Job Description P28629 Confidence 99.84% Date Wed Jan 25 15:20:47 GMT 2012 Rank 67 Aligned Residues 326 % Identity 15% Template c3lwsF_ PDB info PDB header:lyase Chain: F: PDB Molecule:aromatic amino acid beta-eliminating PDBTitle: crystal structure of putative aromatic amino acid beta-2 eliminating lyase/threonine aldolase. (yp_001813866.1) from3 exiguobacterium sp. 255-15 at 2.00 a resolution Resolution 2.00 Å

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		156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	W	A	A	P	G	H	Q	G	G	V	G	F	T	K	T	P	A	G	R	F	Y	H	D	Y	Y	G	E	N	L	F	R	T	D	M	G	I	E	R	T	S	L	G	S	L	L	D	H	T	G	A	F	G	E	S	E	K	Y	A	A	R	V	F	G	A	D	R	S	W	S	V	V	V	G	T	S	G	S	N	R
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	G	Q	I	S	G	H	G	K	R	N	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	L	K	T	A	F	A	A	V	A	D	E	X	A	S	D	Q	Y	G	T	G	A	I	I	E	P	F	E	Q	K	F	A	D	V	L	G	X	D	D	A	V	F	F	P	S	G	T	X	A	Q	Q	V
Template Known Secondary structure		S			S	S	B	S	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T	T	S		T	T						T	T			T	T												T	T		S						S
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.																.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
		236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.		.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.				.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure													.																.	.	.
Query SS confidence													.																.	.	.
Query Sequence		T	I	M	Q	A	C	M	T	D	N	D	.	V	V	V	V	D	R	N	C	H	K	S	I	E	Q	G	.	.	.	L	M	L	T	G	A	K	P	V	Y	M	V	P	S	R	N	R	Y	G	I	I	G	P	I	Y	P	Q	E	M	Q	P	E	T	L	Q	K	K	I	S	E	S	P	L	T	K	D	K	A	G	Q
Query Conservation													.																.	.	.
Alig confidence													.																.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	L	R	I	W	S	D	E	T	D	N	R	T	V	A	Y	H	P	L	C	H	L	E	I	H	E	Q	D	G	L	K	E	L	H	P	I	E	T	I	L	V	G	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	R	L	X	T	L	D	E	I	K	A	L	P	D	I	A	C	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure											T								T	T						S	S	T	T						S	S							S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S												S		S		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120												.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.				.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.
Query Sequence		K	P	S	Y	C	V	V	T	N	C	T	Y	D	G	V	C	.	.	.	Y	N	A	K	E	A	Q	D	L	L	E	K	T	S	D	R	L	H	F	D	E	A	W	Y	G	Y	A	R	F	N	P	I	Y	A	D	H	Y	A	M	R	G	E	P	G	D	H	N	G	P	T	V	F	A	T	H	S	T	H	K	L	L
Query Conservation																		.	.	.
Alig confidence		.	.															.	.	.																																		.											.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.																																																			.											.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	L	L	L	E	L	P	Q	R	E	I	G	G	V	A	P	A	F	S	E	L	E	T	I	S	R	Y	C	R	E	R	G	I	R	L	H	L	D	G	A	R	L	F	E	X	L	P	Y	Y	E	K	.	T	A	A	E	I	A	G	L	F	D	.	.	.	.	.	.	.	S	I	Y	I	S	F	Y	G	L	G
Template Known Secondary structure		.	.					S	S	B	G	G	G	T	S	B																		T								T	T									T		.							T	T		S	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.																																																			.											.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
				138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.		.	.	190	.	.	.	.	.	.	.								.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	A	L	S	Q	A	S	Y	I	H	V	R	E	G	R	G	A	I	N	F	S	R	F	N	Q	A	Y	M	M	H	A	T	T	S	P	L	Y	A	I	C	A	S	N	D	V	A	V	S	M	M	D	G	N	S	G	L	S	L	T	Q	E	V	I	D	E	A	V	D	F	R	Q	A	M	A	R	L	Y	K	E	F
Query Conservation
Alig confidence				.	.											.	.	.																																					.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.											.	.	.																																					.	.	.	.	.
Template Sequence		G	I	.	.	A	G	A	I	L	A	G	P	A	A	.	.	.	F	C	Q	T	A	R	I	W	K	R	R	Y	G	G	D	L	I	S	L	Y	P	Y	I	V	S	A	D	Y	Y	Y	E	L	R	K	D	R	.	.	.	.	.	X	G	Q	Y	Y	E	Q	A	K	Q	L	A	E	Q	F	N	A	L	P	G	V	H
Template Known Secondary structure			S	.	.	S										.	.	.													T				S																	T	T		.	.	.	.	.																		S	T	T
Template Predicted Secondary structure				.	.											.	.	.																																					.	.	.	.	.
Template SS confidence
		209	210			.	.	.	.	.	.	.	.	.	220				.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.						.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.
		469	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	A	D	G	S	W	F	F	K	P	W	N	K	E	V	V	T	D	P	Q	T	G	K	T	Y	D	F	A	D	A	P	T	K	L	L	T	T	V	Q	D	C	W	V	M	H	P	G	E	S	W	H	G	F	K	D	I	P	D	N	W	S	M	L	D	P	I	K	V	S	I	L	A	P	G	M	G	E	D	G	E
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	T	P	E	V	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	S	N	X	F	H	L	H	F	D	G	Q	A	A	D	I	S
Template Known Secondary structure				S	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S								S
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		279	280	.	.	.	.																																																										.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.
		549	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570				.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.						.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Predicted Secondary structure																								.	.	.																.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.																.	.	.	.	.
Query Sequence		L	E	E	T	G	V	P	A	A	L	V	T	A	W	L	G	R	H	G	I	V	P	.	.	.	T	R	T	T	D	F	Q	I	M	F	L	F	S	M	G	.	.	.	.	.	V	T	R	G	K	W	G	T	L	V	N	T	L	C	S
Query Conservation																								.	.	.																.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.																.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	.	.	.	.	.	.	.	.	K	L	E	Q	V	Q	E	E	T	G	L	G	F	V	G	Y	L	V	D	K	D	G	Y	C	S	T	E	I	S	V	G	D	A	Y	G	E	L	D	Q	Q	T	R	D	A	G	F	A	R	L	R	Q
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.													S		S						S	S								B						T	S
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		302									.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.