Job Description P28629 Confidence 99.94% Date Wed Jan 25 15:20:47 GMT 2012 Rank 23 Aligned Residues 366 % Identity 16% Template c3mc6C_ PDB info PDB header:lyase Chain: C: PDB Molecule:sphingosine-1-phosphate lyase; PDBTitle: crystal structure of scdpl1 Resolution 3.15 Å

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		142	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.						170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.
Query Sequence		L	F	S	A	L	M	K	Y	S	D	I	H	E	Y	S	W	A	A	P	G	H	Q	G	G	V	G	F	T	.	.	.	.	.	K	T	P	A	G	R	F	Y	H	D	Y	Y	G	E	N	L	F	R	T	D	M	G	I	E	R	T	S	L	G	S	L	L	D	H	T	G	A	F	G	E	S	E	K	Y	A	A	R
Query Conservation																														.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	I	E	E	L	N	K	L	N	D	L	I	P	H	T	Q	W	K	E	G	K	V	S	G	A	V	Y	H	G	G	D	D	L	I	H	L	Q	T	I	A	Y	E	K	Y	C	V	A	N	Q	L	H	P	D	V	F	P	A	V	R	K	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	S	E	V	V	S	M	V	L	R
Template Known Secondary structure												S	S					G	G	G	T		B	S	S	S		S																	T	S	S		B	T	T		T	T	T								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.										.	210	.	.	.	.	.	.	.	.
		217	.	.	220	.	.	.	.				.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.									.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	F	G	A	D	R	S	W	.	.	.	S	V	V	V	G	T	S	G	S	N	R	T	I	M	Q	A	C	M	T	.	.	.	.	.	.	.	.	D	N	D	V	V	V	V	D	R	N	C	H	K	S	I	E	Q	G	L	M	L	T	G	A	K	P	V	Y	M	V	P	S	R	N	R	Y	G	I	I	G	P	I
Query Conservation										.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	F	N	A	P	S	D	T	G	C	G	T	T	T	S	G	G	T	E	S	L	L	L	A	C	L	S	A	K	M	Y	A	L	H	H	R	G	I	T	E	P	E	I	I	A	P	V	T	A	H	A	G	F	D	K	A	A	Y	Y	F	G	M	K	L	R	H	V	E	L	D	P	T	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			T	T			T	T	T							S	S																				S			S	S							T	T	S											S									B		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290
		286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.		.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.
Query SS confidence																																								.
Query Sequence		Y	P	Q	E	M	Q	P	E	T	L	Q	K	K	I	S	E	S	P	L	T	K	D	K	A	G	Q	K	P	S	Y	C	V	V	T	N	C	T	Y	.	D	G	V	C	Y	N	A	K	E	A	Q	D	L	L	E	K	T	S	D	R	L	H	F	D	E	A	W	Y	G	Y	A	R	F	N	P	I	Y	A	D	H	Y
Query Conservation																																								.
Alig confidence		.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.																																						.
Template Conservation		.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.
Template Sequence		.	T	Y	Q	V	D	L	G	K	V	K	K	F	I	N	K	N	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	L	L	V	G	S	A	P	N	F	P	H	G	I	A	D	D	I	E	G	L	G	K	I	A	Q	K	Y	K	L	P	L	H	V	D	S	C	L	G	S	F	I	V	S	F	M	E	K	.	A	G	Y
Template Known Secondary structure		.	T		S	B		T	T	T	T	G	G	G			S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T		T	T	T					S		T	T	T	T	T					T	T							T	T	T	T					G	G	G	T	T	.	T	T
Template Predicted Secondary structure		.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.
Template SS confidence
			291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.											.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.		.	.	.
		365	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.													.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	M	R	G	E	P	G	D	H	N	G	P	T	V	F	A	T	H	S	T	H	K	L	L	N	A	L	S	Q	A	S	Y	I	H	V	R	E	G	R	G	A	I	N	F	S	R	F	N	Q	A	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	M	H	A	T	T	S	P	L	Y	A	I	C	A	S	N	D
Query Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																					.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	N	L	P	L	L	D	F	R	V	P	G	V	T	S	I	S	C	D	T	H	K	Y	G	F	A	P	K	G	S	S	V	I	M	Y	.	.	.	.	.	.	R	N	S	D	L	R	M	H	Q	Y	Y	V	N	P	A	W	T	G	G	L	Y	G	S	P	T	L	A	G	S	R	P	G	A	I	V	V	G	C	W
Template Known Secondary structure			S					S	T	T	S	T	T								T	T	T	T	T				S	S							.	.	.	.	.	.	S	S					T	T	T	S			B	T	T		T	T	S		B			S	S	S		S	S		B
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		359	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.							.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.
		433	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.		.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.
Predicted Secondary structure																																	.
Query SS confidence																																	.
Query Sequence		V	A	V	S	M	M	D	G	N	S	G	L	S	L	T	Q	E	V	I	D	E	A	V	D	F	R	Q	A	M	A	R	.	L	Y	K	E	F	T	A	D	G	S	W	F	F	K	P	W	N	K	E	V	V	T	D	P	Q	T	G	K	T	Y	D	F	A	D	A	P	T	K	L	L	T	T	V	Q	D	C	W	V
Query Conservation																																	.
Alig confidence																																	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	T	M	V	N	M	G	E	N	G	Y	I	E	S	C	Q	E	I	V	G	A	A	M	K	F	K	K	Y	I	Q	E	N	I	P	D	L	D	I	M	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																																	S		T	T					S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		433	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
		512	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	H	P	G	E	S	W	H	G	F	K	D	I	P	D	N	W	S	M	L	D	P	I	K	V	S	I	L	A	P	G	M	G	E	D	G	E	L	E	E	T	G	V	P	A	A	L	V	T	A	W	L	G	R	H	G	I	V	P	T	R	T	T	D	F	Q	I	M	F	L	F	S	M	G	V	T	R	G	K	W
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	P	R	Y	S	V	I	S	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	K	T	L	N	I	H	E	L	S	D	R	L	S	K	K	G	W	H	F	N	A	L	Q	K	P	V	A	L	H	M	A	F	T	R	L	S	A	H	V	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	T	T										T	T	T		B						S	S									T	T	T	T		T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																						473	.	.	.	.	.	.	480	.										.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.
		592	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	T	L	V	N	T	L	C	S	F	K	R	H	Y	D	A	N	T	P	L
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		D	E	I	C	D	I	L	R	T	T	V	Q	E	L	K	S	E	D	K	L
Template Known Secondary structure																T				T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		524	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.