Job Description P28629 Confidence 98.95% Date Wed Jan 25 15:20:47 GMT 2012 Rank 236 Aligned Residues 324 % Identity 15% Template c3n5mD_ PDB info PDB header:transferase Chain: D: PDB Molecule:adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase; PDBTitle: crystals structure of a bacillus anthracis aminotransferase Resolution 2.05 Å

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		203	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.										.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	T	G	A	F	G	E	S	E	K	Y	A	A	R	V	F	G	A	D	R	S	W	S	V	V	V	G	T	S	G	S	N	R	T	I	M	Q	A	C	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	N	D	V	V	V	V	D	R	N	C	H	K	S	I	E	Q	G	L	M	L	T	G	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	H	E	P	A	I	K	L	A	E	K	L	N	E	W	L	G	G	E	Y	V	I	F	F	S	N	S	G	S	E	A	N	E	T	A	F	K	I	A	R	Q	Y	Y	A	Q	K	G	E	P	H	R	Y	K	F	X	S	R	Y	R	G	Y	H	G	N	T	X	A	T	X	A	A	T	G	Q	A	Q	R	R	Y	Q
Template Known Secondary structure																		T	S								S	S																		T	T	T		T	T								T	T					S	S						S				G	G	G	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
						267	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.			.	.	.	.	.					330	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																																											.	.						.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.																																																											.	.						.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	A	K	P	V	Y	M	V	P	S	R	N	R	Y	G	I	I	G	P	I	Y	P	Q	E	M	Q	P	E	T	L	Q	K	K	I	S	E	S	P	L	T	K	D	K	A	G	Q	K	P	S	Y	C	V	V	T	N	C	T	Y	D	.	.	G	V	C	Y	N	.	.	.	.	A	K	E	A	Q	D	L
Query Conservation		.	.	.	.																																																											.	.						.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																																						.	.	.	.																		.	.						.	.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.
Template Sequence		Y	E	P	F	A	S	G	F	L	H	V	T	P	P	D	C	Y	R	X	P	G	I	E	R	E	N	I	Y	D	V	E	C	V	K	E	V	D	R	V	X	T	.	.	.	.	W	E	L	S	E	T	I	A	A	F	I	X	E	P	I	I	T	G	G	G	I	L	X	A	P	Q	D	Y	X	K	A	V	H	E	T
Template Known Secondary structure		T					S										T	T	T	S	T	T	T	T	T	S		G	G	G													.	.	.	.				G	G	G								S	S	B	T	T	T	T		B				T	T
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.
Template SS confidence
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.					.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
		337	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	E	K	T	S	D	R	L	H	F	D	E	A	W	Y	G	Y	A	R	F	N	P	I	Y	A	D	H	Y	A	M	R	G	E	P	G	D	H	N	G	P	T	V	F	A	T	H	S	T	H	K	L	L	N	A	L	S	Q	A	S	Y	I	H	V	R	E	G	R	G	A	I	N	F	S	R	F	N	Q	A	Y	M
Query Conservation
Alig confidence																										.											.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.											.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		C	Q	K	H	G	A	L	L	I	S	D	E	V	I	C	G	F	G	R	T	G	K	A	F	.	G	F	X	N	Y	D	V	K	P	D	.	.	.	.	.	.	.	I	I	T	X	A	K	G	I	T	S	A	Y	L	P	L	S	A	T	A	V	K	R	E	I	Y	E	A	F	K	G	K	G	E	Y	E	F	F	R
Template Known Secondary structure						T								T	T	T	T	T	T	T	T	S	S	S	S	.	G	G	G	G	T	T				S	.	.	.	.	.	.	.						G	G	G	G	T	T	S	S													G	G	G		S	S	S	T	T		S
Template Predicted Secondary structure																										.											.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.		.	.	.	.	270	.	.	.	.	.								.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.
		417	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	H	A	T	T	S	P	L	Y	A	I	C	A	S	N	D	V	A	V	S	M	M	D	G	N	S	G	L	S	L	T	Q	E	V	I	D	E	A	V	D	F	R	Q	A	M	A	R	L	Y	K	E	F	T	A	D	G	S	W	F	F	K	P	W	N	K	E	V	V	T	D	P	Q	T	G	K	T	Y	D	F	A
Query Conservation
Alig confidence																									.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	I	N	T	F	G	G	N	P	A	A	C	A	L	A	L	K	N	L	E	I	I	E	.	.	.	N	E	N	L	I	E	R	S	A	Q	X	G	S	L	L	L	E	Q	L	K	E	E	I	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					S	S	S	S																	.	.	.		T	T																					T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		314	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.				.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.
		497	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.									.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	A	P	T	K	L	L	T	T	V	Q	D	C	W	V	M	H	P	G	E	S	W	H	G	F	K	D	I	P	D	N	W	S	M	L	D	P	I	K	V	S	I	L	A	P	G	M	G	E	D	G	E	L	E	E	T	G	V	P	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	L	V	T	A	W	L	G	R	H	G	I
Query Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	P	L	V	G	D	I	R	G	K	G	L	L	V	G	I	E	L	V	N	D	K	E	T	K	E	P	I	D	N	D	K	I	A	S	V	V	N	A	C	K	E	K	G	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	T							S	S	S										T	T	T	T																		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																					362	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
		569	570	.	.							.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	P	T	R	.	.	.	.	.	.	T	T	D	F	Q	I	M	F	L	F	S	M	G	V	T	R	G	K	W	G	T	L	V	N	T	L	C	S	F	K	R	H	Y
Query Conservation						.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	I	G	R	N	G	X	T	T	A	G	Y	N	N	I	L	T	L	A	P	P	L	V	I	S	S	E	E	I	A	F	V	I	G	T	L	K	T	A	X	E	R	I
Template Known Secondary structure							T	T	S	S	T	T											T	T																		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		407	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.