	R	Y	G	G	D	L	I	S	L	Y	P	Y	I	L	S	A	D	Y	Y	F	E	K	.	R	I	G	K	X	A	E	Y	F	E	A	A	K	G	L	A	E	R	F	N	S	C	S	.
Template Known Secondary structure		.				S	S						.	.	.	.	.	.	.	.																T	T				S																.		G	G	G																	T	S	T	.
Template Predicted Secondary structure		.											.	.	.	.	.	.	.	.																																					.																								.
Template SS confidence
			209	210	.	.	.	.	.	.	.	.									.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.		.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.
		467	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	F	T	A	D	G	S	W	F	F	K	P	W	N	K	E	V	V	T	D	P	Q	T	G	K	T	Y	D	F	A	D	A	P	T	K	L	L	T	T	V	Q	D	C	W	V	M	H	P	G	E	S	W	H	G	F	K	D	I	P	D	N	W	S	M	L	D	P	I	K	V	S	I	L	A	P	G	M	G	E	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	K	T	V	P	E	V	P	V	S	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T					S	S	S		S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																						278	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		547	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.					.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.					570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.			.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.												.	.	.	.																			.	.
Query SS confidence														.	.	.	.												.	.	.	.																			.	.
Query Sequence		G	E	L	E	E	T	G	V	P	A	A	L	.	.	.	.	V	T	A	W	L	G	R	H	G	I	V	.	.	.	.	P	T	R	T	T	D	F	Q	I	M	F	L	F	S	M	G	V	T	.	.	R	G	K	W	G	T	L	V	N	T	L	C	S	F	K	R	H	Y
Query Conservation														.	.	.	.												.	.	.	.																			.	.
Alig confidence														.	.	.	.												.	.	.	.																			.	.
Template Conservation
Template Sequence		X	F	H	V	Y	F	E	N	S	A	D	E	I	G	A	I	L	T	K	I	Q	D	E	T	G	V	G	I	S	G	Y	L	Q	E	K	S	A	D	V	C	A	F	E	V	S	V	G	D	A	F	A	E	I	P	A	K	N	L	E	L	V	F	R	C	L	E	K	E	L
Template Known Secondary structure								S	S																						S							T	T								B		G	G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.