Job Description P28629 Confidence 99.88% Date Wed Jan 25 15:20:47 GMT 2012 Rank 45 Aligned Residues 308 % Identity 13% Template c3islA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:purine catabolism protein pucg; PDBTitle: crystal structure of ureidoglycine-glyoxylate aminotransferase (pucg)2 from bacillus subtilis Resolution 2.06 Å

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		205	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220			.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.			.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
Predicted Secondary structure																		.	.																																				.	.
Query SS confidence																		.	.																																				.	.
Query Sequence		G	A	F	G	E	S	E	K	Y	A	A	R	V	F	G	A	.	.	D	R	S	W	S	V	V	V	G	T	S	G	S	N	R	T	I	M	Q	A	C	M	T	D	N	D	V	V	V	V	D	R	N	C	H	.	.	K	S	I	E	Q	G	L	M	L	T	G	A	K	P	V	Y	M	V	P	S	R	N	R	Y	G
Query Conservation																		.	.																																				.	.
Alig confidence																		.	.																																				.	.																								.	.
Template Conservation																																																																																.	.
Template Sequence		G	I	M	N	E	T	M	E	M	L	R	E	L	F	Q	T	K	N	R	W	A	Y	P	I	D	G	T	S	R	A	G	I	E	A	V	L	A	S	V	I	E	P	E	D	D	V	L	I	P	I	Y	G	R	F	G	Y	L	L	T	E	I	A	E	R	Y	G	A	N	V	H	M	L	E	C	E	W	G	T	.	.
Template Known Secondary structure															T	T				S							S																T	T								S	S													T	T										T	T		.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Template SS confidence
		46	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.
		281	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.
Query SS confidence																																									.
Query Sequence		I	I	G	P	I	Y	P	Q	E	M	Q	P	E	T	L	Q	K	K	I	S	E	S	P	L	T	K	D	K	A	G	Q	K	P	S	Y	C	V	V	T	.	N	C	T	Y	D	G	V	C	Y	N	A	K	E	A	Q	D	L	L	E	K	T	S	D	R	L	H	F	D	E	A	W	Y	G	Y	A	R	F	N	P	I
Query Conservation																																									.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.									.																																					.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.																																														.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	V	F	D	P	E	D	I	I	R	E	I	K	K	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	P	K	I	V	A	M	V	H	G	E	T	S	T	G	R	I	H	P	L	K	A	I	G	E	A	C	R	T	E	D	A	L	F	I	V	D	A	V	A	T	I	G	G	C	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.			S						S			T	T	T	T															T	T								T	T	T	T	T	T	S	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.																																														.	.	.	.
Template SS confidence
										124	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.										.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.
		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	A	D	H	Y	A	M	R	G	E	P	G	D	H	N	G	P	T	V	F	A	T	H	S	T	H	K	L	L	N	A	L	S	Q	A	S	Y	I	H	V	R	E	G	R	G	A	I	N	F	S	R	F	N	Q	A	Y	M	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.											.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.											.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	E	V	K	V	D	E	W	K	I	D	.	.	.	.	.	.	.	A	A	I	G	G	T	Q	K	C	L	S	V	P	S	G	M	A	P	I	T	.	.	.	.	.	.	.	Y	N	E	R	V	A	D	V	I	A	A	R	N	R	P	I	T	S	N	Y	F	D	L	S	Q	L	E	D	Y	W	S	E	R	R
Template Known Secondary structure		.	.				T	T	T	T	T		S	.	.	.	.	.	.	.						S	S	S	T	T				S	S						.	.	.	.	.	.	.											T						S		S	T	T									T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.											.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
				183	.	.	.	.	.	.	190	.	.								.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.								.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
		418	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	A	T	T	S	P	L	Y	A	I	C	A	S	N	D	V	A	V	S	M	M	D	G	N	S	G	L	S	L	T	Q	E	V	I	D	E	A	V	D	F	R	Q	A	M	A	R	L	Y	K	E	F	T	A	D	G	S	W	F	F	K	P	W	N	K	E	V	V	T	D	P	Q	T	G	K	T	Y	D	F	A	D
Query Conservation
Alig confidence																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	N	H	H	T	E	A	T	T	M	L	Y	A	L	R	E	G	V	R	L	V	L	E	E	G	L	E	T	R	F	E	R	H	R	H	H	E	A	A	L	A	A	G	I	K	A	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				S	S																																											T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
		498	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.					.
Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.
Query SS confidence																																																																													.	.	.	.
Query Sequence		A	P	T	K	L	L	T	T	V	Q	D	C	W	V	M	H	P	G	E	S	W	H	G	F	K	D	I	P	D	N	W	S	M	L	D	P	I	K	V	S	I	L	A	P	G	M	G	E	D	G	E	L	E	E	T	G	V	P	A	A	L	V	T	A	W	L	G	R	H	G	I	V	P	T	R	.	.	.	.	T
Query Conservation																																																																													.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.								.							.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.								.							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	R	L	F	G	D	D	S	C	K	M	P	V	V	.	T	C	V	E	I	P	G	.	G	I	D	G	E	S	.	.	.	.	.	.	.	.	V	R	D	M	L	L	A	Q	F	G	I	E	I	A	S	S	F	G	P	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T			B		S		G	G	G	B		T	T		.							T	.	T						.	.	.	.	.	.	.	.														B				S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.								.							.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																								312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.		.	.	.	330	.	.	.		.	.	.	.	.	.									340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		574	.	.	.	.	.	580		.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.
Query SS confidence									.
Query Sequence		T	D	F	Q	I	M	F	.	L	F	S	M	G	V	T	R	G	K	W	G	T	L	V	N	T	L	C	S	F	K	R	H	Y	D	A	N	T	P	L	A	Q	V	M	P
Query Conservation									.
Alig confidence									.
Template Conservation
Template Sequence		A	G	K	I	W	R	I	G	T	M	G	Y	S	C	R	K	E	N	V	L	F	V	L	A	G	L	E	A	V	L	L	R	H	N	A	G	I	E	A	G	K	A	L	Q
Template Known Secondary structure		T	T	T								G	G	G		S																		T	T					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.