Job Description P28629 Confidence 99.67% Date Wed Jan 25 15:20:47 GMT 2012 Rank 158 Aligned Residues 315 % Identity 17% Template c3mebB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:aspartate aminotransferase; PDBTitle: structure of cytoplasmic aspartate aminotransferase from giardia2 lamblia Resolution 1.90 Å

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		202	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.									.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.			240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.				.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.																													.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.																													.	.	.
Query Sequence		D	H	T	G	A	F	G	E	S	E	K	Y	A	A	R	V	F	G	A	D	R	.	.	.	.	.	.	.	.	S	W	S	V	V	V	G	T	S	G	S	N	R	T	I	M	Q	.	.	A	C	M	T	D	N	D	V	V	V	V	D	R	N	C	H	K	S	I	E	Q	G	L	M	L	T	G	A	.	.	.	K
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.																													.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.																													.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	V	A	G	F	P	L	F	L	E	A	A	Q	F	L	M	F	G	K	D	S	K	A	A	Q	E	G	R	I	A	S	C	Q	S	L	S	G	T	G	S	L	H	I	G	F	E	F	L	H	L	W	M	P	K	A	E	F	Y	M	P	S	T	T	W	P	N	H	Y	G	I	Y	D	K	V	F	N	K	L	K	V
Template Known Secondary structure			T	T																T	T						T	T								S																		T	T							S	S			T												T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
		269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.			.	.	.	.	.	.	.	.				330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.	.									.	.	.
Query SS confidence																																																							.	.									.	.	.
Query Sequence		P	V	Y	M	V	P	S	R	N	R	Y	G	I	I	G	P	I	Y	P	Q	E	M	Q	P	E	T	L	Q	K	K	I	S	E	S	P	L	T	K	D	K	A	G	Q	K	P	S	Y	C	V	V	T	N	C	.	.	T	Y	D	G	V	C	Y	N	.	.	.	A	K	E	A	Q	D	L	L	E	K	T	S	D	R
Query Conservation																																																							.	.									.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.											.	.									.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	Y	K	E	Y	T	Y	L	R	K	D	G	E	L	.	.	.	.	.	.	E	I	D	F	S	N	T	K	K	D	I	Q	S	A	P	.	.	.	.	.	.	.	.	E	K	S	I	F	L	F	H	A	C	A	H	N	P	S	G	I	D	F	T	E	A	Q	W	K	E	L	L	P	I	M	K	E	K	K	H	I
Template Known Secondary structure									B		T	T	S		S	.	.	.	.	.	.	S	B												S		.	.	.	.	.	.	.	.	T	T							S	S	S		T	T	T																				T
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.							.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.									180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.
		344	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.			.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.	.																																.	.	.
Query SS confidence																																														.	.																																.	.	.
Query Sequence		L	H	F	D	E	A	W	Y	G	Y	A	R	F	N	P	I	Y	A	D	H	Y	A	M	R	G	E	P	G	D	H	N	G	P	T	V	F	A	T	H	S	T	H	K	L	.	.	L	N	A	L	S	Q	A	S	Y	I	H	V	R	E	G	R	G	A	I	N	F	S	R	F	N	Q	A	Y	M	M	H	.	.	.
Query Conservation																																														.	.																																.	.	.
Alig confidence								.																						.	.															.	.																	.	.														.	.	.
Template Conservation								.																						.	.																																	.	.
Template Sequence		A	F	F	D	S	A	.	Y	Q	G	F	A	T	G	S	F	E	A	D	A	F	A	V	R	M	F	V	D	.	.	A	G	V	E	V	L	V	A	Q	S	F	S	K	N	F	G	L	Y	G	E	R	I	G	C	L	H	V	V	H	A	G	V	.	.	E	G	S	V	E	K	N	K	A	L	S	A	A	M	V	S
Template Known Secondary structure							S	.		T	T	T	S	S	S						T									.	.		T										T	T	T	S			G	G	G											S		.	.	S	S	S
Template Predicted Secondary structure								.																						.	.																																	.	.
Template SS confidence
		217	.	.	220	.	.		.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.			.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.			.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
										419	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.							.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	A	T	T	S	P	L	Y	A	I	C	A	S	N	D	V	A	V	.	.	.	.	.	.	S	M	M	D	G	N	S	G	L	S	L	T	Q	E	V	I	D	E	A	V	D	F	R	Q	A	M	A	R	L	Y	K	E	F	T	A	D	G	S	W	F	F	K	P	W	N	K	E	V	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.							.																																								.	.	.
Template Conservation																																							.																																								.	.	.
Template Sequence		G	M	T	L	Q	I	R	K	T	W	S	M	S	A	I	H	G	A	Y	I	V	Q	V	I	V	H	D	K	R	L	L	Q	M	F	Y	D	N	.	V	K	E	M	S	A	R	I	H	R	M	R	S	L	L	H	A	S	L	A	K	R	K	T	P	G	P	G	S	K	G	T	W	D	H	I	L	T	A	.	.	.
Template Known Secondary structure									T	T	T	S	S														T	S											.																						T	T				S	T	T	T	T			T						.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																							.																																								.	.	.
Template SS confidence
		292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.		.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.
		485	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	D	P	Q	T	G	K	T	Y	D	F	A	D	A	P	T	K	L	L	T	T	V	Q	D	C	W	V	M	H	P	G	E	S	W	H	G	F	K	D	I	P	D	N	W	S	M	L	D	P	I	K	V	S	I	L	A	P	G	M	G	E	D	G	E	L	E	E	T	G	V	P	A	A	L	V	T	A	W	L	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	G	M	F	T	F	T	G	L	T	P	E	H	V	D	Y	L	K	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																															368	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
		565	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.		.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.
Query SS confidence																						.
Query Sequence		R	H	G	I	V	P	T	R	T	T	D	F	Q	I	M	F	L	F	S	M	.	G	V	T	R	G	K	W	G	T	L	V	N	T	L	C	S	F	K	R	H	Y
Query Conservation																						.
Alig confidence													.	.	.	.	.					.
Template Conservation													.	.	.	.	.
Template Sequence		K	W	S	I	Y	L	V	K	A	G	G	.	.	.	.	.	R	M	S	M	C	G	L	T	E	S	N	C	D	Y	V	A	E	A	I	H	D	A	V	T	K	L
Template Known Secondary structure								B	T	G	G	G	.	.	.	.	.				G	G	G			T	T	T															S
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.
Template SS confidence
		387	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.						.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.